• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Elucidation of pathogenic acquisition mechanism from the crystal structure of the collagen-binding proteins of Streptococcus mutans

Research Project

Project/Area Number 18K09735
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 57060:Surgical dentistry-related
Research InstitutionOsaka Medical and Pharmaceutical University

Principal Investigator

平田 あずみ  大阪医科薬科大学, 医学部, 准教授 (40263587)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 高野 和文  京都府立大学, 生命環境科学研究科, 教授 (40346185)
田中 俊一  京都府立大学, 生命環境科学研究科, 准教授 (70591387)
野村 良太  広島大学, 医系科学研究科(歯), 教授 (90437385)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2019: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywordsコラーゲン結合タンパク質 / Streptococcus mutans / 機能解析 / 構造解析 / 組織内局在 / S. mutans / 結晶構造 / 病原性メカニズム / 構造機能解析
Outline of Annual Research Achievements

コラーゲン結合タンパク質Cnm/Cbmとコラーゲンの結合メカニズムを解明する目的で、Cnmコラーゲン結合ドメイン(Cnm_CBD)のX線結晶構造解析を行った。Cnm_CBDはStaphylococcus aureus由来Cna(既報)とのアミノ酸配列の相同性が54%にもかかわらず、それらの結晶構造は類似していることが明らかとなった。また、Cnm_CBDを構成する4つのドメイン領域、N1、Linker、N2、Latchのうち、N1、N2がコラーゲン分子を環状に取り巻き、LatchがN1にクラスプを掛けるring構造をとることによりコラーゲンと結合することが明らかとなった。また、SWISS-MODELにより作製したmodel Cbm_CBDはCnm_CBDと酷似していることから、Cnm_CBDと同様、ring構造によりコラーゲンと結合することが示唆された。さらに、Cnm_CBDとコラーゲンの結合はN2のY175とF191とコラーゲン分子のプロリンとの分子間相互作用によることが明らかとなった。Y175とF191はCnm、Cbmに加え、Cna、Enterococcus faecalis由来Aceにも共通して保存されており、Y175とF191がコラーゲンとの結合に重要であることが示唆された。また、Cbm_CBDの組換え変異体を作製し、それらの熱安定性とコラーゲン結合活性を測定した。これらの解析結果より、Cbm_CBD 4つのドメインは、N1:コラーゲンとの結合に寄与する、Linker:N1、N2を補助しコラーゲン結合を支持する、N2:構造安定性、コラーゲンとの結合において中心的役割を担う、Latch:N2を補助し、N2と相互作用することでコラーゲン結合を支持するという役割をそれぞれ担うことが明らかとなった。これまでに得たこれらの成果を発表するため、本年は主として論文執筆に取り組んだ。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

①Cbm_N2-N2~の結晶獲得には至っていない。
②論文により成果を発表した。

Strategy for Future Research Activity

①結晶化条件の見直しを行い、Cbm_N2-N2~の結晶化を継続する。
②論文の採択を目指す。

Report

(6 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • 2018 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2024 2023 2022 2021 2020 2018

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 6 results)

  • [Journal Article] Role of N1-Domain, Linker, N2-Domain, and Latch in the Binding Activity and Stability of the Collagen-Binding Domain for the Collagen-Binding Protein Cbm from Streptococcus mutans2024

    • Author(s)
      Nishi Akari、Hirata Azumi、Mukaiyama Atsushi、Tanaka Shun-ichi、Nomura Ryota、Nakano Kazuhiko、Takano Kazufumi
    • Journal Title

      Physchem

      Volume: 4 Issue: 2 Pages: 120-130

    • DOI

      10.3390/physchem4020009

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structure, Stability and Binding Properties of Collagen-Binding Domains from Streptococcus mutans2023

    • Author(s)
      Nishi Akari、Matsui Hikaru、Hirata Azumi、Mukaiyama Atsushi、Tanaka Shun-ichi、Yoshizawa Takuya、Matsumura Hiroyoshi、Nomura Ryota、Nakano Kazuhiko、Takano Kazufumi
    • Journal Title

      Chemistry

      Volume: 5 Issue: 3 Pages: 1911-1920

    • DOI

      10.3390/chemistry5030130

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Histological and Immunohistochemical Studies to Determine the Mechanism of Cleft Palate Induction after Palatal Fusion in Mice Exposed to TCDD2022

    • Author(s)
      Sakuma C, Imura H, Yamada T, Hirata A, Ikeda Y, Ito M, Natsume N.
    • Journal Title

      Int J Mol Sci.

      Volume: 23(4) Issue: 4 Pages: 2069-2069

    • DOI

      10.3390/ijms23042069

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Exploring mutable conserved sites and fatal non-conserved sites by random mutation of esterase from Sulfolobus tokodaii and subtilisin from Thermococcus kodakarensis2021

    • Author(s)
      Tanaka Shun-ichi、Tsutaki Minami、Yamamoto Seira、Mizutani Hayate、Kurahashi Ryo、Hirata Azumi、Takano Kazufumi
    • Journal Title

      International Journal of Biological Macromolecules

      Volume: 170 Pages: 343-353

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2020.12.171

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Effect of nitrogen gas plasma generated by a fast pulsed power supply using a static induction thyristor on scrapie prion.2020

    • Author(s)
      Sakudo A, Imanishi Y, Hirata A, Koga Y, Shintani H.
    • Journal Title

      Pathogens

      Volume: 9 Issue: 10 Pages: 819-819

    • DOI

      10.3390/pathogens9100819

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Serotonin effectors expressed during palatogenesis: an immunohistochemical study2018

    • Author(s)
      Hirata A, Imura H, Sugahara T, Natsume N, Nakamura H, Kondo Y.
    • Journal Title

      JSM Dent

      Volume: 6 Pages: 1115-1115

    • Related Report
      2018 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access

URL: 

Published: 2018-04-23   Modified: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi