Comparative analysis of expression profiles of counterpart gene sets between Brassica rapa and Arabidopsis thaliana
Project/Area Number |
19580053
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Single-year Grants |
Section | 一般 |
Research Field |
Plant pathology
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Research Institution | Research Institute for Biological Science Okayama |
Principal Investigator |
NARUSAKA Yoshihiro Research Institute for Biological Science Okayama, 研究員 (20335459)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
ABE Hiroshi 理化学研究所, 実験植物開発室, 研究員 (90360479)
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Project Period (FY) |
2007 – 2008
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2008)
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Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2007: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
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Keywords | 遺伝子 / シグナル伝達 / ストレス / マイクロアレイ / 比較ゲノム / アブラナ科 / ハクサイ / シロイヌナズナ |
Research Abstract |
モデル実験植物から農作物への技術移管のモデルケースを提案することを目的として、ゲノム配列が明かになっているシロイヌナズナとアブラナ科作物のハクサイについて遺伝子レベルでの比較解析を行った。ハクサイの遺伝子ライブラリーを作成して2000個以上のハクサイ遺伝子を得、これら遺伝子を用いてマイクロアレイを作製し、遺伝子発現解析を行った。その結果、両植物間で機能が類似する遺伝子の存在が示唆され、技術移管に向けた重要なデータが得られた。
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Report
(3 results)
Research Products
(44 results)
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[Journal Article] Gene coding for SigA-binding protein from Arabidopsis appears to be transcriptionally upregulated by salicylic acid and NPR1-dependent mechanisms2008
Author(s)
Narusaka, M., Kawai, K., Izawa, N., Seki, M., Shinozaki, K., Seo, S., Kobayashi, M., Shiraishi, T., Narusaka, Y.
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Journal Title
Journal of General Plant Pathology 74
Pages: 345-354
NAID
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Arabidopsis-thrips system for analysis of plant response to insect feeding2008
Author(s)
Abe, H., Ohnishi, J., Narusaka, M., Seo, S., Narusaka, Y., Tsuda, S., Kobayashi, M.
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Journal Title
Plant Signaling & Behavior 3(7)
Pages: 1-2
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Function of jasmonate in response and tolerance of Arabidopsis to thrips feeding2008
Author(s)
Abe, H., Ohnishi, J., Narusaka, M., Seo, S., Narusaka, Y., Tsuda, S., Kobayashi, M.
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Journal Title
Plant Cell Physiol 49
Pages: 68-80
NAID
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[Journal Article] CERK1, a LysM receptor kinase, is essential for chitin elicitorsignaling in Arabidopsis2007
Author(s)
Miya, A., Albert, P., Shinya, T., Desaki, Y., Ichimura, K., Shirasu, K., Narusaka, Y., Kawakami, N., Kaku, H., Shibuya, N.
-
Journal Title
Proc Natl Acad Sci USA 104
Pages: 19613-19618
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[Journal Article] CERK1, a LysM receptor kinase, is essential for chitin elicitor signaling in Arabidopsis.2007
Author(s)
Miya A, Albert P, Shinya T, Desaki Y, Ichimura K, Shirasu K, Narusaka Y, Kawakami N, Kaku H, Shibuya N.
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Journal Title
Proc Natl Acad Sci U S A 104
Pages: 19613-19618
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[Presentation] モデル実験植物シロイヌナズナを用いた植物-昆虫間相互作用研究2009
Author(s)
安部洋, 立石剣, 下田武志, 大西純, 釘宮聡一, 鳴坂真理, 瀬尾茂美, 今野浩太郎, 服部誠, 鳴坂義弘, 津田新哉, 小林正智
Organizer
第53回日本応用動物昆虫学会大会
Place of Presentation
北海道
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Organizer
日本応用動物昆虫学会
Place of Presentation
宇都宮
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[Remarks] 渋谷直人, 宮彩子, 賀来華江, 川上直人, Albert Premkumar, 新屋友規, 出崎能丈, 白須賢, 市村和也, 鳴坂義弘, 「植物の免疫受容体 カビ認識たん白確認」, 化学工業日報, 2007年12月3日掲載