Inventory of ciliate and testate amoeba species (Protist) in Japan and development of molecular biological techniques on free living species

• Project/Area Number: 18770060
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Biodiversity/Systematics
• Research Institution: Miyagi University of Education
• Principal Investigator: SHIMANO Satoshi Miyagi University of Education, 附属環境教育実践研究センター, 准教授 (70355337)
• Project Period (FY): 2006 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2008: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2007: ¥1,400,000 (Direct Cost: ¥1,400,000); Fiscal Year 2006: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
• Keywords: 原生生物 / インベントリー / 繊毛虫類 / 有殻アメーバ類 / 分子生物学的手法 / 繊毛中類

Research Abstract

原生生物の特性から、淡水産と思われていたある特定の種が、海水中や、土壌中からも出現する。これまで日本の原生生物は生息地ごとに、別々の学会が研究を行ってきたため、日本では原生生物(動物)のそれぞれの分類群についてはこれまで、系統分類学的情報・生物地理学的情報がまとめられたことがない。本課題では、特に繊毛虫及び有殻アメーバについて、その情報の集約と公開への基盤的整備を行った。また、単一の細胞からの形態情報及び遺伝情報の取得手法を確立し、培養不可能な自由生活性原生動物における単一細胞由来の遺伝子配列の情報の蓄積を開始した。

Research Products

• [Journal Article] 秋吉台の洞窟内に生息する土壌微生物の群集解析の試み (2009)
  • Author(s): 堀学・石田麻里・島野智之
  • Journal Title: 秋吉台科学博物館報告 44 Pages: 55-62
• [Journal Article] Morphology and gene sequence of Levicoleps biwae n. gen., n. sp. (Ciliophora, Prostomatida), a proposed endemic from the ancient Lake Biwa, Japan (2008)
  • Author(s): Foissner, W., Kusoka, Y. and Shimano, S.
  • Journal Title: Journal of Eukaryotic Microbiology 55 Pages: 185-200
• [Journal Article] Linkage between Light microscopic observations and molecular analysis by single-cell PCR for Ciliates (2008)
  • Author(s): Shimano, S., Sanbe, M. and Kasahara, Y.
  • Journal Title: Microbes and Environments 23 Pages: 356-359
  • NAID: 110007005111
• [Journal Article] 日本国内から記録された自由生活性原生生物の文献目録 --繊毛虫類と有殻アメーバ類を中心として-- (2008)
  • Author(s): 島野智之・三好孝和
  • Journal Title: 原生動物学雑誌 41 Pages: 1-30
• [Journal Article] Linkage between Light microscopic-observations and molecular analysis by single-cell PCR for Ciliates (2008)
  • Author(s): Shimano, S., Sanbe, M. and Kasahara, Y.
  • Journal Title: Microbes and Environments 23 Pages: 356-359
  • NAID: 110007005111
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 日本国内から記録された自由生活性原生生物の文献目録-繊毛虫類と有殻アメーバ類を中心として- (2008)
  • Author(s): 島野智之・三好孝和
  • Journal Title: 原生動物学雑誌 41 Pages: 1-30
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Morphology and gene sequence of Levicoleps biwae n. gen., n, sp. (Ciliopora, Prostomatida), a proposed endemic from the ancient Lake Biwa, Japan. (2008)
  • Author(s): Foissner, W., Kusoka, Y., Shimano, S.
  • Journal Title: Journal of eukaryotic Microbiology 55 Pages: 185-200
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A taxon-specific oligonucleotide primer set for PCR-based detection of soil ciliate (2007)
  • Author(s): Puitika,T., Kasahara,Y., Miyoshi,N., Sato,Y., Shimano,S.
  • Journal Title: Microbes and Environments 22 Pages: 78-81
  • NAID: 110006242034
• [Journal Article] 根圏における原生生物の役割 .土壌原生生物とバクテリアおよび植物根との関連について- (2007)
  • Author(s): 島野 智之
  • Journal Title: 土と微生物 61 Pages: 41-48
• [Journal Article] A taxon-specific oligonucleotide primer set for PCR-based detection of soil ciliate. (2007)
  • Author(s): Puitika, T., Kasahara, Y., Miyoshi, N., Sato, Y., Shimano,S.
  • Journal Title: Microbes and Environments 22 Pages: 78-81
  • NAID: 110006242034
• [Journal Article] 根圏における原生生物の役割-土壌原生生物とバクテリアおよび植物根との関連について- (2007)
  • Author(s): 島野 智之
  • Journal Title: 土と微生物 61(印刷中)
• [Presentation] Ciliate community analysis of agricultural soil based on SSU rDNA with new taxon-specific primer (2008)
  • Author(s): Shimano, S. Sanbe, M. Puitika, T. and Kasahara Y
  • Organizer: The International Society of Protistologists (ISOP), 59th Annual Meeting, and the International Society for Evolutionary Protistology, 17th Meeting (ISEP XVII), Program book. pp.18
  • Place of Presentation: Halifax, Nova Scotia, Canada:Dalhousie University
• [Presentation] 顕微鏡的手法及び分子生物学的手法を利用した土壌繊毛虫群集構造の解析(招待口演) (2008)
  • Author(s): 島野智之・高橋忠夫
  • Organizer: シンポジウム「原生生物や線虫から見た土壌生態系の解明と活用」、日本土壌肥料学会
  • Place of Presentation: 名古屋市立大学、名古屋市
• [Presentation] 古代湖としての琵琶湖から記載された新属新種の繊毛虫について (2008)
  • Author(s): 島野智之・楠岡泰・フォイスナー=ウイルヘルム
  • Organizer: 第41 回日本原生動物学会大会講演要旨集
  • Place of Presentation: 筑波大学(つくば市)
• [Presentation] シングルセルPCR 法による繊毛虫類の塩基配列解析 (2008)
  • Author(s): 高叡瑞・明石典之・熊谷朋子・三部光男・今泉友希・外薗香菜・笠原康裕・島野智之
  • Organizer: 日本土壌動物学会 第31 回大会
  • Place of Presentation: 琉球大学(那覇市)
• [Presentation] Ciliate community analysis of agricultural soil based on SSUrDNA with new taxon-specific primer (2008)
  • Author(s): Shimano, S. Sanbe, M. Puitika, T. and Kasahara Y
  • Organizer: The International Society of Protistologists (ISOP), 59th Annual Meeting, and the International Society for Evolutionary Protist ology, 17th Meeting (ISEP XVII)
  • Place of Presentation: Halifax, Nova Scotia, Canada : Dalhousie Uni versity. P
• [Presentation] 顕微鏡的手法及び分子生物学的手法を利用した土壌繊毛虫群集構造の解析.(シンポジウム「原生生物や線虫から見た土壌生態系の解明と活用」) (2008)
  • Author(s): 島野智之・高橋忠夫
  • Organizer: 日本土壌肥料学会
  • Place of Presentation: 名古屋市立大学、名古屋市
• [Presentation] 古代湖としての琵琶湖から記載された新属新種の繊毛虫について (2008)
  • Author(s): 島野智之・楠岡泰・フォイスナー=ウィルヘルム
  • Organizer: 第41回日本原生動物学会大会講演要旨集
  • Place of Presentation: 筑波大学(つくば市)
• [Presentation] シングルセルPCR法による繊毛虫類の塩基配列解析 (2008)
  • Author(s): 高叡瑞・明石典之・熊谷朋子・三部光男・今泉友希・外薗香菜・笠原康裕・島野智之
  • Organizer: 日本土壌動物学会第31回大会
  • Place of Presentation: 琉球大学(那覇市)
• [Presentation] Morphology and gene sequence of an endemic, new Colepid (Protozoa, Ciliophora) from the ancient Lake Biwa, Japan (2007)
  • Author(s): Shimano, S., Foissner, W. and Kusuoka, Y.
  • Organizer: Abstracts of V European Congress of Protozoology and XI European Conference on Ciliate Biology, Protistology, 5, 72
  • Place of Presentation: St. Petersburg, Russia: St. Petersburg State University and Zoological Institute RAS
• [Presentation] 北海道大黒島の土壌繊毛虫について (2007)
  • Author(s): 熊谷朋子・島野智之・三部光男・明石典之
  • Organizer: 第43 回日本動物分類学会講演要旨集, p.4
  • Place of Presentation: 北九州市立自然史・歴史博物館
• [Presentation] 遺伝子で見えてきた土壌原生生物 (2007)
  • Author(s): 島野智之
  • Organizer: 日本土壌動物学会第30 回記念大会 自由集会「土壌動物の遺伝子解析-課題と展望」
  • Place of Presentation: 横浜国立大学教育文化ホール(横浜市保土ヶ谷区)
• [Presentation] 日本における原生生物繊毛虫の分類学及び生態学のための基盤整備を目的とした文献情報データベースの構築(予報) (2007)
  • Author(s): 島野智之・三好孝和
  • Organizer: 第3 回日本進化原生生物研究会要旨集, pp.6.
• [Presentation] Morphology and gene sequence of an endemic・new colepid (Protozoa・Ciliophora) from the ancient Lake Biwa・Japan. (2007)
  • Author(s): Shimano, S., Foissner, W., Kusuoka, Y.
  • Organizer: V European Congress of Protozoology and XI European Conference on Ciliate Biology
  • Place of Presentation: St. Petersburg, Russia
• [Presentation] 北海道大黒島の土壌繊毛虫について. (2007)
  • Author(s): 熊谷朋子・島野智之・三部光男・明石典之
  • Organizer: 第43回日本動物分類学会講演要旨集, p.4.
  • Place of Presentation: 北九州市立自然史・歴史博物館
• [Presentation] 遺伝子で見えてきた土壌原生生物. (2007)
  • Author(s): 島野智之
  • Organizer: 日本土壌動物学会第30回記念大会 自由集会 「土壌動物の遺伝子解析-課題と展望」
  • Place of Presentation: 横浜国立大学教育文化ホール(横浜市保土ケ谷区)
• [Presentation] 北海道大黒島の土壌繊毛虫の同定 (2006)
  • Author(s): 熊谷朋子・三部光夫・明石典之・島野智之
  • Organizer: 第39 回日本原生動物学会大会講演要旨集, pp.23
• [Presentation] 北海道厚岸町大黒島で発見したArcella属の有殻アメーバの1 未記載種について (2006)
  • Author(s): 明石典之・三部光夫・島野智之
  • Organizer: 第39 回日本原生動物学会大会講演要旨集, pp.15
• [Presentation] 土壌繊毛虫の群集構造解析.繊毛虫特異的プライマーの開発 (2006)
  • Author(s): 笠原康裕・Tunjung Puitika・島野智之
  • Organizer: 土壌微生物学会2006 年度仙台大会サテライトミーティング「植物根圏の微生物・微小動物の機能と相互作用」
  • Place of Presentation: 仙台
• [Book] 「土壌動物採集・固定法」「分類学究法」、「土壌動物学への招待-採集からデータ解析まで-」(金子信博・鶴崎展巨・布村昇・長谷川元洋・渡辺弘之編)pp. 35-40; 43-59 (2007)
  • Author(s): 島野智之
  • Total Pages: 284
  • Publisher: 東海大学出版会
• [Book] 「土壌動物学への招待-採集からデータ解析まで-」(分担執筆) (2007)
  • Author(s): 金子信博・鶴崎展巨・布村昇・長谷川元洋・渡辺弘之編
  • Total Pages: 284
  • Publisher: 東海大学出版会,東京
• [Book] 「土壌原生生物の利活用のための基盤的研究」、「東北の農業と土壌肥料」(日本土壌肥料学会東北支部編)pp.247-249 (2006)
  • Author(s): 島野智之
  • Total Pages: 298
  • Publisher: 河北印刷株会社, 岩手
• [Book] 東北の農業と土壌肥料 (2006)
  • Author(s): 日本土壌肥料学会 東北支部編
  • Total Pages: 302
  • Publisher: 日本土壌肥料学会東北支部
• [Remarks] 本国内から記録された自由生活性原生生物の文献目録 -繊毛虫類と有殻アメーバ類を中心として-
  • URL: http://sites.google.com/site/bibliographyjapan/
• [Remarks] 本国内から記録された自由生活性原生生物の文献目録-繊毛虫類と有殻アメーバ類を中心として-
  • URL: http://sites.google.com/site/bibliographyjapan/