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16H06279
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Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas ― Platforms for Advanced Technologies and Research Resources
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Institution | National Institute of Genetics |
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Principal Investigator |
KOHARA Yuji 情報・システム研究機構国立遺伝学研究所先端ゲノミクス推進センター, 特任教授 (70135292)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
Kato Kazuto 大阪大学, 大学院医学系研究科, 教授 (10202011)
Kawashima Minae 科学技術振興機構, バイオサイエンスデータベースセンター, 研究員 (00396706)
TOYODA Atsushi 国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 特任教授 (10267495)
Suzuki Yutaka 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (40323646)
MITSUI Jun 東京大学, 医学部附属病院, 特任准教授 (70579862)
Hayashi Tetsuya 九州大学, 大学院医学研究院, 教授 (10173014)
TOKINO Takashi 札幌医科大学, 医学部, 教授 (40202197)
Kurokawa Ken 国立遺伝学研究所, 情報研究系, 教授 (20343246)
Nakamura Yasukazu 国立遺伝学研究所, 情報研究系, 教授 (60370920)
Noguchi Hideki 情報・システム研究機構, データサイエンス共同利用基盤施設, 特任教授 (50333349)
IWASAKI WATARU 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (50545019)
Morishita Shinichi 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (90292854)
Asai Kiyoshi 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (30356357)
Kasahara Masahiro 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (60376605)
Ito Takehiko 東京工業大学, 生命理工学院, 教授 (90501106)
Yamada Takuji 東京工業大学, 生命理工学院, 准教授 (10437262)
KUHARA Satoshi 九州大学, 大学院農学研究院, 名誉教授 (00153320)
Takahashi Hiroki 千葉大学, 真菌医学研究センター, 准教授 (60548460)
Sakakibara Yasubumi 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (10287427)
HAMADA MICHIAKI 早稲田大学, 理工学術院, 教授 (00596538)
Takagi Toshihisa 富山国際大学, 学長 (30110836)
SESE JUN ヒューマノーム研究所, 代表取締役社長 (40361539)
Ogura Yoshitoshi 九州大学, 大学院医学研究院, 准教授 (40363585)
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| Research Collaborator |
Ida Ryuichi 滋賀大学, 学長 (40127543)
YAMAGATA Zentaro 山梨大学, 大学院総合研究部, 教授 (10210337)
Masui Toru 慶應義塾大学, 医学部臨床遺伝学センター, 教授 (50150082)
Muto Kaori 東京大学, 医科学研究所, 教授 (50345766)
Kodama Satoshi 京都大学, 大学院文学研究科, 准教授 (80372366)
Setoyama Koichi 京都府立医科大学, 大学院医学研究科, 教授 (00379075)
Kokado Minori 神戸薬科大学, 薬学部, 准教授 (20706650)
Ohashi Noriko 大阪大学, データビリティフロンティア機構, 特任助教 (50739430)
FUJIYAMA Asao 国立遺伝学研究所, 先端ゲノミクス推進センター, 特任教授 (60142311)
INOUE Ituro 国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 教授 (00192500)
Nakaoka Hirofumi 佐々木研究所, 附属研究所, 部長 (70611193)
Sugano Sumio 千葉大学, 未来医療教育研究機構, 特任教授 (60162848)
Tsuji Shoji 国際医療福祉大学, 医学部, 教授 (70150612)
Gotoh Yasuhiro 九州大学, 医学研究院, 助教 (20558358)
Nakamura Keiji 九州大学, 医学研究院, 助教 (60706216)
Ogura Yoshitoshi 久留米大学, 医学部, 教授 (40363585)
Okuno Miki 久留米大学, 医学部, 助教 (30814462)
Nakase Hiroshi 札幌医科大学, 医学部, 教授 (60362498)
SASAKI Yasushi 札幌医科大学, 医療人育成センター, 教授 (70322328)
IDOGAWA Masashi 札幌医科大学, 医学部, 講師 (00404749)
Tange Shoichiro 札幌医科大学, 医学部, 助教 (40571211)
Mori Hiroshi 国立遺伝学研究所, 情報研究系, 助教 (40610837)
OGASAWARA Osamu 国立遺伝学研究所, 生命情報・DDBJセンター, 特任准教授 (00435512)
Tanizawa Yasuhiro 国立遺伝学研究所, 情報研究系, 助教 (90836511)
Kondo Shinji 情報・システム研究機構, データサイエンス共同利用基盤施設, 特任准教授 (30415161)
kiryu hisanori 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)
Kajitani Rei 東京工業大学, 生命理工学院, 助教 (40756706)
TASHIRO Kosuke 九州大学, 農学研究院, 准教授 (00192170)
Frith Martin 産業技術総合研究所, 情報・人間工学領域, 上級主任研究員 (40462832)
HIRAKAWA Hideki かずさDNA研究所, ゲノム情報解析施設, 施設長 (80372746)
Suzuki Hiromu 札幌医科大学, 医学部, 教授 (20381254)
NOSHO KATSUHIKO 札幌医科大学, 医学部, 講師 (10597339)
KAI Masahiro 札幌医科大学, 医学部, 講師 (80260777)
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| Project Period (FY) |
2016 – 2021
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2021)
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| Budget Amount *help |
¥7,698,340,000 (Direct Cost: ¥5,921,800,000、Indirect Cost: ¥1,776,540,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,282,970,000 (Direct Cost: ¥986,900,000、Indirect Cost: ¥296,070,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,282,970,000 (Direct Cost: ¥986,900,000、Indirect Cost: ¥296,070,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,283,490,000 (Direct Cost: ¥987,300,000、Indirect Cost: ¥296,190,000)
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| Keywords | 次世代DNAシーケンサー / 新規ゲノム配列決定 / リシーケンシング / エピゲノム / RNA-Seq / 1細胞解析 / メタゲノム解析 / スーパーコンピューター / ゲノムアッセンブル / ゲノム多型 / メタゲノム / ゲノムアノテーション |
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| Outline of Final Research Achievements |
Our group has provided the state of art genome technologies, named PAGS Support, including de novo genome sequencing, variation analysis, epigenomics, RNA analysis, metagenome analysis and single cell analysis, to the projects that were selected from proposals based on KAKENHI projects. Thus far, we have provided PAGS Support to altogether 912 proposals that were selected from 1988 proposals. The proposals cover the most fields of life sciences, expanding to the fields of physical sciences, environmental studies and so on. Thus far 556 papers have been published as the outcome, which covers from biology to agriculture, medicine and pharmacy, from basic to applied sciences. Our group has also developed new technologies and algorithms to overcome the problems emerged in the PAGS Support, which are used in the other PAGS Support projects. This is a positive cycle and therefore our system becomes a very effective way for the promotion of biological sciences.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
ゲノム解析は生命科学のあらゆる分野で必須になっており、ゲノム解析技術の進展はますます速度を増している。新たな技術に適切に対応できないと国際競争に太刀打ちできなくなるが、現状では個々の研究室はもとより機関毎の対応も極めて困難である。そのような中で、先進ゲノム支援の支援活動により、多くの研究者、特に基礎研究分野の若手や、分野を超えて新たな挑戦をしようという研究者に最先端のゲノム解析技術の利用機会が与えられ、「できないことができるようになった」との感謝の声が届いている。基礎から応用まで多くの研究成果が出ており、研究推進の効果的な仕組みになった。
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