特異点を考慮した高精度リサンプリング法の開発とその応用
Project/Area Number |
17700276
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Research Category |
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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Allocation Type | Single-year Grants |
Research Field |
Statistical science
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Research Institution | Tokyo Institute of Technology |
Principal Investigator |
下平 英寿 Tokyo Institute of Technology, 大学院・情報理工学研究科, 准教授 (00290867)
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Project Period (FY) |
2005 – 2007
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2007)
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Budget Amount *help |
¥3,500,000 (Direct Cost: ¥3,500,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
Fiscal Year 2005: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
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Keywords | ブートストラップ / アルゴリズム / 系統進化 / マイクロアレイ / 特異点 / 統計的仮説検 / バイオインフォマティクス / スケール変換 / 統計的仮設検定 / 統計的仮説検定 |
Research Abstract |
データから得られる推定値の信頼性を確率値として計算するために,仮説の不偏な確率値を高精度で計算するリサンプリング法の開発を目的とする.このために,(i)マルチスケール・ブートストラップ法をすでに提案している.そこでは確率分布の空間における仮説領域の境界が滑らかな曲面であることを仮定して,その曲率やデータ点までの距離といった幾何学的な議論が理論的な導出の基礎になっているので,もし境界が滑らかでない場合には特異点付近で精度が下がる.一方,(ii)多重比較法を利用した手法も以前に提案している.そこでは仮説領域が凸多面錐であることを仮定して,その頂点(特異点)における精度を保証しているが,これから離れると精度が下がることが知られている.したがって本研究では,(i)(ii)の両手法の長所を取り入れる新たな手法の開発及びその応用を目指している. 本年度は以下の点について研究を行った.1.マルチスケール・ブートストラップ法を発展させるアルゴリズムを考案するにあたり,その基礎となる近似的に不偏な検定の理論の構築をさらに進めた.曲面のフーリエ変換に基づく理論的枠組みを発展させた.2.構築した理論とアルゴリズムに基づき,ソフトウェアを作成した.Rの公式ライブラリscalebootとして公開した.3.アルゴリズムをバイオインフォマティクス(系統進化,マイクロアレイ)の応用へ実践し,実用性について検証した.
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Report
(3 results)
Research Products
(9 results)
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[Journal Article] Multiplicative Decomposition of Time- and Dose-Dependent Gene Expression Changes2005
Author(s)
Tani, Y., Kamimura, T., Nagashima, T., Ide, K., Hatakeyama, M., Shimodaira, H.
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Journal Title
The 16th International Conference on Genome Informatics 2005
Pages: P058
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