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Regulatory mechanism analysis of structural transformation of RNA polymerase II by General Transcription Factor

Research Project

Project/Area Number 18K06654
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 47030:Pharmaceutical hygiene and biochemistry-related
Research InstitutionUniversity of Toyama

Principal Investigator

田中 亜紀  富山大学, 学術研究部薬学・和漢系, 助教 (50432109)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2020: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
KeywordsRNAポリメラーゼ / 基本転写因子TFIIE / クランプ領域 / 基本転写因子TFIIB / 転写開始から伸長への移行 / 基本転写因子 / RNAポリメラーゼ / TFIIE / 遺伝子発現制御 / RNAポリメラーゼの構造変換 / 生化学
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、RNAポリメラーゼの構造変換を制御する因子が、開始から伸長への移行段階でどのように入れ替わり、転写活性を制御しているのか解明することを目指している。
真核生物RNAポリメラーゼII(Pol II)は、転写開始段階では基本転写因子(TFIIB, -D, -E, -F, -H)と共に転写開始複合体(PIC)を形成する。一方、伸長段階では、DSIFやPAF1といった転写伸長因子がPol IIと結合して、転写伸長を制御する。近年のPol IIと制御因子群からなる複合体の構造解析から、TFIIEとDSIFはPol IIの同じ二つの領域(クランプとストーク)に結合することが明らかとなった。そこでPICを形成する基本転写因子の各サブユニットとDSIFの結合実験を行った。その結果、DSIFはTFIIHのサブユニットであるp62とXPBに強く結合し、TFIIEβとも結合した。p62はコアTFIIHの構造を安定化するサブユニットである。N末端にPHドメインを有しており、このドメインはTFIIEαの酸性領域との結合に必要な領域であり、転写開始から伸長への移行段階に重要な領域であることを、以前に我々は報告している。DSIFとp62の欠失変異体による結合実験を行った結果、p62 PHドメインを含む変異体と結合した。TFIIEα酸性領域とp62 PHドメインの結合は、DSIFのサブユニットであるSPT5の酸性領域により競合的に阻害された。これらの結果は、転写開始から伸長への移行過程において、PIC内でTFIIHのp62が足場となって、TFIIEとDSIFの入れ替わりを調節している可能性が示唆された。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • 2018 Research-status Report

Research Products

(14 results)

All 2021 2020 2019 2018

All Presentation (14 results)

  • [Presentation] Regulation of gene expression by the phosphorylated CTD interacting factor PCIF12021

    • Author(s)
      Ryoya Kano, Ai Sugita, Soichiro Kuruma, Shiori Toyama, Shiho Ito, Hiroyasu Ishiguro, Aki Tanaka, Shinichiro Akichika, Tsutomu Suzuki, Yoshiaki Tabuchi, Yoshiaki Ohkuma, Yutaka Hirose
    • Organizer
      第22回日本RNA学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Regulation of gene expression by the phosphorylated CTD interacting factor PCIF12021

    • Author(s)
      Ryoya Kano, Ai Sugita, Soichiro Kuruma, Shiori Toyama, Shiho Ito, Hiroyasu Ishiguro, Aki Tanaka, Shinichiro Akichika, Tsutomu Suzuki, Yoshiaki Tabuchi, Yoshiaki Ohkuma, Yutaka Hirose
    • Organizer
      6th Toyama-Basel Joint Syposium 2021 September 15-16
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] RNAポリメラーゼIIによる転写開始から伸長への移行過程の制御機構解析2021

    • Author(s)
      田中亜紀、依田ちづる、平山翼、廣瀬豊、大熊義明
    • Organizer
      第94回日本生化学大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] リン酸化CTD結合RNAメチル化酵素PCIF1による遺伝子発現調節2021

    • Author(s)
      神尾凌哉, 杉田愛, 車奏一朗, 外山詩織, 伊藤志帆, 石黒尋保, 田中亜紀, 穐近慎一郎, 鈴木勉, 田渕圭章, 大熊芳明, 廣瀬豊
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] メディエーター複合体キナーゼCDK8/19とクロマチン制御因子CHD3/4の相互作用を介した転写制御機構の解析2021

    • Author(s)
      中山皓介、前田将大、藤田智陽、安倍光姫、山崎愛実、深澤力也、田中亜紀、大熊芳明、廣瀬豊
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 試験管内再構成系を用いたヒトメディエーター複合体Kinaseモジュールの生化学的機能解析2021

    • Author(s)
      海戸優作、小黒真夢、原子空、林裕人、田中亜紀、大熊芳明、廣瀬豊
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 試験管内再構成系を用いたヒトメディエーター複合体Kinaseモジュールの生化学的機能解析2020

    • Author(s)
      海戸 優作、原子 空、林 裕人、田中 亜紀、大熊 芳明、廣瀬 豊
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] メディエーター複合体キナーゼCDK8/19はNuRDクロマチンリモデリング複合体サブユニットCHD3/4に結合する2020

    • Author(s)
      中山 皓介、前田 将大、藤田 智陽、安倍 光姫、山崎 愛実、深澤 力也、田中 亜紀、廣瀬 豊、大熊 芳明
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 試験管内再構成系を用いたヒトメディエーター複合体 Kinaseモジュールの機能解析2019

    • Author(s)
      海戸優作 、原子空、丹澤円香、林裕人、藤田智陽、飯田智、田中亜紀、廣瀬豊、大熊芳明
    • Organizer
      日本薬学会北陸支部第131回例会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 試験管内再構成系を用いたヒトメディエーター複合体Kinaseモジュールの機能解析2019

    • Author(s)
      原子 空, 丹澤 円, 林 裕人, 藤田 智陽, 飯田 智, 田中 亜紀, 廣瀬 豊, 大熊 芳明
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] メディエーター複合体キナーゼCDK8/19はNuRDクロマチンリモデリング複合体サブユニットCHD3/4に結合する2019

    • Author(s)
      前田 将大1, 藤田 智陽, 安倍 光姫, 山崎 愛実, 深澤 力也, 田中 亜紀, 廣瀬 豊, 大熊 芳明
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 転写伸長因子DSIFのPol IIへのリクルートにおけるSpt5の酸性領域とp62の関与の検討2018

    • Author(s)
      平山翼、田中亜紀、廣瀬豊、大熊芳明
    • Organizer
      生化学会北陸支部第36回大会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] 試験管内再構成系を用いたヒトメディエーター複合体 Kinase モジュールの機能解析2018

    • Author(s)
      原子空、丹澤円、林裕人、藤田智陽、飯田智、田中亜紀、廣瀬豊、大熊芳明
    • Organizer
      生化学会北陸支部第36回大会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] 転写伸長因子DSIFのPol IIへのリクルートにおけるSpt5酸性領域とTFIIH p62の関与の検討2018

    • Author(s)
      依田ちづる、平山翼、田中亜紀、廣瀬豊、大熊芳明
    • Organizer
      日本薬学会北陸支部第130回例会
    • Related Report
      2018 Research-status Report

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Published: 2018-04-23   Modified: 2022-12-28  

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