Analysis of chromatin structure in degenerating neurons
| Project/Area Number |
18H02723
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 51030:Pathophysiologic neuroscience-related
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| Research Institution | Doshisha University |
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Principal Investigator |
山中 智行 同志社大学, 研究開発推進機構, 准教授 (00381575)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
貫名 信行 同志社大学, 脳科学研究科, 教授 (10134595)
岩田 淳 地方独立行政法人東京都健康長寿医療センター(東京都健康長寿医療センター研究所), 東京都健康長寿医療センター研究所, 研究員 (40401038)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2021)
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| Budget Amount *help |
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Fiscal Year 2020: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Fiscal Year 2019: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2018: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
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| Keywords | 神経変性疾患 / ハンチントン病 / クロマチン構造 / クロマチン免疫沈降 / 次世代シーケンス解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
ハンチントン病等のポリグルタミン病は、唯一核内に病因タンパク質の重合体（核内封入体）が形成される神経変性疾患である。神経細胞核内の機能異常がその疾患進行に関わっていると考えられ、実際、数千もの遺伝子が発現変化することが見出されている。これまでに、我々を含めた研究グループから、NF-Yなどいくつかの転写調節因子がハンチンチン封入体に取り込まれ、活性阻害されることが報告されている（Yamanaka T et al. EMBO J 2008, Hum Mol Genet 2010、PLoS ONE 2014 etc）。これらの結果は遺伝子発現異常による神経変性機構を一部説明するものであるが、これまで同定された約20個の転写調節因子では多大な遺伝子発現変化は説明できていない。すなわち、よりダイナミックな核内変化が存在すると予想される。本研究では、ハンチントン病の核内封入体を指標に変性神経細胞の細胞核を単離する方法を確立し、世界で初めて最新ゲノム技術を用いた変性神経細胞での包括的クロマチン構造解析を行うことにより、神経変性に関わる新規病態メカニズムを明らかにする。本年度は、ハンチントン病モデルマウス脳からセルソーターにて単離した神経細胞核を用いて、抗修飾ヒストン抗体でクロマチン免疫沈降、及び次世代シーケンス解析を行った。その結果、神経関連遺伝子などのプロモータ領域が選択的に濃縮されていることが確認され、実験系は確立されつつある。一方、ハンチンチン凝集体に結合する転写因子NF-Yについて、マウスを用いて、その中枢神経系におけるさらなる機能解析を行い、日本細胞生物学会にて口頭発表を行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
単離した神経細胞核を用いたクロマチン免疫沈降－次世代シーケンス解析（ChIP-seq）ができるようになってきており、現在ハンチントン病モデルマウスでも同様の解析を進めている。ただ、抗体によっては得られるゲノムDNA量が解析に不十分であり、より効率的な実験系を模索している。
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| Strategy for Future Research Activity |
実験系の調整を進め、より効率的なクロマチン免疫沈降法を確立する。これを用いて、ハンチントン病モデルマウスでクロマチンChIP-seqを行い、NF-Yなどの疾患関連因子や修飾ヒストンのゲノムDNA結合領域を網羅的に特定する。さらに、3C法などを用いてクロマチンの構造変化を検討する。
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Report
(2 results)
Research Products
(15 results)
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[Journal Article] Rapid dissemination of alpha-synuclein seeds through neural circuits in an in-vivo prion-like seeding experiment2018
Author(s)
Okuzumi, A., Kurosawa, M., Hatano, T., Takanashi, M., Nojiri, S., Fukuhara, T., Yamanaka, T., Miyazaki, H., Yoshinaga, S., Furukawa, Y., Shimogori, T., Hattori, N., Nukina, N.
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Journal Title
Acta Neuropathol Commun
Volume: 6
Pages: 96-96
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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