| Project/Area Number |
18K06093
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 43020:Structural biochemistry-related
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| Research Institution | Musashino University |
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Principal Investigator |
桑迫 香奈子 武蔵野大学, 薬学部, 講師 (10568736)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
井上 裕介 群馬大学, 大学院理工学府, 教授 (90304302)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2023-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2021)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2019: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2018: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
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| Keywords | mRNAスプライシング / 結晶化 / pre-mRNAスプライシング / 構造生物学 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
特定のスプライシング制御蛋白質が，アポトーシス誘導に関わる遺伝子の選択的スプライシングを制御することで，がん化の抑制に寄与すると考えられている。しかし，実際に，この蛋白質が選択的スプライシングを制御する遺伝子の数や種類，標的配列とその認識機構は未知である。そこで，本研究では，まずは立体構造解析によって，この蛋白質によるスプライシング制御メカニズムを明らかにすることを目的とする。
この蛋白質にはN末端側にRNA結合ドメインが3つあり，この部分が協動的にRNA結合を担っていると考えられる。そこで，この部分の蛋白質（以下トリプルドメイン）と標的配列を含むRNA断片との共結晶の作製を試みている。昨年度，トリプルドメインの調製に関しては，無細胞蛋白質合成系に特定の界面活性剤を添加することで，最終的に，安定した収量が得られることを見出した。今年度は，この方法で調製したトリプルドメインに標的配列を含むRNA断片を混合して結晶化スクリーニングを行った。まず，シッティングドロップ法で384条件スクリーニングを行った。さらに，微結晶が生じた条件についてはハンギングドロップ法で再現性を確認した。しかしながら，微結晶を生じさせることはできず，再現できなかった。今後は，シッティングドロップ法で微結晶を再現できるかを確認するとともに，トリプルドメインのコンストラクトを変えて立体構造解析に適した結晶が得られるよう，スクリーニングを進めていく予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
新型コロナの流行に伴い，研究活動に制限があったため。
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| Strategy for Future Research Activity |
新型コロナの感染防止に留意しながら，次年度は，より精力的に研究活動を継続していきたい。
主に，トリプルドメインのコンストラクトについて検討する。N末端側とC末端側だけでなく，ドメイン間のリンカー部分についても検討する予定である。
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