• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

軟体部の進化から,頭足類の繁栄と多様性をもたらした殻形成と遊泳機能に迫る

Research Project

Project/Area Number 18J00750
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Stratigraphy/Paleontology
Research InstitutionHokkaido University
Research Fellow 竹田 裕介  北海道大学, 理学研究院, 特別研究員(PD)
Project Period (FY) 2018-04-25 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords古生物学 / 形態学 / 頭足類 / イメージング / 解剖学 / 古生態 / 形態 / 軟体動物
Outline of Annual Research Achievements

前年度までの研究で,トモグラフィ装置を用いて炭酸塩岩試料を分析,データの解析を行った結果,一部のアンモナイト化石個体の住房内には,紫外線自家蛍光像で明瞭に観察される構造物が存在することが明らかになった.しかしながら,解像度が低く,詳細な可視化と考察が困難だった.そこで今年度は,前年度よりも解像度の高いトモグラフィデータを解析・可視化して研究を進めた.更に,紫外~可視光の複数波長の光源およびフィルターを用いたトモグラフィデータを取得し,化石中の特定の構造(鉱物)をハイコントラストに捉えたデータを取得した.これらのデータを大規模計算資源を用いて画像解析・可視化した結果,岩石中の頭足類化石の外骨格(貝殻)および内部構造をこれまでになく高解像度に認識することに成功した.
さらに,これらの高解像トモグラフィ画像データをオーバービューしたところ,軟体部に由来すると解釈される構造が貝殻内部に認められる頭足類個体も多数存在することが明らかになった.しかしながら,データの量が莫大なため,これらを手作業でペンタブレットなどを使って各個体を網羅的に抽出・カウント・観察することは現実的ではなく,見落としが発生する可能性が高い.そこで,機械学習を用いた化石個体の自動抽出を行うことで,岩石中の頭足類化石個体の網羅的な抽出およびその形態解析を行った.その結果,画像中の生物化石をグルーピングして,元の画像から頭足類化石のみをトリミングして取り出す処理も行うことで,頭足類化石を高速かつ効率的に抽出することができた.

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report

Research Products

(6 results)

All 2021 2020 2018 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] 3D Visualization of Calcified and Non-calcified Molluscan Tissues Using Computed Tomography2018

    • Author(s)
      Sasaki Takenori、Maekawa Yu、Takeda Yusuke、Atsushiba Maki、Chen Chong、Noshita Koji、Uesugi Kentaro、Hoshino Masato
    • Journal Title

      Biomineralization: From Molecular and Nano-structural Analyses to Environmental Science

      Volume: - Pages: 83-93

    • DOI

      10.1007/978-981-13-1002-7_9

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] JSS3大規模チャレンジによる大規模画像データの3次元可視化2021

    • Author(s)
      竹田 裕介,田井中一貴,星野健,深井稜汰,臼井寛裕,笹木慎太郎,池上森,伊庭靖弘
    • Organizer
      第53回流体力学講演会/第39回航空数値シミュレーション技術シンポジウム
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 次世代トモグラフィ技術による形態情報の多次元デジタル化2020

    • Author(s)
      竹田裕介,笹木慎太郎,池上森,久保田彩,西田治文,伊庭靖弘
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第63回シンポジウム
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] X線CTでアンモナイトの顎化石を解剖する:形態から化学組成まで2020

    • Author(s)
      竹田裕介
    • Organizer
      社会・文化利用課題成果報告会/第40回SPring-8先端利用技術ワークショップ
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 結晶学的性質からみた軟体動物頭足類の隔壁構造2018

    • Author(s)
      竹田裕介
    • Organizer
      第13回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Invited
  • [Remarks] 研究者が作成したwebページ

    • URL

      https://ytakeda-paleo.github.io/

    • Related Report
      2020 Annual Research Report 2019 Annual Research Report

URL: 

Published: 2018-05-01   Modified: 2021-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi