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遺伝学的スクリーニングによるがん細胞の脆弱性の同定

Research Project

Project/Area Number 18K06678
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 47030:Pharmaceutical hygiene and biochemistry-related
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

松本 健  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 専任研究員 (60222311)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2023-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywordsがん細胞 / 合成致死遺伝子 / shRNAスクリーニング
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、がん遺伝子やがん抑制遺伝子の発現異常が見られる細胞で、ノックダウン(shRNAライブラリー)スクリーニングおよびノックアウト(CRISPRライブラリー)スクリーニングを行い、これらから得られる候補遺伝子を解析して、がん遺伝子やがん抑制遺伝子との合成致死を示す遺伝子を同定する。これによって、細胞のがん化機構の解明を目指すとともに脆弱性を利用した新たな薬剤標的を見いだすことを目的とする。令和2年度はコロナウイルスパンデミックのため、長期間にわたる実験に取りかかることができなかったので、これまでに得られた結果のデータ解析及び比較的短時間で可能な実験に注力して、研究期間の延長を申請することとした。
1)前年度までに行ったノックダウンスクリーニングのデータ解析を行い、この細胞の増殖に関わる遺伝子をリストアップした。これを、これまでに報告されている増殖必須遺伝子のリストと比較して、この細胞特異的に増殖に関わる遺伝子に絞り込んだ。今後、これらの遺伝子を個別にノックダウンあるいはノックアウトすることによって結果の検証を行う計画である。
2)ノックアウトスクリーニングについては、系の立ち上げのために、前年度までに準備したライブラリーを用いて一倍体細胞を用いた化学遺伝学的スクリーニングを行い、次世代シークエンスまで進めた。この結果を待って、がん抑制遺伝子の発現異常が見られる細胞と野生株でのノックアウトスクリーニングを行う。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

コロナウイルスパンデミックによる遅れはあったが、ノックアウトスクリーニングの準備が整い、ノックダウンスクリーニングの結果が得られたから。

Strategy for Future Research Activity

繰越期間においては、引き続き、ノックアウトスクリーニングを実施する。また、これまでのノックダウンスクリーニングで得られた候補遺伝子についての解析を進め、研究取りまとめを行う。

Report

(2 results)
  • 2020 Research-status Report
  • 2018 Research-status Report

Research Products

(15 results)

All 2021 2020 2018 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] トロント大学(カナダ)

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  • [Journal Article] Role of C1QBP/p32 and its therapeutic potential in breast carcinoma and other cancers2020

    • Author(s)
      Matsumoto Ken、Bay Boon-Huat
    • Journal Title

      Current Medicinal Chemistry

      Volume: 28

    • DOI

      10.2174/0929867328666201231124038

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      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Y-box protein-associated acidic protein (YBAP1/C1QBP) affects the localization and cytoplasmic functions of YB-12018

    • Author(s)
      Matsumoto Ken、Kose Shingo、Kuwahara Iku、Yoshimura Mami、Imamoto Naoko、Yoshida Minoru
    • Journal Title

      Sci. Rep.

      Volume: 8 Pages: 6198-6198

    • DOI

      10.1038/s41598-018-24401-3

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      2018 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The gene expression of two endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 isoforms is regulated by distinct posttranscriptional mechanisms2018

    • Author(s)
      Aoki Kazuma、Furuya Akemi、Matsumoto Ken、Tsujimoto Masafumi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 503 Pages: 3180-3185

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2018.08.117

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 網羅的shRNAスクリーニングを用いた、化合物による細胞増殖抑制メカニズムの解明2018

    • Author(s)
      松本 健、高瀬翔平、吉田 稔
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 56 Pages: 649-650

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  • [Presentation] Translational control through the formation of messenger RNPs.2018

    • Author(s)
      Matsumoto, K.
    • Organizer
      IASCBC 2018
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ゲノムワイドshRNAライブラリースクリーニングによるアポトーシス誘導物質JBIR-140の標的経路の解析2018

    • Author(s)
      松本 健
    • Organizer
      日本農芸化学会関東支部2018年度第2回支部例会
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    • Invited
  • [Presentation] Analysis of the mode of action of JBIR-1402018

    • Author(s)
      Matsumoto, K.
    • Organizer
      The 9th Japan-Korea Chemical Biology Symposium
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] JBIR-140の細胞増殖抑制機構の解析2018

    • Author(s)
      松本 健、高瀬翔平、近藤恭光、鈴木健裕、堂前 直、新家一男、長田裕之、久城哲夫、吉田 稔
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第13回年会
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  • [Presentation] 翻訳因子eIF5Aのハイプシン化を阻害するGC7によるミトコンドリア制御2018

    • Author(s)
      松本 健、黒川留美、Tariq, M.、鈴木健裕、堂前 直、伊藤昭博、吉田 稔
    • Organizer
      第41回日本分子生物学会年会
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  • [Book] マウス・ラットモデル作製・解析プロフェッショナル2021

    • Author(s)
      先端モデル動物支援プラットフォーム(AdAMS)
    • Total Pages
      320
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      9784758121125
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  • [Remarks]

    • URL

      http://www2.riken.jp/matsumok/index.html

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  • [Remarks] 研究者ウエブページ

    • URL

      http://www2.riken.jp/matsumok/index.html

    • Related Report
      2018 Research-status Report

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Published: 2018-04-23   Modified: 2022-12-28  

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