• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

人工核酸によるRNAの検出と精製

Research Project

Project/Area Number 19021034
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

大槻 高史  Okayama University, 大学院・自然科学研究科, 准教授 (80321735)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 北松 瑞生  岡山大学, 大学院・自然科学研究科, 助教 (60379716)
Project Period (FY) 2007 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥4,800,000 (Direct Cost: ¥4,800,000)
Fiscal Year 2008: ¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Fiscal Year 2007: ¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
Keywords人工核酸 / PNA / miRNA / noncoding RNA / アレイ / RNA精製 / ペプチド核酸
Research Abstract

人工核酸の一種であるペプチド核酸(PNA)は、ペプチド骨格に核酸塩基が付いた構造をもつ。PNAの特徴の一つは、相補的なRNAと非常に強く結合することであり、同じ配列のDNAやRNAと比べても格段にRNA結合能が高く、また配列特異性も優れている。本研究では、この特性を生かして、以下の2つの研究を行った。
1) 近年miRNAと呼ばれる小さなRNAが多数存在し、広範な生命機能を制御していることが明らかになり、様々な状態における生体内のmiRNA発現量を調べることが生命科学研究における重要課題となってきた。本研究課題では、PNAがRNAに特異的に強く結合する特性を生かし、miRNAを高感度に検出するためのPNAアレイの開発を行った。様々な状態の細胞、特に様々な疾患におけるmiRNAの発現量を網羅的に調べることは、現在急務になっている。そのため疾患に関係するmiRNAなどを題材としてPNAアレイの能力を検証した。10merのPNAプローブを用いたところ, miRNAの検出によく用いられるDNAプローブ(10merおよび20mer)と比べ, 非常に感度の良い検出が可能になった。
2) RNA混合物の中から単一のRNA種を精製する方法として、PNAを固相担体とする簡便なRNA精製法の開発に取り組んだ。固定化PNA法が、低温で高効率にRNAを単離でき、多くのRNAに拡張できる方法であることを示した。

Report

(2 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (50 results)

All 2009 2008 2007

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (35 results) Book (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (3 results)

  • [Journal Article] PNA arrays for miRNA detection2009

    • Author(s)
      Endoh, T., Kitamatsu, M., Sisido M. and Ohtsuki, T.
    • Journal Title

      Chemistry Letters 38

      Pages: 438-439

    • NAID

      10025121754

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 細胞内侵入性RNA結合蛋白質によるRNAデリバリー2009

    • Author(s)
      大槻高史
    • Journal Title

      高分子 58(3)

      Pages: 140-141

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Journal Article] キャリアペプチドによるRNAの細胞内導入法2009

    • Author(s)
      大槻高史, 遠藤玉樹
    • Journal Title

      生化学 81(2)

      Pages: 110-112

    • NAID

      10024915881

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Journal Article] Isolation of small RNAs using biotinylated PNAs2008

    • Author(s)
      Ohtsuki, T., Fujimoto, T., Kamimukai, M., Kumano, C., Kitamatsu, M., Sisido, M.
    • Journal Title

      Journal of Biochemistry 144

      Pages: 415-418

    • NAID

      10024912545

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Modified uridines with C5-methylene substituents at the first position of the tRNA anticodon stabilize U. G wobble pairing during decoding2008

    • Author(s)
      Kurata, S., Weixlbaumer, A., Ohtsuki, T., Wada, T., Kirino, Y., Takai, K., Watanabe, K. Ramakrishnan, V. and Suzuki, T.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 283

      Pages: 18801-18811

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Amino acid sensing using aminoacyl-tRNA synthetase2008

    • Author(s)
      Kugimiya, A., Morii, M. and Ohtsuki, T.
    • Journal Title

      Analytical Biochemistry 378

      Pages: 90-92

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cellular siRNA delivery mediated by a cell-permeant RNA-binding protein and photoinduced RNA interference2008

    • Author(s)
      Endoh, T., Sisido M. and Ohtsuki, T.
    • Journal Title

      Bioconjugate Chemistry 19

      Pages: 1017-1024

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] EF-Tu mutants expand amino acid tolerance of protein bilsynthesis system.2007

    • Author(s)
      Y. Doi, T. Ohtsuki, Y. Shimizu, T. Ueda and M. Sisido
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc. 129

      Pages: 14458-14462

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Photo inducible RNA interference using cell permeable protein carrier.2007

    • Author(s)
      T. Endoh, M. Sisido and T. Ohtsuki
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp. Ser. 51

      Pages: 127-128

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Journal Article] Delivery of dsRNA with lactic acid bacteria for RNA interference.2007

    • Author(s)
      A. Kuwahara, M. Arita. M. Sisido and T. Ohtsuki
    • Journal Title

      Nucleic Acdis Symp. Ser. 51

      Pages: 413-414

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 酵素法を用いるアミノ酸の計測2009

    • Author(s)
      小原香・大槻高史・釘宮章光
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2009-03-27
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] RNAi創薬を目指した新規RNAキャリアの開発2009

    • Author(s)
      大槻高史
    • Organizer
      第2回高度医療都市を創出する未来技術国際シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2009-02-05
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] アルギニン誘導体の蛋白質への位置特異的導入2008

    • Author(s)
      鈴江良隆, 大槻高史, 宍戸昌彦
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-11
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 哺乳細胞を用いた非天然アミノ酸導入蛋白質合成法の開発2008

    • Author(s)
      土井芳朗, 大槻高史, 宍戸昌彦
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-11
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] EF-Tu変異体によるアミノアシルtRNAの精製・定量法2008

    • Author(s)
      山本浩道, 土井芳朗, 大槻高史, 宍戸昌彦
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-11
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA-蛋白質ハイブリッド型FRETプローブを用いた低分子化合物の検出2008

    • Author(s)
      新谷諒、遠藤玉樹、三重正和、小畠英理、大槻高史、宍戸昌彦
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-11
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] tRNA構造との対応関係を越えたショウジョウバエミトコンドリアEF-TuのtRNA認識能2008

    • Author(s)
      佐藤文、末松卓真、大槻高史、渡邊洋一
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-11
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Position specific incorporation of nonnatural amino acids into proteins in vivo2008

    • Author(s)
      Satoshi Neki, Takashi Ohtsuki, and Masahiko Sisido
    • Organizer
      21st Annual and International Meeting of Japanese Association for Animal Cell Technology
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      2008-11-25
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Improvement of CPP-RBD for siRNA delivery2008

    • Author(s)
      Rina Kuwabara, Tamaki Endoh, Masahiko Sisido, and Takashi Ohtsuki
    • Organizer
      21st Annual and International Meeting of Japanese Association for Animal Cell Technology
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      2008-11-25
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞内での非天然アミノ酸導入蛋白質合成法の開発2008

    • Author(s)
      土井芳朗, 大槻高史, 宍戸昌彦
    • Organizer
      第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-09-19
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] EF-Tu変異体を用いた非天然アミノアシルtRNAの精製と定量2008

    • Author(s)
      山本浩道, 土井芳朗, 大槻高史, 宍戸昌彦
    • Organizer
      第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-09-19
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] CLIP-RNAi~photoinduced RNAi strategy~2008

    • Author(s)
      Tamaki Endoh, Masahiko Sisido, Takashi Ohtsuki
    • Organizer
      3rd International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis
    • Place of Presentation
      Zurich (Switzerland)
    • Year and Date
      2008-09-11
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Construction of RNA-protein Hybrid for Bioimaging of Low-molecular Compounds2008

    • Author(s)
      Tamaki Endoh, Ryo Shintani, Masayasu Mie, Eiry Kobatake, Takashi Ohtsuki, Masahiko Sisido
    • Organizer
      3rd International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis
    • Place of Presentation
      Zurich (Switzerland)
    • Year and Date
      2008-09-11
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞内生理活性分子検出のためのRNA-タンパク質ハイブリッド型FRETプローブの構築2008

    • Author(s)
      遠藤玉樹、新谷諒、三重正和、小畠英理、大槻高史、宍戸昌彦
    • Organizer
      第10回RNAミーティング
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2008-07-24
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 蛍光標識CPP-RBPによるRNAiの光誘導2008

    • Author(s)
      遠藤玉樹、宍戸昌彦、大槻高史
    • Organizer
      第10回RNAミーティング
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2008-07-24
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 蛍光標識CPP-RBPによるRNAデリバリーとRNAiの光制御2008

    • Author(s)
      遠藤玉樹、宍戸昌彦、大槻高史
    • Organizer
      遺伝子・デリバリー研究会第8回シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2008-05-09
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 蛍光標識CPP-RBPによるshRNAの細胞内導入と遺伝子発現の光制御2008

    • Author(s)
      遠藤玉樹、宍戸昌彦、大槻高史
    • Organizer
      日本化学会第88春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-03-29
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA-蛋白質ハイブリッド型FRETプローブによる低分手化合物の検出2008

    • Author(s)
      新谷諒、遠藤玉樹、大槻高史、三重正和、小畠英理、宍戸昌彦
    • Organizer
      日本化学会第88春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-03-27
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 酵素反応を用いるアミノ酸の蛍光分析2008

    • Author(s)
      小原香、大槻高史、釘宮章光
    • Organizer
      日本化学会第88春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-03-27
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] アセチル化アミノ酸やメチル化アミノ酸の蛋自質への位置特異的導入2007

    • Author(s)
      鈴江良隆、大槻高史、宍戸昌彦
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-14
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 生細胞内における蛋自質への位置特異的な蛍光基導入法の開発2007

    • Author(s)
      増田一晶、根木慧史、大槻高史、宍戸昌彦
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-14
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 改変EF-Tuによる蛋白質への非天然アミノ酸高効率導入2007

    • Author(s)
      土井芳朗、大槻高史、清水義宏、上田卓也、宍戸昌彦
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-12
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Photo inducible RNA interference using cell permeable pratein carrier2007

    • Author(s)
      T. Endoh, M. Sisido and T. Ohtsuki
    • Organizer
      5th International Symposium Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      Tokyo
    • Year and Date
      2007-11-22
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Delivery of dsRNA with lactic acid bacteria for RNA interference2007

    • Author(s)
      A. Kuwahara, M. Arita, M. Sisido and T. Ohtsuki
    • Organizer
      5th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      Tokyo
    • Year and Date
      2007-11-20
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 蛋白質キャリアによるsiRNAの細胞内導入とRNAiの光誘導2007

    • Author(s)
      大槻高史
    • Organizer
      第212回バイオロンジル会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2007-10-30
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA interference using cell permeable protein carrier2007

    • Author(s)
      T. Endoh. M. Sisido and T. Ohtsuki
    • Organizer
      4th International Peptide Symposium
    • Place of Presentation
      Cairns (Australia)
    • Year and Date
      2007-10-24
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Incorporation of large nonnatural amino acids into protein by translation with EF-Tu mutants2007

    • Author(s)
      Y. Doi. T. Ohtsuki. Y. Shimizu. T. Ueda and M. Sisido
    • Organizer
      4th International Peptide Symposium
    • Place of Presentation
      Cairns (Australia)
    • Year and Date
      2007-10-22
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 蛍光標識Tat融合RNA結合タンパク質を用いたsiRNAの細胞内導入とRNAiの光制御2007

    • Author(s)
      遠藤玉樹、宍戸昌彦、大槻高史
    • Organizer
      第22回生体機能関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-09-28
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] リボソ-ムを用いたβ-ペプチド合成に向けたアプローチ:主鎖伸長型基質導入に関与するファクター2007

    • Author(s)
      水澤圭吾、阿部健二、山東信介、土井芳朗、大槻高史、宍戸昌彦、青山安宏
    • Organizer
      第22回生体機能関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-09-28
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 改変EF-Tuを用いた翻訳系の拡張2007

    • Author(s)
      大槻高史、土井芳朗、宍戸昌彦
    • Organizer
      第22回生体機能関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-09-28
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA isolation using biotinylated PNAs2007

    • Author(s)
      T. Ohtsuki, T. Fujimoto. M. Kamimukai, M. Kitamatsu, M. Sisido
    • Organizer
      The 2nd International Workshop on Approaches to Single Cell Analysis
    • Place of Presentation
      Tokyo
    • Year and Date
      2007-09-06
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] ペプチド核酸-膜透過ペプチドオリゴマーをキャリアーとして用いたsiRNAの細胞内輸送2007

    • Author(s)
      北松瑞生、久保貴紀、大庭英樹、遠藤玉樹、大槻高史、宍戸昌彦
    • Organizer
      第17回バイオ・高分子シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2007-07-31
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Expansion of protein biosynthesis system by EF-Tu mutant.2007

    • Author(s)
      T. Ohtsuki, Y. Doi, Y. Shimizu, T. Ueda and M. Sisido
    • Organizer
      12th annual meeting of RNA society
    • Place of Presentation
      Madison (USA)
    • Year and Date
      2007-06-02
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Cellular delivery and photo-accelerated endosomal escape of siRNA mediated by cell permeable RNA binding protein2007

    • Author(s)
      T. Endoh. M. Sisido and T. Ohtsuki
    • Organizer
      12th annual meeting of RNA society
    • Place of Presentation
      Madison (USA)
    • Year and Date
      2007-05-31
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 蛋白質生合成の非天然アミノ酸許容性の拡張を目的とする変異EF-Tuの作製2007

    • Author(s)
      土井芳朗, 大槻高史, 清水義宏, 上田卓也, 宍戸昌彦
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー第2回年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2007-05-09
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Book] The central dogma : from DNA to MA, and to protein. In Automation in Proteomics and Genomics, eds by G. Alterovitz, R. Benson and M. Ramoni2009

    • Author(s)
      Ohtsuki, T. and Sisido M.
    • Total Pages
      18
    • Publisher
      Wiley
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Book] 化学の指針シリーズ「生物有機化学-ケミカルバイオロジーへの展開-」2008

    • Author(s)
      宍戸昌彦、大槻高史
    • Total Pages
      204
    • Publisher
      裳華房
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 乳酸菌により二本鎖RNAを生成するキット及びその利用2008

    • Inventor(s)
      大槻高史、宍戸昌彦、公文裕巳、柏倉祐司、落合和彦
    • Industrial Property Rights Holder
      岡山大学
    • Filing Date
      2008-10-30
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 修飾型PNA/RNA複合体2007

    • Inventor(s)
      北松瑞生、大槻高史、宍戸昌彦、久保貴紀、大庭英樹
    • Industrial Property Rights Holder
      岡山大学・産業技術総合研究所
    • Industrial Property Number
      2007-037041
    • Filing Date
      2007-02-16
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 乳酸菌において二本鎖RNAを生成するキット及びその利用2007

    • Inventor(s)
      大槻高史、宍戸昌彦
    • Industrial Property Rights Holder
      岡山大学
    • Industrial Property Number
      2007-125919
    • Filing Date
      2007-05-10
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2007-04-01   Modified: 2018-03-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi