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細胞内シグナル伝達ネットワークの光制御に向けた分子創成

Research Project

Project/Area Number 15J06657
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Biophysics
Research InstitutionNagoya Institute of Technology

Principal Investigator

吉田 一帆  名古屋工業大学, 工学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2015-04-24 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥2,800,000 (Direct Cost: ¥2,800,000)
Fiscal Year 2017: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2016: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywordsオプトジェネティクス / シグナル伝達 / ロドプシン / 酵素 / GPCR / 環状ヌクレオチド / 機能創成 / 生物物理 / 蛍光イメージング / バイオ
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、光遺伝学の新展開として「イオンを動かして細胞を興奮・抑制させる」から「細胞内シグナル伝達系を動かす」ツールの開発を目指した。
①これまでのキメラばプロトン輸送型のロドプシンを鋳型としてきたが、より大きなイオンを運ぶ分子の方がヘリックスの開閉が大きく、Gsタンパク質が接近しやすくなると期待される。そこで、ナトリウムイオン輸送型およびクロライドイオン輸送型ロドプシンを鋳型とした新規キメラ分子を作製した。興味深いことに、活性の有無は鋳型として用いるロドプシンの種類に依存することが分かった。赤外分光測定の結果、活性の無いキメラでは振動強度が野生型とほぼ同じであったが、活性の有るキメラでは野生型よりもタンパク質骨格の変化が大きくなっていた。すなわち、ヘリックス大きな開閉により相互作用部位が露出し、光依存的なGs活性につながったと考えられる。
これらの成果は論文発表しており、創成したキメラ分子は新しい光遺伝学ツールとして多くの疾患の発現メカニズムの研究にも応用できると期待される。
②微生物型ロドプシンとホスホジエステラーゼ(PDE)が連なった新規酵素型ロドプシン(Rh-PDE)について、より詳細な酵素活性を評価した。基質濃度依存性を調べたところ、Rh-PDEの酵素反応はミカエリスメンテンの速度論に従うことが分かった。さらに、変異体解析によりレチナール近傍の嵩高いアミノ酸が光依存的な酵素活性を示すのに重要であることが明らかとなった。
Rh-PDEは暗状態でも基質分解活性を持つため、ツールとして用いるにはこの構成活性の最小化が必要である。変異体スクリーニングを行ったところ、構成活性が有意に減少し、かつ光依存的なPDE活性を保持した変異体を創り出すことができた。
より精密な光スイッチ機能の実現を目指すことで、細胞内シグナル伝達の光操作技術の応用に役立ち、生命現象の解明に役立つと期待される。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2017 Annual Research Report
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2017 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results,  Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] Guelph大学(カナダ)

    • Related Report
      2017 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] Guelph大学(カナダ)

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Journal Article] Chimeric microbial rhodopsins for optical activation of Gs-proteins2017

    • Author(s)
      K. Yoshida
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: 14 Issue: 0 Pages: 183-190

    • DOI

      10.2142/biophysico.14.0_183

    • NAID

      130006252951

    • ISSN
      2189-4779
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A unique choanoflagellate enzyme rhodopsin exhibits light- dependent cyclic nucleotide phosphodiesterase activity2017

    • Author(s)
      Kazuho Yoshida, Satoshi P. Tsunoda, Leonid S. Brown, Hideki Kandori
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry

      Volume: 292 Issue: 18 Pages: 7531-7541

    • DOI

      10.1074/jbc.m117.775569

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Characterization of a novel enzyme rhodopsin which contains a C-terminal cyclic nucleotide phosphodiesterase2017

    • Author(s)
      Kazuho Yoshida, Satoshi Tsunoda, Leonid S. Brown, Hideki Kandori
    • Organizer
      International Symposium on Biophysics of Rhodopsins
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A novel enzyme rhodopsin with light-dependent cyclic nucleotide phosphodiesterase activity2017

    • Author(s)
      Kazuho Yoshida, Satoshi Tsunoda, Leonid S. Brown, Hideki Kandori
    • Organizer
      The 55th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Rh-PDE, a potential optogenetics tool for modulating intracellular cyclic-nucleotide levels2017

    • Author(s)
      Kazuho Yoshida
    • Organizer
      9th Optogenetics Research Society Japan International Symposium
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Characterization of a novel enzyme rhodopsin2016

    • Author(s)
      吉田 一帆
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場
    • Year and Date
      2016-11-25
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Optical activation of G-protein by microbial rhodopsin chimera2016

    • Author(s)
      吉田 一帆
    • Organizer
      Gordon Research Conference on "Photosensory Receptors & Signal Transduction"
    • Place of Presentation
      Galveston, USA
    • Year and Date
      2016-01-24
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Optical activation of G-protein by microbial rhodopsin chimera2016

    • Author(s)
      吉田 一帆
    • Organizer
      Gordon Research Seminar on "Photosensory Receptors & Signal Transduction"
    • Place of Presentation
      Galveston, USA
    • Year and Date
      2016-01-23
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Toward optogenetics applications : microbial rhodopsin chimera2015

    • Author(s)
      吉田 一帆
    • Organizer
      7th International Symposium on Optogenetics: Neural Circuits and Neuromodulations
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2015-12-04
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Construction of chimeric proteins for optical control of Gs-protein activity2015

    • Author(s)
      吉田 一帆
    • Organizer
      The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      金沢
    • Year and Date
      2015-09-13
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 光受容キメラタンパク質によるGタンパク質の光制御2015

    • Author(s)
      吉田 一帆
    • Organizer
      第12回GPCR研究会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2015-05-15
    • Related Report
      2015 Annual Research Report

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Published: 2015-11-26   Modified: 2024-03-26  

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