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ラットSec6/8複合体の構造・機能解析による,膜融合制御機構の解明

Research Project

Project/Area Number 16770093
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Functional biochemistry
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

深井 周也  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (10361792)

Project Period (FY) 2004 – 2005
Project Status Completed (Fiscal Year 2005)
Budget Amount *help
¥3,700,000 (Direct Cost: ¥3,700,000)
Fiscal Year 2005: ¥1,800,000 (Direct Cost: ¥1,800,000)
Fiscal Year 2004: ¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
KeywordsX線結晶構造解析 / 小胞輸送 / 電子顕微鏡 / 繋留因子 / 開口放出 / 膜融合 / small GTPase
Research Abstract

オルガネラ間の物質輸送は小胞を介して行われる.目的の部位に到達した小胞は,標的膜と融合することによって積荷を受け渡す.繋留因子は,膜融合の初期段階で,小胞とその標的膜とを特異的に繋留することによって輸送の特異性を保証する.繋留因子は,3-8個のサブユニットから構成されるタンパク質複合体であり,低分子量GTPaseとの相互作用によってヌクレオチド依存的に制御されている.本研究では,開口放出で働くExocyst複合体の立体構造をX線結晶構造解析あるいは電子顕微鏡によって決定し,繋留の物理的機構とその制御機構を明らかにする.さらに,変異体をつかって細胞レベル,in vitroでの解析を行い,機能の面からの裏付けを行う.今年度は,ほ乳類のExocyst複合体の電子顕微鏡による解析と,酵母のExocyst複合体と結合するSec4のGEFであるSec2のX線結晶構造解析を行なった.Exocyst複合体は,ブタ脳あるいはラット脳から精製し,電子顕微鏡をつかって,酢酸ウラニルによる負染色像を観察した.当初は,粒子の均一性に問題があったが,調製方法を改善することにより,Exocyst複合体全体と考えられる約150Åの大きさの粒子を多く観察できるようになった.しかしながら,解離した複合体と考えられる約60Åと120Åの大きさの粒子が依然として残っており,解析の妨げとなっている.粒子の均一性を高めることにより,単粒子解析が可能な試料調製法を確立することが,今後の課題である.また,Exocyst複合体と相互作用するRalのGTPase活性化タンパク質を新規に同定した.in vitroでの活性測定を終え,現在は,細胞レベルでの解析を行なっている.一方,Sec2については,Sec4との相互作用領域の結晶構造を3.0Å分解能で決定した.Sec2のSec4結合領域は,200Åの長さをもつトロポミオシン様のcoiled coilを形成していた.現在,立体構造にもとづいてin vitroでの機能解析を進めている.

Report

(2 results)
  • 2005 Annual Research Report
  • 2004 Annual Research Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2005

All Journal Article (4 results)

  • [Journal Article] Roles of conserved amino acid sequence motifs in the SpoU (TrmH) RNA methyltransferase family2005

    • Author(s)
      Watanabe, K., Nureki, O., Fukai, S., Ishii, R., Okamoto, H., Yokoyama, S., Endo, Y., Hori, H.
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry 280

      Pages: 10368-10377

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Structural basis for lysidine formation by ATP pyrophsphatase accompanied with a lysine-specific loop and a tRNA-recognition domain.2005

    • Author(s)
      Nakanishi, K., Fukai, S., Ikeuchi, Y., Soma, A., Sekine, Y., Suzuki, T., Nureki, O.
    • Journal Title

      Proceedings of National Academy of Science U.S.A. 21

      Pages: 7487-7492

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Structural basis for anticodon recognition by methionyl-tRNA synthetase.2005

    • Author(s)
      Nakanishi, K., Ogiso, Y., Fukai, S., Nureki, O.
    • Journal Title

      Nature Structural and Molecular Biology 12

      Pages: 931-932

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Structural basis for relay to RNA mediated by hetrohexameric TusBCD complex.2005

    • Author(s)
      Numata, T., Fukai, S., Ikeuchi, Y., Suzuki, T., Nureki, O.
    • Journal Title

      Structure 4

      Pages: 357-366

    • Related Report
      2005 Annual Research Report

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Published: 2004-04-01   Modified: 2016-04-21  

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