Speciation in the open ocean: how aquatic amniotes have diverged underwater
| Project/Area Number |
18K06378
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 45030:Biodiversity and systematics-related
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
岸田 拓士 京都大学, 野生動物研究センター, 特定助教 (40527892)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2019)
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| Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2020: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
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| Keywords | 種分化 / エラブウミヘビ / 遺伝子浸透 / 集団ゲノミクス / 鯨類 / 海産羊膜類 / Kogia |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本年度は、主にウミヘビ類の海洋における種分化に着目して、集団ゲノミクスの観点から解析を行った。ウミヘビ類は２つの単系統群：真ウミヘビ類とエラブウミヘビ類から構成されている。どちらのグループも今から５００万年ほど前に海洋環境へと進出しており、生息地もほぼ重複しているが、両者の種多様性は著しく異なる。真ウミヘビ類は６０種以上が記載されている一方で、エラブウミヘビ類はわずか８種しか記載されていない。
本年度は、エラブウミヘビ類に関して、彼らの分布の南北両端に位置する沖縄とバヌアツで採集した複数個体のゲノム全長をショットガンシークエンスによって解読して解析した。その結果、彼らのゲノムには著しい種間交雑が確認された。エラブウミヘビ類は海洋環境への進出後ほとんど種分化していない分類群だが、その原因として、こうした遺伝的な交雑のしやすさが挙げられると推察された。染色体数などが種を超えて保存されている点が、その理由の一つであろう。その一方で、エラブウミヘビ類とは逆に著しい種分化の確認されている真ウミヘビ類のゲノムには、種間交雑の痕跡はほとんど確認されない。
上記の結果に関しては、その一部を英文論文にまとめて専門誌に投稿中であり、近日中に公表されるものと期待している。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
本年度3月から2020年度4月にかけて、コマッコウに関する共同研究を行うために米国に渡航予定であったが、COVID-19パンデミックの影響により、渡航が延期された。本稿執筆現時点においてもなおCOVID-19は収束しておらず、このため共同研究を再開する目途はたっていない。
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| Strategy for Future Research Activity |
COVID-19が収束しだい、米国に渡航してコマッコウの組織化学的解析およびゲノムシークエンスを行う予定である。平行して、真ウミヘビ類に関する集団ゲノミクス解析も進めていく。2020年度は本科研費の最終年度であるため、得られた結果を複数の論文にまとめて、専門誌に投稿予定である。
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Report
(2 results)
Research Products
(7 results)
