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Comprehensive analysis of pathogenic ncRNA in host environment

Research Project

Project/Area Number 17F17421
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section外国
Research Field Bacteriology (including mycology)
Research InstitutionTeikyo University

Principal Investigator

関水 和久  帝京大学, 医真菌研究センター, 教授 (90126095)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) PANTHEE SURESH  帝京大学, 医真菌研究センター, 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2017-10-13 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Fiscal Year 2019: ¥500,000 (Direct Cost: ¥500,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2017: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Keywords機能性RNA / 次世代シークエンサー / 黄色ブドウ球菌 / 病原性 / 網羅的遺伝子発現解析
Outline of Annual Research Achievements

今年度において黄色ブドウ球菌の機能性RNAである黄色ブドウ球菌のrsaC遺伝子破壊株について、マウスに感染させた状態でin vivo RNA-Seq解析について時間経過を含めてより詳細に実施した。その結果、感染後24時間以降に心臓や腎臓など複数の臓器において、黄色ブドウ球菌のsodium:proton antiporterをコードする発現量が低下していることが明らかになった。感染後6時間においては有意な発現変動は認められなかった。これはrsaC遺伝子が感染後期で病原性の発揮に寄与する点と一致している。また、本遺伝子の病原性に関する機能については明らかになっていないことから、rsaC遺伝子の新しい遺伝子機能を見出したと考えられる。一方、本遺伝子はrsaC遺伝子の近傍にあるため、遺伝子の相補を含めて再度検討する必要がある。従って本研究において、rsaC遺伝子が病原性発揮において必須であること、及び、嫌気的条件下における病原性の発揮に必要であること明らかにできたと考えられる。また、我々がカイコ感染モデルで探索し、マウス全身感染モデルにおいても病原性が低下することを見出した8つの新規病原性遺伝子について、試験管内培養条件における機能性RNAの発現変動を実施した。その結果、共通して発現量が低下した機能性RNAは見出されなかったが、いくつかの発現変動パターンが認められることがわかった。さらに、本年度において本研究結果をまとめ、学会発表を行うとともに、論文として投稿しているところである。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • 2017 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2019 2018 Other

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 2 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Molecular characterization of multi-drug resistant coagulase negative cocci in non-hospital environment2019

    • Author(s)
      Nwibo Daniel Don、Panthee Suresh、Hamamoto Hiroshi、Sekimizu Kazuhisa
    • Journal Title

      Drug Discoveries & Therapeutics

      Volume: 13 Issue: 3 Pages: 145-149

    • DOI

      10.5582/ddt.2019.01031

    • NAID

      130007682088

    • ISSN
      1881-7831, 1881-784X
    • Year and Date
      2019-06-30
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Weissella hellenica 0916-4-2 and Its Comparative Genomic Analysis2019

    • Author(s)
      Panthee Suresh、Paudel Atmika、Blom Jochen、Hamamoto Hiroshi、Sekimizu Kazuhisa
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 10 Pages: 1619-1619

    • DOI

      10.3389/fmicb.2019.01619

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Utilization of hybrid assembly approach to determine the genome of an opportunistic pathogenic fungus, candida albicans timm17682018

    • Author(s)
      Panthee Suresh、Hamamoto Hiroshi、Ishijima Sanae A、Paudel Atmika、Sekimizu Kazuhisa
    • Journal Title

      Genome Biology and Evolution

      Volume: 10 Issue: 8 Pages: 2017

    • DOI

      10.1093/gbe/evy166

    • URL

      https://pure.teikyo.jp/en/publications/c0d8530e-ff04-4e17-9d97-879b0f9a3a1e

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Discovering novel roles of genes for virulence of Staphylococcus aureus USA300 using invertebrate model silkworm2019

    • Author(s)
      Suresh Panthee、Hiroshi Hamamoto、Atmika Paudel、Kazuhisa Sekimizu
    • Organizer
      ASM Microbe 2019
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 治療効果を指向した新規感染症治療薬の同定と開発2019

    • Author(s)
      浜本洋
    • Organizer
      第42回白金シンポジウム
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] In-vivo transcriptomic analysis of Staphylococcus aureus infections2018

    • Author(s)
      Suresh Panthee
    • Organizer
      the 18th International Symposium on Staphylococci and Staphylococcal Infections (ISSSI)
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 細菌感染症研究における様々な網羅的RNA解析手法2018

    • Author(s)
      浜本洋、Panthee Suresh、Paudel Atmika、鈴木穣、関水和久
    • Organizer
      第91回日本細菌学会総会
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Invited
  • [Remarks] 医真菌研究センターのホームページ

    • URL

      https://www.teikyo-u.ac.jp/affiliate/laboratory/fungal_center

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Remarks] 帝京大学医真菌研究センターホームページ

    • URL

      https://www.teikyo-u.ac.jp/affiliate/laboratory/fungal_center/

    • Related Report
      2018 Annual Research Report 2017 Annual Research Report

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Published: 2017-10-17   Modified: 2024-03-26  

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