Regulatory mechanism analysis of structural transformation of RNA polymerase II by General Transcription Factor
| Project/Area Number |
18K06654
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 47030:Pharmaceutical hygiene and biochemistry-related
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| Research Institution | University of Toyama |
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Principal Investigator |
田中 亜紀 富山大学, 学術研究部薬学・和漢系, 助教 (50432109)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2021)
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| Budget Amount *help |
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2020: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
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| Keywords | RNAポリメラーゼ / 基本転写因子TFIIE / クランプ領域 / 基本転写因子TFIIB / 転写開始から伸長への移行 / 基本転写因子 / ＲＮＡポリメラーゼ / ＴＦＩＩＥ / 遺伝子発現制御 / RNAポリメラーゼの構造変換 / 生化学 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、RNAポリメラーゼの構造変換を制御する因子が、開始から伸長への移行段階でどのように入れ替わり、転写活性を制御しているのか解明することを目指している。
真核生物RNAポリメラーゼII（Pol II）は、転写開始段階では基本転写因子（TFIIB, -D, -E, -F, -H）と共に転写開始複合体(PIC)を形成する。一方、伸長段階では、DSIFやPAF1といった転写伸長因子がPol IIと結合して、転写伸長を制御する。近年のPol IIと制御因子群からなる複合体の構造解析から、TFIIEとDSIFはPol IIの同じ二つの領域（クランプとストーク）に結合することが明らかとなった。そこでPICを形成する基本転写因子の各サブユニットとDSIFの結合実験を行った。その結果、DSIFはTFIIHのサブユニットであるp62とXPBに強く結合し、TFIIEβとも結合した。p62はコアTFIIHの構造を安定化するサブユニットである。N末端にPHドメインを有しており、このドメインはTFIIEαの酸性領域との結合に必要な領域であり、転写開始から伸長への移行段階に重要な領域であることを、以前に我々は報告している。DSIFとp62の欠失変異体による結合実験を行った結果、p62 PHドメインを含む変異体と結合した。TFIIEα酸性領域とp62 PHドメインの結合は、DSIFのサブユニットであるSPT5の酸性領域により競合的に阻害された。これらの結果は、転写開始から伸長への移行過程において、PIC内でTFIIHのp62が足場となって、TFIIEとDSIFの入れ替わりを調節している可能性が示唆された。
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Report
(4 results)
Research Products
(14 results)
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[Presentation] Regulation of gene expression by the phosphorylated CTD interacting factor PCIF12021
Author(s)
Ryoya Kano, Ai Sugita, Soichiro Kuruma, Shiori Toyama, Shiho Ito, Hiroyasu Ishiguro, Aki Tanaka, Shinichiro Akichika, Tsutomu Suzuki, Yoshiaki Tabuchi, Yoshiaki Ohkuma, Yutaka Hirose
Organizer
第22回日本RNA学会年会
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Ryoya Kano, Ai Sugita, Soichiro Kuruma, Shiori Toyama, Shiho Ito, Hiroyasu Ishiguro, Aki Tanaka, Shinichiro Akichika, Tsutomu Suzuki, Yoshiaki Tabuchi, Yoshiaki Ohkuma, Yutaka Hirose
Organizer
6th Toyama-Basel Joint Syposium 2021 September 15-16
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[Presentation] リン酸化CTD結合RNAメチル化酵素PCIF1による遺伝子発現調節2021
Author(s)
神尾凌哉, 杉田愛, 車奏一朗, 外山詩織, 伊藤志帆, 石黒尋保, 田中亜紀, 穐近慎一郎, 鈴木勉, 田渕圭章, 大熊芳明, 廣瀬豊
Organizer
第44回日本分子生物学会年会
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