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Elucidation of Phylogenetic Status and Natural History from Museum Specimen of the Extinct Japanese Otter

Research Project

Project/Area Number 17K15177
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Biodiversity/Systematics
Research InstitutionThe University of Tokyo (2019)
Tokyo University of Agriculture (2017-2018)

Principal Investigator

WAKU DASIUKE  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 特任研究員 (60793578)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2017: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Keywords野生動物 / 絶滅動物 / 古代DNA / 全ゲノム / カワウソ / 博物館標本 / 分子系統解析 / 保全遺伝学 / 全ゲノム解析 / 剥製標本 / 系統地理学 / ニホンカワウソ / 対馬 / 系統分類 / 集団形成史
Outline of Final Research Achievements

I analyzed ten specimens of the extinct Japanese otter, which was planned at the beginning of this project, was carried out. As a result, the mitochondrial genome sequence was determined from several individuals. In this way, we obtained new data through this study. In addition, the living otter was found in Japan (Tsushima) during the project period, and we determined the mitochondrial genome sequence from the feces. Furthermore, to analyze the whole genome, I obtained shotgun sequence data from Eurasian, Asian small-clawed, and smooth-coated otters. These results will be submitted to an international journal in the future.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

これまで日本列島の全域のニホンカワウソ個体群を対象に行ったDNAの研究は無かった。本研究の結果は明らかにされてこなかった日本列島の絶滅動物の自然史に新たな洞察を与える。さらに、本研究では当初の計画を発展させ全ゲノム解析を目指し、ニホンカワウソの近縁種からドラフトゲノム配列を得るためのデータを得て、ニホンカワウソの全ゲノム解析に挑戦し成果を出しつつある。ヒトや家畜以外の出土試料を用いた全ゲノム解析は世界でも多くなく意義はい大きい。
社会的にも注目されており、新聞や商業誌や公園で一般の方々が研究について目にする機会も多かった。日本の動物を理解することは一般の方々も求めていることが改めて認識できた。

Report

(4 results)
  • 2019 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2018 Research-status Report
  • 2017 Research-status Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2019 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (9 results) (of which Invited: 1 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] ラオス国立大学(ラオス)

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      2019 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] 国立台北大学/台北動物園研究部門(その他の国・地域)

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  • [Int'l Joint Research] Wetlands International Indonesia(インドネシア)

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  • [Int'l Joint Research] マレーシア国民大学(マレーシア)

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  • [Journal Article] 生き物のいま ニホンカワウソ(1)複雑な成立過程を示唆するデータも:最新機器によるミトコンドリアDNA解析から2018

    • Author(s)
      和久大介・佐々木剛
    • Journal Title

      BIOSTORY

      Volume: 29 Pages: 49-56

    • NAID

      40021587455

    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Journal Article] 日本に生息していたカワウソの分類2018

    • Author(s)
      和久大介
    • Journal Title

      ANIMATE

      Volume: 14 Pages: 52-56

    • NAID

      40021684898

    • Related Report
      2018 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ラオスと周辺国におけるユーラシアカワウソの系統地理学的研究2019

    • Author(s)
      和久大介, Liphone Nophaseud, 安藤元一, 佐々木浩, Bounthob Praxaysombath
    • Organizer
      日本哺乳類学会2019年度大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Discovery of the Eurasian otter Lutra lutra in Japan2019

    • Author(s)
      Sasaki, H., Sekiguchi, T., Izawa, M., Nakanishi N., Waku, D., Yamane, A.
    • Organizer
      14th International Otter Congress
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] 対馬で発見されたカワウソの 分子系統学的位置づけ2018

    • Author(s)
      和久大介・関口猛・佐々木浩
    • Organizer
      日本進化学会第20回大会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] 長崎県対馬におけるカワウソの生息状況2018

    • Author(s)
      佐々木浩・関口猛・伊澤雅子・中西希・和久大介
    • Organizer
      日本哺乳類学会2018年度大会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] ムササビ (Petaurista leucogenys) の鳴き声に関する研究2018

    • Author(s)
      寺田知功・吉田真也・和久大介・小川博
    • Organizer
      日本哺乳類学会2018年度大会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] ムササビ (Petaurista leucogenys) の糞DNA抽出法確立2018

    • Author(s)
      小嶋愛香・清水海渡・和久大介
    • Organizer
      日本哺乳類学会2018年度大会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] 群馬県ツキノワグマのマイクロサテライト遺伝子座を用いた集団構造解明へ2018

    • Author(s)
      和久大介・佐々木剛・谷本真樹・米澤隆弘・姉崎智子
    • Organizer
      ぐんまの自然の「いま」を伝える報告会 2017
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      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 2010年から2012年の群馬県 ツキノワグマのミトコンドリアDNA部分配列 に基づいた遺伝的集団構造の動態2017

    • Author(s)
      和久大介・米澤隆弘・中野敬太・姉崎智子
    • Organizer
      日本哺乳類学会2017年度大会
    • Related Report
      2017 Research-status Report
  • [Presentation] 日本に生息していたカワウソの分類2017

    • Author(s)
      和久大介
    • Organizer
      農大動物研究会
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      2017 Research-status Report
    • Invited
  • [Book] 月刊科学雑誌Newton 2017年11月号2017

    • Author(s)
      井上達彦
    • Total Pages
      160
    • Publisher
      株式会社ニュートンプレス
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  • [Remarks] 結局、対馬のカワウソってなにものだったの?――最新の研究でひもとくニホンカワウソの正体

    • URL

      https://buna.info/article/701/

    • Related Report
      2019 Annual Research Report

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Published: 2017-04-28   Modified: 2021-02-19  

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