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Study on cold-adapted carbohydrate hydrolases according to the construction of simultaneous saccharification and fermentation process

Research Project

Project/Area Number 16K08116
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Environmental agriculture(including landscape science)
Research InstitutionOsaka Prefecture University

Principal Investigator

ueda mitsuhiro  大阪府立大学, 生命環境科学研究科, 准教授 (50254438)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 玉田 太郎  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 高崎量子応用研究所 東海量子ビーム応用研究センター, 上席研究員(定常) (50391248)
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2016: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywords低温適応酵素 / 糖質分解酵素 / 塩橋 / X線結晶構造解析 / バイオ燃料 / 連続糖化発酵法 / 低温適応性酵素 / マンナン分解酵素 / 生デンプン分解酵素 / ミミズ / セルラーゼ / アミラーゼ / バイオエネルギー / 糖質加水分解酵素 / 食品系廃棄物 / セルラーぜ / バイオエタノール / 低温糖化・低温発酵
Outline of Final Research Achievements

It revealed that the structure of Ef-Man is similar to that of the cold-active mannanase (Ca-Man) from Cryptopygus antarcticus. However, the optimum temperatures of Ef-Man and Ca-Man were 60°C and 35°C each other. The weakening of salt bridge is one of the methods by which high flexibility and catalytic efficiency can be conferred on cold-active enzymes at lower temperatures, but the weakening of salt bridge causes a decrease in thermostability. It is reported that the weakening of salt bridge can change property of enzymes.However, there is no report about the weakening of salt bridge . In this study, we applied site-directed mutagenesis combined with rational design to generate a cold-adapted enzyme with improved thermostability and catalytic efficiency at lower temperatures. We found the structure and function of the salt bridge weakening mutant Ef-Man (R302K). The specific activity of R302K was higher than that of WT at lower temperature.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

研究期間内に実施した研究及び成果:ミミズ由来のマンナン分解酵素の低温活性を向上させるために,塩橋に着目し構造と機能に関する研究を行った.塩橋を弱めることで低温活性を向上させるとともに,熱に安定な変異酵素を得ることに成功した.次にシマミミズ由来の2種類の生デンプン分解酵素を酵母を用いて異種宿主発現に成功した.さらにアミラーゼI の高次構造を明らかにした.
学術的意義や社会的意義:低温適応酵素の構造と機能を明らかにすれば,糖化プロセスにエネルギーを必要としないことからCO2ガスの排出量が減少する.低炭素社会構築に向けて今後さらに研究を発展させることは学術的・社会的意義がある.

Report

(4 results)
  • 2018 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2017 Research-status Report
  • 2016 Research-status Report
  • Research Products

    (55 results)

All 2018 2017 2016 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 1 results) Presentation (40 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 2 results) Remarks (5 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

  • [Journal Article] Gene cloning, expression and X-ray crystallographic analysis of a beta-Mannanase from Eisenia fetida2018

    • Author(s)
      Mitsuhiro Ueda, Yu Hirano, Hiroaki Fukuhara, Yuki Naka, Masami Nakazawa Tatsuji Sakamoto, Taro Tamada
    • Journal Title

      Enzyme and Microbial Technology

      Volume: 117 Pages: 15-22

    • DOI

      10.1016/j.enzmictec.2018.05.014

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Changes of trehalose content and trehalose-degrading activity during fruit-body formation and autolysis in Pleurotus sp.2018

    • Author(s)
      Alireza Arastoo, Masami Nakazawa , Tatsuji Sakamoto, Hitoshi Kobayashi, Kenji Ouchi, Satoshi Inatomi, Mitsuhiro Ueda
    • Journal Title

      Mycoscience

      Volume: 59 Issue: 6 Pages: 479-482

    • DOI

      10.1016/j.myc.2018.05.002

    • NAID

      40021718923

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  • [Journal Article] Heterologous expression and characterization of a cold-adapted endo-1,4-β-glucanase gene from Bellamya chinensis laeta2018

    • Author(s)
      MitsuhiroUeda, Yuta Konemori, Masami Nakazawaa, Tatsuji Sakamoto, Minoru Sakaguchi,
    • Journal Title

      Process Biochemistry

      Volume: 74 Pages: 28-34

    • DOI

      10.1016/j.procbio.2018.07.008

    • NAID

      120006719691

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  • [Journal Article] Changes of trehalose content and trehalose-degrading activity during fruit-body formation and autolysis in Pleurotus sp.2018

    • Author(s)
      Alireza ARASTOOa, Masami NAKAZAWAa, Tatsuji SAKAMOTOa, Hitoshi KOBAYASHIb, Kenji OUCHIb, Satoshi INATOMIb, Mitsuhiro UEDAa
    • Journal Title

      Mycoscience

      Volume: 印刷中

    • NAID

      40021718923

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      上田光宏,森本和樹,楠田瑞穂,中澤昌美,阪本龍司,坂口 実,小林 仁,大内謙二,稲富 聡
    • Journal Title

      日本きのこ学会誌,

      Volume: 25 Pages: 2017-10

    • NAID

      130007702295

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      櫻井俊輔,中澤昌美,阪本龍司,深田はるみ,上田光宏
    • Journal Title

      キチン・キトサン研究

      Volume: 23 Pages: 17-23

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      Mitsuhiro Ueda, Takashi Shioyama, Kei Nakadoi, Masami Nakazawa, Tatsuji Sakamotoa, Takeo Iwamotob, Minoru Sakaguchic
    • Journal Title

      Int J Biol. Macromol

      Volume: - Pages: 1648-1655

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2017.03.140

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    • Author(s)
      M.Ueda, T. Maruyama, K. Kawasaki, M. Nakazawa and M. Sakaguchi
    • Journal Title

      Mol. Biotechnol.

      Volume: 58 Issue: 4 Pages: 241-250

    • DOI

      10.1007/s12033-016-9922-5

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      堤 楽,中澤昌美,阪本龍司,楠田瑞穂,小林 仁,大内謙二,稲富 聡,上田光宏
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      第3回次世代生物研究会
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      第3回次世代生物研究会
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      楠田瑞穂,寺下隆夫,上田光宏
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  • [Presentation] ヒラタケ属 (Pleurotus sp.) きのこ子実体の自己消化におけるトレハラーゼに関する研究2018

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      舘村 仁美, アラスト・アリレザ , 中澤 昌美, 阪本 龍司 , 楠田 瑞穂,小林 仁, 大内 謙二, 稲富 聡, 上田 光宏
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      日本きのこ学会第22回大会
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      Hitomi Tachimura, Kei Nakadoi, Shunsuke Sakurai, M. Nakazawa, T. Sakamoto, Mitsuhiro Ueda
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      第14回キチン・キトサン国際学会 第12回アジア太平洋キチン・キトサンシンポジウム 第32回日本キチン・キトサン学会大会
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      Y. Naka, Y. Hirano, M. Nakazawa, T. Sakamoto, T. Tamada, M. Ueda (中裕規君:Student Poster Awardを受賞)
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      第14回キチン・キトサン国際学会 第12回アジア太平洋キチン・キトサンシンポジウム 第32回日本キチン・キトサン学会大会
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      Mitsuhiro Ueda
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      アラストアリレザ,中澤昌美,阪本龍司,小林 仁,大内謙二,稲富聡,上田光宏
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  • [Presentation] ヒラタケ子実体の自己消化におけるトレハラーゼに関する研究2017

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      アラストアリレザ,中澤昌美,阪本龍司,小林 仁,大内謙二,稲富聡,上田光宏
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      楠田瑞穂,寺下隆夫,上田光宏
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      舘村仁美,中澤昌美,阪本龍司,小林 仁,大内謙二,稲富聡,上田光宏
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      アラストアリレザ,中澤昌美,阪本龍司,小林 仁,大内謙二,稲富聡,上田光宏
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      アラストアリレザ,中澤昌美,阪本龍司,楠田瑞穂,小林 仁,大内謙二,稲富 聡,上田光宏
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      上田光宏
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      中 裕規,平野 優,中澤 昌美,阪本 龍司,玉田 太郎,上田 光宏
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      中 裕規,平野 優,中澤 昌美,阪本 龍司,玉田 太郎,上田 光宏
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      2017年度生命科学系学会合同年次大会
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      アラスト アリレザ,中澤 昌美,阪本 龍司,楠田 瑞穂, 小林 仁,大内 謙二,稲富 聡,上田 光宏
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
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      平野 優、福原宏章、有木真吾、中裕規、上田光宏、玉田 太郎
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      2016年度日本結晶学会大会
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      茨城県立県民文化センター
    • Year and Date
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      Mitsuhiro Ueda, Kei Nakadoi, Takashi Shioyama, Masami Nakazawa, Tatsuji Sakamoto, Yoshiyuki Ogata, Minoru Sakaguchi
    • Organizer
      11TH ASIA PACIFIC CHITIN AND CHITOSAN SYMPOSIUM & 5TH INDIAN CHITIN AND CHITOSAN SOCIETY SYMPOSIUM
    • Place of Presentation
      kochin, India
    • Year and Date
      2016-09-28
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      アラストアリレザ,中澤昌美,阪本龍司,小林 仁,大内謙二,稲富聡,上田光宏
    • Organizer
      日本きのこ学会
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      静岡県男女共同参画センター「あざれあ」
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      2016-09-07
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      楠田瑞穂,寺下隆夫,上田光宏
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      日本きのこ学会
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      静岡県男女共同参画センター「あざれあ」
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      2016-09-07
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      日本キチン・キトサン学会
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      2016-08-18
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  • [Presentation] ミミズに学ぶバイオ燃料生産2016

    • Author(s)
      上田光宏
    • Organizer
      積水化学 自然に学ぶものづくりフォーラム 2016
    • Place of Presentation
      積水化学京都研究所
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      2016 Research-status Report
    • Invited
  • [Remarks] 次世代生物研究会

    • URL

      https://sites.google.com/site/jisedaiseibutukenkyuukai/

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      2018 Annual Research Report
  • [Remarks] Researchmap_上田光宏

    • URL

      https://researchmap.jp/read0043892/

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      2018 Annual Research Report
  • [Remarks] 量子科学技術研究開発機構(QST)  構造生物学研究グループ 玉田太郎

    • URL

      https://www.qst.go.jp/site/taka/2172.html

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Remarks] Researchmap_玉田太郎

    • URL

      https://researchmap.jp/read0208855/

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      2018 Annual Research Report
  • [Remarks] 次世代生物研究会

    • URL

      https://sites.google.com/site/jisedaiseibutu1/home/puroguramu

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      2016 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 低温活性が改善された酵素及びその作成方法2018

    • Inventor(s)
      上田光宏,平野 優,玉田太郎
    • Industrial Property Rights Holder
      国立研究開発法人 量子科学技術研究開発機構(QST)
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2017-219234
    • Filing Date
      2018
    • Acquisition Date
      2018
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 低温活性が改善された酵素及びその製造方法2017

    • Inventor(s)
      玉田太郎,平野優,上田光宏
    • Industrial Property Rights Holder
      玉田太郎,平野優,上田光宏
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2017-219234
    • Filing Date
      2017
    • Related Report
      2017 Research-status Report

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Published: 2016-04-21   Modified: 2020-03-30  

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