Improvement and Systematization of the Exploitation of Information for Nutrigenomics Analyses of Food Function

• Project/Area Number: 18380077
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Food science
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: KATO Hisanori The University of Tokyo, 大学院・農学生命科学研究科, 准教授 (40211164)
• Project Period (FY): 2006 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥17,320,000 (Direct Cost: ¥14,800,000、Indirect Cost: ¥2,520,000); Fiscal Year 2008: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000); Fiscal Year 2007: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000); Fiscal Year 2006: ¥6,400,000 (Direct Cost: ¥6,400,000)
• Keywords: DNAマイクロアレイ / カロリー制限 / タンパク質栄養 / データベース / ニュートリゲノミクス / トランスクリプトミクス / プロテオミクス / 高脂肪食 / 食品機能 / タシパク質栄養 / 皮膚 / アミノ酸 / トランスクリプトーム / プロテオーム / カルニチン / 食の安全性

Research Abstract

様々なタンパク質栄養条件に応答した肝臓や皮膚での遺伝子発現の網羅的応答を幅広く明らかにした。それらのデータを有効に解析するためのバイオインフォマティクス手法を高度活用し、栄養研究における情報の有効利用を推進した。また、高脂肪食摂食や運動、抗肥満食品因子、マイルドなカロリー制限等に対する網羅的遺伝子発現やタンパク質量の応答に関する情報を蓄積した。従来から構築して維持しているニュートリゲノミクスデータベースを大幅に改良し、世界のニュートリゲノミクス研究を格段に発展させる礎を築いた。

Research Products

• [Journal Article] Effect of fasting on the peripheral circadian gene expression in rats (2010)
  • Author(s): Dong, Y., Wu, T., Ni, Y. H., Kato, H., Fu, Z. W.
  • Journal Title: Biol. Rhythm Res. 41 Pages: 41-47
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Regulation of circadian gene expression in the kidney by light and food cues in rats (2010)
  • Author(s): Wu, T., Ni, Y., Dong, Y, Kato, H., Fu, Z. W.
  • Journal Title: Am. J. Physiol. Regul. Integr. Comp. Physiol. 298 Pages: 635-641
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Effect of mild restriction of food intake on gene expression profile in the liver of young rats : reference data for in vivo nutrigenomics study (2010)
  • Author(s): Saito, K., Ohta, Y., Sami, M., Kanda, T., Kato, H.
  • Journal Title: Brit. J. Nutr. (in press)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Genes related to the ubiquitin-proteasome system are up-regulated in the brown adipose tissue of 24 h-fasted rats (2008)
  • Author(s): Nakai, N., Hashida, H., Kadota, K., Minami, M., Shimizu, K., Matsumoto, I., Kato H., Abe, K.
  • Journal Title: Biosci. Biotechnol. Biochem 72 Pages: 139-148
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Opposite effects of PU.1 on mast cell stimulation (2008)
  • Author(s): Niwa, Y, Nishiyama, C., Nakano, N., Kamei, A., Kato, H., Kanada, S., Ikeda, S., Ogawa, H., Okumura, K.
  • Journal Title: Biochem. Biophys. Res. Commun. 375 Pages: 95-100
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Light and food signals cooperate to entrain the rat pineal circadian system. (2008)
  • Author(s): Wu, T., Jin, Y. X., Kato, H., Fu, Z. W
  • Journal Title: J. Neurosci. Res. 86 Pages: 3246-3255
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Nutrigenomics : the cutting edge and Asian perspectives. (2008)
  • Author(s): Kato, H.
  • Journal Title: Asia Pac. J. Clin. Nutr. 17 (S1) Pages: 12-15
• [Journal Article] Effects of light cues on re-entrainment of the food-dominated peripheral clocks in mammals. (2008)
  • Author(s): Wu, T., Jin, Y. X., Ni, Y.H., Zhang, D. P., Kato, H. Fu, Z. W.
  • Journal Title: Gene 419 Pages: 27-34
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Opposite effects of PU. 1 on mast cell stimulation. (2008)
  • Author(s): Niwa, Y., Nishiyama, C., Nakano, N., Kamei, A., Kato, H., 他
  • Journal Title: Biochelii. Biophys. Res. Commum 357 Pages: 95-100
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Light and food signals cooperate to entrain the rat pineal circadian system. (2008)
  • Author(s): Wu, T., J in, Y. X., Kato, H. and Fu, Z. W.
  • Journal Title: J. Neurosci. Res. 86 Pages: 3246-3255
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Genes related to the ubiquitin-proteasome system are up-regulated in the brown adipose tissue of 24 h-fasted rats (2008)
  • Author(s): Nakai, Y.
  • Journal Title: Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 72 Pages: 139-148
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Nutrigenomics:the cutting edge and Asian perspectives (2008)
  • Author(s): Kato, H.
  • Journal Title: Asia Pacific Journal of Clinical Nutrition 17 Pages: 12-15
• [Journal Article] ニユートリゲノミクスの新潮流-テーラーメード栄養を身近なものに (2007)
  • Author(s): 加藤久典, 小林進, 勝谷友宏, 三谷康正
  • Journal Title: バイオサイエンスとインダストリー 65 Pages: 19-23
• [Journal Article] Safety evalution of hypoallergenic wheat flour using a DNA microarray. (2006)
  • Author(s): Narasaka, S., Endo, Y., Fu, ZW., Moriyama, M., Arai, S., Abe, K., Kato, H.
  • Journal Title: Biosci. Biotechnol. Biochem. 70 Pages: 1464-1470
• [Journal Article] Gene expression analysis of the anti-obesity effect by apple polyphenols in rats fed a high fat diet or a normal diet. (2006)
  • Author(s): Ohta, Y., Sami, M., Kanda, T., Saito, K., Osada, K., Kato, H.
  • Journal Title: J. Oleo Sci. 55 Pages: 305-314
  • NAID: 130000055561
• [Presentation] Functional study of an amino acid response element of the phosphoenolpyruvate carboxykinase 2 (PEPCK2) gene (2009)
  • Author(s): 石井駿介
  • Organizer: 第32回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフイコ横浜
  • Year and Date: 2009-12-12
• [Presentation] Data storage and comparative analysis of gene expression profiles for promotion of nutrigenomics study (2009)
  • Author(s): Kenji Saito
  • Organizer: 19th International Congress of Nutrition
  • Place of Presentation: Bangkok
  • Year and Date: 2009-10-09
• [Presentation] Effect of lysine on lipid metabolism : A nutrigenomics study (2009)
  • Author(s): Aya okumura
  • Organizer: 19th International Congress of Nutrition
  • Place of Presentation: Bangkok
  • Year and Date: 2009-10-09
• [Presentation] Phosphoenolpyruvate carbosykinase2(PEPCK1)遺伝子におけるアミノ酸応答配列の機能解析 (2009)
  • Author(s): 石井駿介、小野絢香、斉藤憲司、加藤久典
  • Organizer: 2009年度日本農芸化学会大会
  • Place of Presentation: 福岡
  • Year and Date: 2009-03-29
• [Presentation] 卵殻膜摂食が肝機能と皮膚機能に及ぼす影響のトランスクリプトーム解析 (2009)
  • Author(s): 斉藤憲司、山根拓実、大石祐一、長谷部由紀夫、加藤久典
  • Organizer: 2009年度日本農芸化学会大会
  • Place of Presentation: 福岡
  • Year and Date: 2009-03-28
• [Presentation] 鉄欠乏食がラット肝臓遺伝子発現プロファイルに及ぼす影響 (2009)
  • Author(s): 亀井飛鳥、渡部由貴、根元智子、上原万理子、加藤久典、中井雄治、阿部啓子
  • Organizer: 2009年度日本農芸化学会大会
  • Place of Presentation: 福岡
  • Year and Date: 2009-03-28
• [Presentation] PEPCK2遺伝子のアミノ酸応答配列近傍領域の機能解析 (2008)
  • Author(s): 石井駿介、加藤久典
  • Organizer: 第2回日本アミノ酸学会大会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2008-10-02
• [Presentation] タンパク質栄養悪化がラット皮膚遺伝子発現プロファイルに及ぼす影響の解析 (2008)
  • Author(s): 亀井飛鳥、中井雄治、加藤久典
  • Organizer: 第2回日本アミノ酸学会大会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2008-10-02
• [Presentation] リジンによる脂質代謝制御機構の解析 (2008)
  • Author(s): 奥村亜也、平林由理、趙治嘉、村上仁志、小林久峰、藤條武司、加藤久典
  • Organizer: 第2回日本アミノ酸学会大会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2008-10-02
• [Presentation] タンパク質栄養悪化がラット皮膚遺伝子発現プロフアイルに及ぼす影響の解析 (2008)
  • Author(s): 亀井飛鳥
  • Organizer: 2008年度日本農芸化学会大会
  • Place of Presentation: 名城大学
  • Year and Date: 2008-03-28
• [Presentation] タンパク質栄養の悪化がラット皮膚遺伝子発現プロファイルに及ぼす影響の解析 (2008)
  • Author(s): 亀井 飛鳥
  • Organizer: 2008年度日本農芸化学会大会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2008-03-28
• [Presentation] 各分枝鎖アミノ酸単欠乏がHepG2細胞の遺伝子発現プロファイルに及ぼす影響 (2007)
  • Author(s): 小野 絢香
  • Organizer: 2007年度日本アミノ酸学会年次大会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2007-11-22
• [Presentation] Effects of supplemental amino acids on geneexpression of conagen-related genes in healthy rat skin (2007)
  • Author(s): Kamei, A.
  • Organizer: Asian Congress of Nutrition
  • Place of Presentation: 台湾
  • Year and Date: 2007-09-11
• [Presentation] 摂食量・体重の差異がラット遺伝子発現に及ぼす影響の網羅的解析 (2007)
  • Author(s): 斉藤憲司
  • Organizer: 第61回日本栄養・食糧学会大会
  • Place of Presentation: 京都国際会館
  • Year and Date: 2007-05-20
• [Presentation] 各種アミノ酸摂取がラット皮膚遺伝子発現に及ぼす影響の解析 (2007)
  • Author(s): 亀井飛鳥
  • Organizer: 2007年度日本農芸化学会大会
  • Place of Presentation: 東京農業大学
  • Year and Date: 2007-03-26
• [Presentation] タンパク質栄養悪化の影響のプロテオーム解析 (2007)
  • Author(s): 加藤裕美
  • Organizer: 2007年度日本農芸化学会大会
  • Place of Presentation: 東京農業大学
  • Year and Date: 2007-03-25
• [Book] Genomics applied to nutrients and functional foods in Japan : State of the art In : Genomics, proteomics, and metabolomics in nutraceuticals and functional foods. Bagchi, D., Lau, F.C. and Bagchi, M (eds) (2010)
  • Author(s): Abe, K., Kato, H., Yasuoka, A., Nakai, Y.
  • Publisher: Wiley-Blackwell
• [Book] ニユートリゲノミクスのアレイ解析「遺伝子医学MOOK (10)、DNAチップ/マイクロアレイ 臨床応用の実際」(油谷浩幸編) (2008)
  • Author(s): 加藤久典, 阿部啓子
  • Publisher: メデイカルドゥ
• [Book] 第5章 アミノ酸機能のニユートリゲノミクス解析「アミノ酸の機能特性-ライフサイエンスにおける新しい波-」(日本栄養・食糧学会監修) (2007)
  • Author(s): 加藤久典
  • Publisher: 建吊社
• [Remarks] ニユートリゲノミクスデータベース:
  • URL: http://133.11.220.243/nutdb.html
• [Remarks] Kgee Overviewer (β版):
  • URL: http://133.11.220.243/cgi-bin/gomi/kegg/kegg_viewer2.cgi
• [Remarks]
  • URL: http://133.11.220.243/nutdb.html