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tRNAチオ化修飾経路における硫黄転移反応メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 18770082
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Structural biochemistry
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology (2007)
Tokyo Institute of Technology (2006)

Principal Investigator

沼田 倫征  National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, 生物機能工学研究部門, 研究員 (10401564)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥3,700,000 (Direct Cost: ¥3,700,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2006: ¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Keywords結晶構造解析 / tRNA / RNA修飾酵素 / アンチコドン / wobble base / 触媒機構 / 転写後修飾 / 遺伝暗号翻訳 / X線結晶構造解析 / RNA-タンパク質複合体 / 硫黄化修飾
Research Abstract

tRNAアンチコドン一文字目の塩基修飾は,コドンの適正な縮重を制御しており,正確なタンパク質合成にとって重要である。グルタミン酸,リジン,グルタミンをコードするtRMのアンチコドン1文字目のウリジンは,全ての生物種において修飾を受け2-チオウリジンとなる。アンチコドン1文字目のウリジンに導入される硫黄はシステインに由来しており,反応性に富む過硫化硫黄中間体となって硫黄リレータンパク質(IscS,TusA,TusBCD,TusE)を移動し,tRNAチオ化修飾酵素であるMhmAに引き渡される。本研究では,tRMへの硫黄転移反応を解明するために,IscS-TusA複合体,TusA-TusBCD複合体,TusBCD-TusE-MnmA複合体,TusE-MnmA-tRNA複合体の結晶構造解析を目指している。これまでに,IscS,TusA,TusBCD,TusE,MnmAの大腸菌を用いた大量発現・精製系,およびT7 RNAポリメラーゼを用いたin vitroにおけるtRNAの大量調製系を構築し,それぞれの複合体の結晶化条件の初期スクリーニングを行った。現在までに,いくつかの複合体に関して予備的な結晶を得ており,現在,結晶化条件の最適化を行っているところである。
TusE-MnmA-tRNAからなる三者複合体結晶については,大型放射光施設にて回折強度を測定し,分解能5Å程度の回折データを収集した。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2007 2006

All Journal Article (7 results)

  • [Journal Article] Animated crystallography of genetic code translation2007

    • Author(s)
      Tomita, K., et. al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symposium Series 51

      Pages: 101-102

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Journal Article] Snapshots of tRNA sulphuration via an adenylated intermediate2006

    • Author(s)
      Numata, T. et al.
    • Journal Title

      Nature 442

      Pages: 419-424

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Structural basis of RNA-dependent recruitment of glutamine to the genetic code2006

    • Author(s)
      Oshikane, H. et al.
    • Journal Title

      Science 312

      Pages: 1950-1954

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction of SecDF, a translocon-associated membrane protein, from Thermus thermophilus2006

    • Author(s)
      Tsukazaki, T. et al.
    • Journal Title

      Acta Crystallogr. F 62

      Pages: 376-380

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray analysis of tRNA thiolation enzyme MnmA from Escherichia coli complexed with tRNA^<Glu>2006

    • Author(s)
      Numata, T. et al.
    • Journal Title

      Acta Crystallogr. F 62

      Pages: 368-371

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] A fifth protein subunit Ph1496p elevates the optimum temperature for the ribonuclease P activity from Pyrococcus horikoshii OT32006

    • Author(s)
      Fukuhara, H. et al.
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 343

      Pages: 956-964

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] tRNAチオ化修飾酵素によるアンチコドンウリジン硫化反応における構造的基盤の解明2006

    • Author(s)
      沼田 倫征, 濡 木理
    • Journal Title

      細胞工学 25

      Pages: 1176-1177

    • Related Report
      2006 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2016-04-21  

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