Comparison of taxon concept hierarchies in biodiversity databases using Rough set theory

• Project/Area Number: 17300071
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Sensitivity informatics/Soft computing
• Research Institution: University of Tsukuba
• Principal Investigator: YTOW Nozomi University of Tsukuba, 大学院・生命環境科学研究科, 講師 (90251016)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): SATO Akira 筑波大学, 大学システム情報工学研究科, 講師 (90285429)
• Research Collaborator: DAVE Roberts Natural History Museum, Zoological Department Head of Microbiology Research Group ; DAVID R. Morse The Open University, Faculty of Mathematics, Computing and Technology Senior Lecturer
• Project Period (FY): 2005 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥9,780,000 (Direct Cost: ¥8,700,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2008: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000); Fiscal Year 2007: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000); Fiscal Year 2006: ¥1,800,000 (Direct Cost: ¥1,800,000); Fiscal Year 2005: ¥3,300,000 (Direct Cost: ¥3,300,000)
• Keywords: データベース / ラフ集合 / 形式概念分析 / オントロジー / GBIF / 生物多様性 / 形式概念 / 分類体系 / 国際研究者交流 / イギリス:オーストラリア / 言語哲学 / 概念比較

Research Abstract

ラフ集合理論を生物分類データの解析に応用し、データの不完全さ・不均質さを許容しつつ学名データ全体から浮かび上がる分類体系を抽出する手法を開発した。また、ラフ集合理論と形式概念分析との関係性に着目し、それぞれの生物分類群が有する性質に基づいて分類を行なうことと、それぞれの分類群に含まれない生物を列挙することが理論的に同等であることを示し、ラフ集合理論による分析の生物分類学的な位置づけを明らかにした。

Research Products

• [Journal Article] Rough Set Approximation as Formal Concept (2006)
  • Author(s): Nozomi Ytow, David R. Morse and Dave Roberts
  • Journal Title: Journal of Advanced Computational Intelligence and Intelligent Informatics 10(5) Pages: 606-611
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Rough Set Approximation as Formal Concept (2006)
  • Author(s): Nozomi Ytow, David R.Morse, David McL Roberts
  • Journal Title: Journal of Advanced Computational Intelligence and Intelligent Informatics 10・5 Pages: 606-611
• [Journal Article] 電子ジャーナルの多面的検索分析システム (2005)
  • Author(s): 関 隆宏, 安元裕司, 和多太樹, 伊藤希, 廣川佐千男
  • Journal Title: 情報処理学会第68回全国大会 3 Pages: 43-44
  • NAID: 120005670530
• [Journal Article] 多次元マトリックス法による電子ジャーナルZoological Scienceの検索と分析 (2005)
  • Author(s): 関 隆宏, 安元裕司, 和多太樹, 伊藤希, 廣川佐千男
  • Journal Title: ディジタル図書館 30 Pages: 72-80
• [Presentation] (2008)言語としての生物学的階層 (2008)
  • Author(s): 伊藤希
  • Organizer: 科学基礎論学会秋の研究例会
  • Place of Presentation: 於慶応大学
  • Year and Date: 2008-11-22
• [Presentation] 言語としての生物学的階層 (2008)
  • Author(s): 伊藤希
  • Organizer: 科学基礎論学会
  • Place of Presentation: 慶応大学三田キャンパス
  • Year and Date: 2008-11-22
• [Presentation] (2008)進化・変化・形式化 (2008)
  • Author(s): 伊藤希
  • Organizer: 生物基礎論研究会第2回研究会
  • Place of Presentation: 於京都大学
  • Year and Date: 2008-09-14
• [Presentation] 進化・変化・形式化 (2008)
  • Author(s): 伊藤希
  • Organizer: 生物学基礎論研究会
  • Place of Presentation: 京都大学
  • Year and Date: 2008-09-14
• [Presentation] 文献データベースは何を提供すべきか (2006)
  • Author(s): 伊藤希
  • Organizer: 日本動物学会第77回大会
  • Place of Presentation: 於島根大学
  • Year and Date: 2006-09-21
• [Book] 片倉晴雄・馬渡峻輔共編『動物の多様性』培風館 (2007)
  • Author(s): 伊藤希
  • Publisher: 生物多様性情報学から見た分類
• [Remarks] 全体的な背景説明のほか、開発ソフトウェア、サンプルデータ等がダウンロード可能
  • URL: http://www.nomencurator.org/
• [Remarks] TAPIRクライアントライブラリ
  • URL: https://digier.svn.sourceforge.net/svnroot/digir/TapirJChirp
• [Remarks]
  • URL: http://wiki/tdwg.org/twiki/bin/view/TAPIR/TapirJChirp
• [Remarks]
  • URL: http://www.nomencurator.org/
• [Remarks]
  • URL: http://www.nomencurator.org/