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Molecular organization and dynamics in chromatin domains for gene expression control

Research Project

Project/Area Number 19570169
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Molecular biology
Research InstitutionMeisei University

Principal Investigator

SHIMIZU Mitsuhiro  Meisei University, 理工学部, 教授 (80231364)

Research Collaborator MITCHELL Aaron P.  米国カーネーギーメロン大学, 教授
KURUMIZAKA Hitoshi  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (80300870)
MOROHASHI Nobuyuki  明星大学, 大学院・理工学研究科・博士後期課程
ITO Sayaka  明星大学, 大学院・理工学研究科・博士前期課程
KANBA Kohei  明星大学, 大学院・理工学研究科・博士前期課程
HAYAKAWA Shin-ichi  明星大学, 大学院・理工学研究科・博士前期課程
FUJITA Masashi  明星大学, 大学院・理工学研究科・博士前期課程
Project Period (FY) 2007 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2008: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2007: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywordsゲノム / 遺伝子 / 発現制御 / 転写制御 / クロマチン / ヌクレオソーム / ヒストン / 酵母
Research Abstract

真核生物のゲノムDNAはヒストンと結合し、ヌクレオソーム、クロマチンとして核内に収納されている。遺伝子発現におけるクロマチンの機能を明らかにすることを目的として、まず、ヒト由来His_6タグ付ヒストンH3バリアントを酵母で発現させ、それを含む酵母ミニ染色体を容易に精製する系を構築した。さらに、ゲノム遺伝子座におけるヌクレオソーム配置のダイナミックな変化が、転写制御に本質的な機能を有することを示した。

Report

(3 results)
  • 2008 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (43 results)

All 2009 2008 2007 Other

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (31 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Solution Structures and DNA Binding Properties of the N-terminal SAP Domains of SUMO E3 Ligases from Saccharomyces cerevisiae and Oryza sativa2009

    • Author(s)
      Rintaro Suzuki, Heisaburo Shindo, Akira Tase Yoshiko Kikuchi, Mitsuhiro Shimizu, Toshimasa Yamazaki
    • Journal Title

      PROTEINS 75

      Pages: 336-347

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    • Author(s)
      Nobuyuki Morohashi, Kumiko Nakajima, Shunsuke Kuwana, Hiroaki Tachiwana, Hitoshi Kurumizaka, Mitsuhiro Shimizu
    • Journal Title

      Biol.Pharm.Bull. 31

      Pages: 187-192

    • NAID

      110006570553

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      Masafumi Nishizawa, Tae Komai, Nobuyuki Morohashi, Mitsuhiro Shimizu, Akio Toh-e
    • Journal Title

      Eukaryotic Cell 7

      Pages: 949-957

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    • Author(s)
      Kensuke Miki, Mitsuhiro Shimizu, Fujii, M., Hossain, M. N., Dai Ayusawa
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res.Commun. 368

      Pages: 662-669

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      Pages: 662-669

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      Nobuyuki Morohashi, Kumiko Nakajima, Daichi Kurihara, Yukio Mukai, Aaron P. Mitchell, Mitsuhiro Shimizu
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      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会
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  • [Presentation] 酵母ゲノムにおけるヌクレオソームの構造一機能解析2008

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      東京都、タワーホール船堀
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      Nobuyuki Morohashi, Kumiko Nakajima, Aaron, P. Mitchell, Mitsuhiro Shimizu
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      Cold Spring Harbor Meeting on Mechanisms of Eukaryotic Transcription
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      Cold Spring Harbor, New York, USA
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      清水光弘, 諸橋伸行, 森智, 神庭昂平, 大山隆
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      第30回目本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
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      諸橋 伸行、中島 久美子、A.P.Mitchell、清水 光弘
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      伊藤 沙弥香、栗原 大地、諸橋 伸行、A.P.Mitchell、清水 光弘
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
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  • [Presentation] クロマチン工学による出芽酵母ゲノムPHO5遺伝子の人為的発現制御2007

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      神庭 昂平、森 智、諸橋 伸行、清水 光弘
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      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
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      横浜
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  • [Book] ベーシックマスター生化学2008

    • Author(s)
      大山隆, 監修, 西川一八, 清水光弘, 共編
    • Publisher
      オーム社
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  • [Remarks]

    • URL

      http://www.hino.meisei-u.ac.jp/chem/staff/05Shimizu.html

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    • URL

      http://www.hino.meisei-u.ac.jp/chem/staff/05Shimizu.html

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Published: 2007-04-01   Modified: 2016-04-21  

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