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RNAアプタマースイッチを利用した低オフターゲット効果ゲノム編集法の開発

Research Project

Project/Area Number 17J08531
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Chemical pharmacy
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

松本 大亮  東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2017-04-26 – 2019-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Fiscal Year 2018: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywordsゲノム編集 / CRISPR / 抗CRISPR / 相同性組換え / 細胞周期 / CRISPR/Cas9 / RNAアプタマー
Outline of Annual Research Achievements

現在ゲノム編集技術において主に用いられる配列特異的なDNA切断酵素であるCRISPR/Cas9システム(CRISPR)に対して、近年報告されたCRISPR阻害タンパク質である抗CRISPR分子を組み合わせることで、細胞周期依存的に活性化できるCRISPR制御系を構築した。
本研究の目的は相同性組換えが高頻度で起こるS/G2期においてDNA二本鎖切断を導入することにより、正確性の高いゲノム編集を行うことである。当初の研究実施計画では、CRISPRの配列認識に用いられるガイドRNAをRNAアプタマーを利用して阻害し、このRNAアプタマーが細胞周期に応じてスイッチする系を試みた。しかし、アプタマーの入手が困難であったため、抗CRISPR分子を用いることとした。
哺乳類細胞において細胞周期のS期からM期の間での分解を促進するCdt1由来のアミノ酸配列を抗CRISPR分子(AcrIIA4)に融合したAcrIIA4-Cdt1を構築した。これにより、G1期ではAcrIIA4によるCas9活性の阻害、S期以降ではAcrIIA4の分解によるCas9の活性化が可能となる。実際に、ゲノム編集の正確性の向上を確認することができた。
本手法では、ベクターを工夫することによってDNAを導入するのみで自律的にCRISPRの細胞周期依存的な活性化が可能である。そのため、薬剤を用いた細胞の同調培養やCas9タンパク質やガイドRNAの精製も不要であり、細胞にとって低侵襲でかつ低コストな手法である。また、相同性組換えを介した標的配列での正確な修復効率の向上に加え、標的外での配列における変異導入(オフターゲット作用)の低減も確認できた。したがって、本手法はゲノム編集技術の医学分野やバイオ産業分野への応用が期待される。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2018 Annual Research Report
  • 2017 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2019 2018 2017

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results)

  • [Journal Article] Direct Delivery of Cas9-sgRNA Ribonucleoproteins into Cells Using a Nanoneedle Array2019

    • Author(s)
      Yamagishi Ayana、Matsumoto Daisuke、Kato Yoshio、Honda Yuki、Morikawa Mone、Iwata Futoshi、Kobayashi Takeshi、Nakamura Chikashi
    • Journal Title

      Applied Sciences

      Volume: 9 Issue: 5 Pages: 965-965

    • DOI

      10.3390/app9050965

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Efficient and Orthogonal Transcription Regulation by Chemically Inducible Artificial Transcription Factors.2018

    • Author(s)
      Wataru Nomura, Daisuke Matsumoto, Taisuke Sugii, Takuya Kobayakawa, Hirokazu Tamamura
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 57 Issue: 45 Pages: 6452-6459

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.8b00741

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Split site-specific nucleases for controlled genome editing by chemicals2018

    • Author(s)
      Daisuke Matsumoto, Wataru Nomura, Hirokazu Tamamura
    • Organizer
      Frontiers2018 symposium
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 化合物誘導型ヌクレアーゼを用いたゲノム編集効率の評価2018

    • Author(s)
      松本大亮、野村渉、玉村啓和
    • Organizer
      第62回日本薬学会関東支部大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] FokIを基盤とした化合物誘導型ヌクレアーゼによるゲノム編集法の開発2018

    • Author(s)
      松本大亮、野村渉、玉村啓和
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第13回年会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Distinct chemically inducible system for orthogonal differential regulation of endogenous genes2018

    • Author(s)
      Wataru Nomura, Daisuke Matsumoto, Taisuke Sugii, Takuya Kobayakawa, Hirokazu Tamamura
    • Organizer
      Keystone symposia Precision Genome Engineering (B1) 2018
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Genome editing with a FokI-based chemically inducible nuclease system2018

    • Author(s)
      Daisuke Matsumoto, Wataru Nomura, Hirokazu Tamamura
    • Organizer
      Keystone symposia Precision Genome Engineering (B1) 2018
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Differential regulation of endogenous genes in an orthogonal manner by distinct chemically inducible systems2017

    • Author(s)
      Wataru Nomura, Daisuke Matsumoto, Taisuke Sugii, Takuya Kobayakawa, Hirokazu Tamamura
    • Organizer
      International Conference on Epigenetics and Bioengineering 2017
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Controllable genome editing by chemically inducible split site-specific nucleases2017

    • Author(s)
      Daisuke Matsumoto, Wataru Nomura, Hirokazu Tamamura
    • Organizer
      Keystone symposia Precision Genome Engineering (A2) 2017
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

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Published: 2017-05-25   Modified: 2024-03-26  

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