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Production of 6-nylon monomer by metabolic engineering

Research Project

Project/Area Number 16K14493
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Biofunction/Bioprocess
Research InstitutionUniversity of Hyogo

Principal Investigator

Negoro Seiji  兵庫県立大学, 工学研究科, 教授 (90156159)

Research Collaborator TAKEO masahiro  
KATO daiichiro  
TAKEHARA ikki  
FUJII tsubasa  
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Keywordsナイロン / 代謝工学 / 6アミノヘキサン酸 / 6-アミノヘキサン酸 / アジピン酸 / アミノトランスフェラーゼ / ピリドキサルリン酸 / 4-アミノ酪酸 / 6-アミノヘキサン酸 / 代謝経路 / Arthrobacter / 廃棄物再資源化 / 環境材料 / バイオテクノロジー
Outline of Final Research Achievements

Arthrobacter sp. strain KI72 grows on a 6-aminohexanoate oligomer as a sole source of carbon and nitrogen. We cloned the two genes, nylD1 and nylE1, responsible for 6-aminohexanoate metabolism. We amplified the DNA fragments that encode these genes by polymerase chain reaction using a synthetic primer DNA homologous to the 4-aminobutyrate metabolic enzymes. We inserted the amplified DNA fragments into the expression vector pColdI in Escherichia coli, purified the His-tagged enzymes to homogeneity, and performed biochemical studies. We confirmed that 6-aminohexanoate aminotransferase (NylD1) catalyzes the reaction of 6-aminohexanoate to adipate semialdehyde using alpha-ketoglutarate, pyruvate and glyoxylate as amino acceptors, generating glutamate, alanine and glycine, respectively. For further metabolism, adipate semialdehyde dehydrogenase (NylE1) catalyzes the oxidative reaction of adipate semialdehyde to adipate using NADP+ as a cofactor.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究は、繊維・プラスチックとして広く用いられているナイロンについて、6ナイロンの構成単位である6-アミノヘキサン酸の微生物代謝経路の解明、関連酵素群の取得と機能改良について、検討を行ったものである。特に、6-アミノヘキサン酸の代謝については、以前の研究例がなかったが、モノマー代謝の初段階に関与する2種類の酵素(アミノ基転移酵素と脱水素酵素)を用いて、6-アミノヘキサン酸が、90%以上の収率でアジピン酸へ変換できることが明らかとなった。本研究からNylA-E酵素群を統合的に用いることで、高収率で、6ナイロンを、66ナイロン原料であるアジピン酸まで変換可能である可能性を示すことができた。

Report

(4 results)
  • 2018 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2017 Research-status Report
  • 2016 Research-status Report
  • Research Products

    (27 results)

All 2018 2017 2016

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (20 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Stability and subunit assembly of nylon hydrolase: structural basis of correct subunit assembly, aggregation, and intracellular degradation of the precursor protein2018

    • Author(s)
      Seiji Negoro, Naoki Shibata, Young-Ho Lee, Ikki Takehara, Ryo Kinugasa, Keisuke Nagai, Yusuke Tanaka, Dai-ichiro Kato, Masahiro Takeo, Yuji Goto and Yoshiki Higuchi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 8 Issue: 1 Pages: 9725-9725

    • DOI

      10.1038/s41598-018-27860-w

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Characterization of the 3-methyl-4-nitrophenol degradation pathway and genes of Pseudomonas sp. strain TSN1.2018

    • Author(s)
      Takeo M, Yamamoto K, Sonoyama M, Miyanaga K, Kanbara N, Honda K, Kato DI, Negoro S.
    • Journal Title

      J Biosci Bioeng

      Volume: 126 Issue: 3 Pages: 355-362

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2018.04.001

    • NAID

      40021667183

    • Related Report
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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biosynthetic Pathway and Genes of Chitin/Chitosan-Like Bioflocculant in the Genus Citrobacter.2018

    • Author(s)
      Takeo M, Kimura K, Mayilraj S, Inoue T, Tada S, Miyamoto K, Kashiwa M, Ikemoto K, Baranwal P, Kato D, Negoro S.
    • Journal Title

      Polymers (Basel).

      Volume: 10 Issue: 3 Pages: 237-237

    • DOI

      10.3390/polym10030237

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Metabolic pathway of 6-aminohexanoate in the nylon oligomer-degrading bacterium Arthrobacter sp. KI72: identification of the enzymes responsible for the conversion of 6-aminohexanoate to adipate2018

    • Author(s)
      Takehara I, Fujii T, Tanimoto Y, Kato DI, Takeo M, Negoro S
    • Journal Title

      Appl Microbiol Biotechnol

      Volume: 102 Issue: 2 Pages: 801-814

    • DOI

      10.1007/s00253-017-8657-y

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  • [Journal Article] Draft genome sequence of the nylon oligomer-degrading bacterium Arthrobacter sp. strain KI722017

    • Author(s)
      Takehara I, Kato D, Takeo M, Negoro S
    • Journal Title

      Genome A

      Volume: 217 Issue: 17 Pages: 17-17

    • DOI

      10.1128/genomea.00217-17

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  • [Journal Article] Biosynthesis-inspired deracemizative production of d-luciferin by combining luciferase and thioesterase2017

    • Author(s)
      Maeda J, Kato DI, Okuda M, Takeo M, Negoro S, Arima K, Ito Y, Niwa K
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta

      Volume: 1861 Issue: 8 Pages: 2112-2118

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2017.04.010

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  • [Journal Article] Mutations affecting the internal equilibrium of the reaction catalyzed by 6-aminohexanoate-dimer hydrolase2016

    • Author(s)
      Negoro S, Kawashima Y, Shibata N, Kobayashi T, Baba T, Lee YH, Kamiya K, Shigeta Y, Nagai K, Takehara I, Kato D, Takeo M, Higuchi Y
    • Journal Title

      FEBS Lett

      Volume: 590 Pages: 3133-3143

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  • [Presentation] Protein stability and subunit assembly of nylon hydrolase; structural basis discriminating correct subunit assembly, aggregation, and intracellular degradation of precursor protein2018

    • Author(s)
      S. Negoro
    • Organizer
      World Congress on Applied Microbiology 2018
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    • Author(s)
      S. Negoro
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      Petrochemistry and Natural Resources 2018
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  • [Presentation] ナイロンオリゴマー分解菌Arthrobacter の2 種類の6-アミノヘキサン酸アミノトランスフェラーゼ NylD1・NylD2 の機能解析2018

    • Author(s)
      藤井 翼, 竹原 一起, 橋本 悠, 武尾 正弘, 根来 誠司
    • Organizer
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    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会
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  • [Presentation] 遺伝子破壊によるCitrobacter 属細菌のキトサン様バイオ凝集剤高生産株の育種2018

    • Author(s)
      金尾 圭太, 柏 雅美, 木村 和幸, 宮本 弘毅,山口 翔太, バランワル プリヤンカ, 根来 誠司, 武尾 正弘
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会
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  • [Presentation] エチレングリコール中におけるナイロン加水分解酵素の構造と酵素活性に対する変異効果2018

    • Author(s)
      生越大輔、綛野太貴、岡崎秀明、武尾正弘、根来誠司
    • Organizer
      第80回酵素工学研究会講演会
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  • [Presentation] 6-アミノヘキサン酸アミノトランスフェラーゼの速度論解析と類縁酵素の立体構造を基盤とした触媒機構モデル2018

    • Author(s)
      藤井 翼、赤木 心、岸本彰伍、竹原一起、武尾正弘、根来誠司
    • Organizer
      第80回酵素工学研究会講演会
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  • [Presentation] Arthrobacter sp.KI72におけるナイロンモノマー代謝に関する遺伝子クローニングと代謝経路の同定2018

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      藤井 翼、竹原一起、橋本 悠、加藤太一郎、武尾正弘、根来誠司
    • Organizer
      2018年度日本農芸化学会大会
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  • [Presentation] エチレングリコール中におけるナイロン加水分解酵素の構造と機能相関2018

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      岡崎秀明、生越大輔、戸田 光、麦田悠紀、竹原一起、武尾正弘、根来誠司
    • Organizer
      2018年度日本農芸化学会大会
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  • [Presentation] エチレングリコール中におけるナイロン加水分解酵素の構造と機能相関2017

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      生越大輔, 岡崎秀明, 伊東雅人, 竹原一起, 武尾正弘, 根来誠司
    • Organizer
      第69回日本生物工学会大会
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  • [Presentation] ナイロン加水分解酵素の構造安定化機構の解析2017

    • Author(s)
      岡崎秀明, 生越大輔, 伊東雅人, 戸田 光, 竹原一起, 武尾正弘, 重田育照, 根来誠司
    • Organizer
      第69回日本生物工学会大会
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  • [Presentation] Arthrobacter sp. KI72 におけるナイロンモノマー代謝系の同定と酵素の特徴2017

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      竹原一起, 藤井 翼, 加藤太一郎, 武尾正弘, 根来誠司
    • Organizer
      第69回日本生物工学会大会
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  • [Presentation] 有機溶媒中におけるナイロン加水分解酵素の構造と機能相関2017

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      生越大輔、岡崎秀明、伊東雅人、竹原一起、武尾正弘、根来誠司
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      藤井 翼、竹原一起、武尾正弘、根来誠司
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      2017年酵素・補酵素研究会講演会
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  • [Presentation] 分子動力学計算を用いたナイロン加水分解酵素の熱安定化機構解析2016

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      大塚裕斗、伊東雅人、衣笠 凌、羽田圭吾、竹原一起、馬場剛史、重田育照、武尾正弘、根来誠司
    • Organizer
      酵素工学研究会第76回講演会
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      東京大学 (東京都)
    • Year and Date
      2016-10-07
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  • [Presentation] ナイロンの酵素的モノマー化手法の開発2016

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      生越大輔、岡崎秀明、伊東雅人、竹原一起、武尾正弘、根来誠司
    • Organizer
      酵素工学研究会第76回講演会
    • Place of Presentation
      東京大学 (東京都)
    • Year and Date
      2016-10-07
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  • [Presentation] Arthrobacter sp. KI72 におけるナイロンモノマー代謝系の同定と酵素の特徴2016

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      藤井 翼、竹原一起、谷本悠樹、加藤太一郎、武尾正弘、根来誠司
    • Organizer
      酵素工学研究会第76回講演会
    • Place of Presentation
      東京大学 (東京都)
    • Year and Date
      2016-10-07
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  • [Presentation] ナイロン加水分解酵素のサブユニット会合と熱安定化機構の解析2016

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      伊東雅人、 衣笠 凌、羽田圭吾、大塚裕人、竹原一起、重田育照、武尾正弘、根来誠司
    • Organizer
      第68回 日本生物工学会 大会
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      富山国際会議場 (富山県)
    • Year and Date
      2016-09-28
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  • [Presentation] 有機溶媒中でのナイロンの酵素分解2016

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      岡崎秀明、伊東雅人、生越大輔、竹原一起、武尾正弘、根来誠司
    • Organizer
      第68回 日本生物工学会 大会
    • Place of Presentation
      富山国際会議場 (富山県)
    • Year and Date
      2016-09-28
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  • [Presentation] ナイロンオリゴマー分解菌Arthrobacter sp. KI72における6-アミノヘキサン酸代謝系の同定2016

    • Author(s)
      竹原一起、藤井 翼、加藤太一郎、武尾正弘、根来誠司
    • Organizer
      第68回 日本生物工学会 大会
    • Place of Presentation
      富山国際会議場 (富山県)
    • Year and Date
      2016-09-28
    • Related Report
      2016 Research-status Report

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Published: 2016-04-21   Modified: 2020-03-30  

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