Principle of organization of chromosome structures during mammalian development and cell differentiation

• Project/Area Number: 18380198
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Applied molecular and cellular biology
• Research Institution: Mie University
• Principal Investigator: OKUMURA Katsuzumi Mie University, 大学院・生物資源学研究科, 教授 (30177183)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): SUGIMURA Kazuto 三重大学, 大学院・生物資源学研究科, 助教 (90452226) ; 佐藤 憲子 財団法人東京都医学研究機構, 研究員 (70280956)
• Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha): SATO Noriko 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 准教授 (70280956)
• Project Period (FY): 2006 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥17,460,000 (Direct Cost: ¥14,700,000、Indirect Cost: ¥2,760,000); Fiscal Year 2008: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000); Fiscal Year 2007: ¥6,110,000 (Direct Cost: ¥4,700,000、Indirect Cost: ¥1,410,000); Fiscal Year 2006: ¥5,500,000 (Direct Cost: ¥5,500,000)
• Keywords: 発生・分化 / エピジェネティクス / 染色体 / クロマチン / 細胞核 / 可視化 / 複製 / 転写 / 複製フォーク / DNA損傷 / セントロメア / PARP / テロメア / FISH / サブテロメア

Research Abstract

哺乳類染色体の構築原理に関する知見を得ることを目的とし、セントロメア領域におけるエピジェネティクス異常の蓄積はセントロメアの機能崩壊を導き、染色体分離異常を引き起こすこと、染色体末端テロメア領域の複製タイミングおよび高次クロマチン構造による複製タイミング制御についての新たな知見、DNA 複製・転写における核マトリックスの役割の提示、DNA損傷時の複製フォーク進行ダイナミクスとその制御機構について、新たなDNA 損傷応答機構を解明する等の成果を上げた。

Research Products

• [Journal Article] Cyclin A-Cdk1 regulates the origin firing program in mammalian cells (2009)
  • Author(s): Katsuno, Y., Suzuki, A., Sugimura, K., Okumura, K., Zineldeen, D. H., Shimada, M., Niida, H., Mizuno, T., Hanaoka, F., and Nakanishi, M.
  • Journal Title: Proc. Natl. Acad. Sc. USA 106(9) Pages: 3184-3189
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Cyclin A-Cdkl regulates the origin firing program in mammalian cells : (2009)
  • Author(s): Yuko Katsuno
  • Journal Title: Proceedings of National Academy of Science, U.S.A. 106 Pages: 3184-3189
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] PARP-1 ensures regulation fork progression by homologous recombination on damaged DNA (2008)
  • Author(s): Sugimura, K., Takebayashi, S., Takeda, S., Taguchi, H., and Okumura, K.
  • Journal Title: J. Cell Biol. 183(7)(および表紙) Pages: 1203-1212
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Hyper-Phosphorylated Retinoblastoma Protein Suppresses Telomere Elongation (2008)
  • Author(s): Takemura, M., Sugimura, K., Okumura, K., Limsirichaikul, S., Suzuki, M., Yamada, Y., and Yoshida, S.
  • Journal Title: Biosci. Biotechnol. Biochem. 72(2) Pages: 630-635
  • NAID: 10027525010
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] PARP-1 ensures regulation of replication fork progression by homologous recombination on damaged DNA (2008)
  • Author(s): Kazuto Sugimura
  • Journal Title: Journal of Cell Biology 183 Pages: 1203-1212
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Hyper-Phosphorylated Retinoblastoma Protein Suppresses Telomere Elongation (2008)
  • Author(s): Masaharu TAKEMURA
  • Journal Title: Bioscience, Biotechnolgy, and Biochemistry 72巻 Pages: 630-635
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Non-denaturing fluorescence in situ hybridization to find replication origins in a specific genome region on the DNA fiber (2007)
  • Author(s): Sugimura, K., Takebayashi, S.-I., Ogata, S., Taguchi, H., and Okumura, K.
  • Journal Title: Biosci. Biotechnol. Biochem. 71(2) Pages: 627-632
  • NAID: 10027512234
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Functional characterization of a mammalian transcription factor, Elongin A (2007)
  • Author(s): Yasukawa, T., Sugimura, K., Fukuda, M., Yamazaki, K., Kitajima, S., Okumura, K. and Aso, T.
  • Journal Title: Biochem. Biophys. Res. Commun. 352(1) Pages: 237-243
  • NAID: 120001871681
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 核内クロマチン構造と複製タイミング・フォークの制御. 染色体サイクル制御の分子メカニズム (2007)
  • Author(s): 奥村克純, 杉村和人, 竹林慎一郎, 齋藤辰朗
  • Journal Title: 実験医学 25 Pages: 739-746
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 哺乳類細胞における核内ゲノムダイナミクスの可視化技術とその応用展開を目指して (2007)
  • Author(s): 奥村 克純
  • Journal Title: 三重大学生物資源学部紀要 34 Pages: 1-14
  • NAID: 120001164796
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Functional characterization of a mammalian transcription factor, Elongin A (2007)
  • Author(s): Takashi Yasukawa
  • Journal Title: Biochemcal Biophysical Research Communications 352巻1号 Pages: 237-243
• [Journal Article] Non-denaturing fluorescence in situ hybridization to find replication origins in a specific genome region on the DNA fiber (2007)
  • Author(s): Kazuto Sugimura
  • Journal Title: Bioscience, Biotechnolgy, and Biochemistry 71巻2号 Pages: 627-632
  • NAID: 10027512234
• [Journal Article] 核内クロマチン構造と複製タイミング・フォークの制御 (2007)
  • Author(s): 奥村克純
  • Journal Title: 実験医学 25巻5号 Pages: 739-746
• [Journal Article] 複製フォーク進行制御のダイナミクス (2006)
  • Author(s): 杉村和人, 奥村克純
  • Journal Title: 蛋白質核酸酵素 51 Pages: 2123-2125
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Two-step regulation of Ad4BP/SF-1 gene transcription during feta ladrenal development; initiation by aHox-Pbx1-Prep1 complex and maintenance via autoregulation by Ad4BP/SF-1 (2006)
  • Author(s): Zubair, M., Ishihara, S., Oka, S., Okumura, K. and Morohashi K.
  • Journal Title: Mol. Cell. Biol. 26 Pages: 4111-4121
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The orphan nuclear receptor GCNF recruits DNA methyltransferase for Oct-3/4 silencing. (2006)
  • Author(s): Noriko Sato
  • Journal Title: Biochemcal Biophysical Research Communications 344巻3号 Pages: 845-851
• [Journal Article] Two-step regulation of Ad4BP/SF-1 gene transcription during fetal adrenal development; initiation by a Hox-Pbxl-Prepl complex and maintenance via autoreaulation by Ad4BP/SF-1 (2006)
  • Author(s): Mohamad Zubair
  • Journal Title: Molecular and Cellular Biology 26巻11号 Pages: 4111-4121
• [Journal Article] 複製フォーク進行制御のダイナミクス (2006)
  • Author(s): 杉村和人
  • Journal Title: 蛋白質核酸酵素 51巻14号 Pages: 2123-2125
• [Presentation] 転写依存的な核マトリックス結合が複製開始に与える影響 (2008)
  • Author(s): 下京未来
  • Organizer: 日本農芸化学会中部支部第154回例会
  • Place of Presentation: 岐阜市
  • Year and Date: 2008-11-29
• [Presentation] DNAメチル化阻害剤5-aza-dCによる染色体不安定化 (2008)
  • Author(s): 伊藤克
  • Organizer: 口本農芸化学会中部支部第154回例会
  • Place of Presentation: 岐阜市
  • Year and Date: 2008-11-29
• [Presentation] 複製・転写依存的なクロマチンの各マトリックスへの結合 (2008)
  • Author(s): 下京未来
  • Organizer: 日本農芸化学会中部支部第153回例会
  • Place of Presentation: 名古屋市
  • Year and Date: 2008-11-01
• [Presentation] DNAメチル化阻害剤5-aza-dCによる染色体不安定化 (2008)
  • Author(s): 伊藤克
  • Organizer: 日本農芸化学会中部支部第153回例会
  • Place of Presentation: 名古屋市
  • Year and Date: 2008-11-01
• [Presentation] PARP-1は相同組換え因子による複製フォーク進行調節を保証する (2008)
  • Author(s): 杉村和人、竹林慎一郎、武田俊一、奥村克純
  • Organizer: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸市
• [Presentation] 5-aza-2'-deoxycytidineはセントロメア領域のエピジェネティクスを変化させ染色体不安定化を導く (2008)
  • Author(s): 伊藤克
  • Organizer: 第31回口本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸市
• [Presentation] 核マトリックスを介した複製開始に対する転写活性化の影響 (2008)
  • Author(s): 下京未来
  • Organizer: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸市
• [Presentation] DNA低メチル化誘導に伴う染色体不安定化 (2007)
  • Author(s): 伊藤克、杉村和人、奥村克純
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 横浜市
• [Presentation] Replication-dependent association of Chromatin DNA and replication machinery to the nuclear Matrix (2007)
  • Author(s): Saito, T., Ninomiya, K., Ogata, S., Taguchi, H. and Okumura, K.
  • Organizer: International Symposium of Functional Organization of the Nucleus
  • Place of Presentation: Awaji, Japan
• [Presentation] 可視化でひもとく核内高次クロマチンダイナミクスの理解とその応用展開を目指して (2007)
  • Author(s): 奥村克純、齋藤辰朗、杉村和人、緒方進、田口寛
  • Organizer: 日本農芸化学会2007年度大会
  • Place of Presentation: 東京都