Identification and functional analysis of histone demethylases

• Project/Area Number: 19687007
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Functional biochemistry
• Research Institution: Kyushu University
• Principal Investigator: TSUKADA Yuichi Kyushu University, 生体防御医学研究所, 助教 (90444801)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥17,160,000 (Direct Cost: ¥13,200,000、Indirect Cost: ¥3,960,000); Fiscal Year 2008: ¥8,190,000 (Direct Cost: ¥6,300,000、Indirect Cost: ¥1,890,000); Fiscal Year 2007: ¥8,970,000 (Direct Cost: ¥6,900,000、Indirect Cost: ¥2,070,000)
• Keywords: エピジェネティクス / クロマチン / ゲノム / 発現制御 / 酵素 / エピジェネテクス

Research Abstract

遺伝情報の発現は、"エピジェネティクス"と呼ばれるDNAとヒストンなどのタンパク質から構成されるクロマチンの化学的、構造的な修飾による制御を受けており、これは発生の過程で確立され、その後細胞の記憶として働く。本研究では、このエピジェネティクスの主要な制御因子であるクロマチンの化学修飾を制御する新規のヒストン脱メチル化酵素の同定に成功した。そして、この酵素の機能解析により、遺伝子のサイレンシングに関与する複数のメチル基からの脱メチル化を触媒するという基質特異性を持つこと及び脊椎動物において発生過程における脳形成に関与していることを明らかにした。

Research Products

• [Journal Article] The H3K36 demethylase Jhdm1b/Kdm2b regulates cell proliferation and senescence through p15Ink4b (2008)
  • Author(s): He, J., Kallin, E. M., Tsukada, Y., and Zhang, Y
  • Journal Title: Nat. Struct. Mol. Biol. 15 Pages: 1169-75
• [Journal Article] CHD8 suppresses p53-mediated apoptosis during early embryogenesis (2008)
  • Author(s): Nishiyama, M., Oshikawa, K., Tsukada, Y., Nakagawa, T., Iemura, S., Natsume, T., Fan, Y., Kikuchi, A., Skoultchi, I. A., and Nakayama, K. I.
  • Journal Title: Nat. Cell Biol 11 Pages: 172-82
• [Journal Article] Up-regulation of p21CIP1 expression mediated by ERK-dependent and-independent pathways contributes to hepatocyte growth factor-induced inhibition of HepG2 hepatoma cell proliferation (2008)
  • Author(s): Shirako, E., Hirayama, N., Tsukada, Y., *Tanaka, T., Kitamura, N.
  • Journal Title: J. Cell. Biochem. 104 Pages: 176-88
• [Journal Article] The H3K36 demethylase Jhdmlb/Kdm2b regulates cell proliferation and senescence through p15lnk4b (2008)
  • Author(s): He, J., et.al.
  • Journal Title: Nat. Struct Mol. Biol 15 Pages: 1169-1175
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] CHD8 suppresses p53-mediated apoptosis during early embryogenesis (2008)
  • Author(s): Nishiyama, M., et.al.
  • Journal Title: Nat Cell Biol 11 Pages: 172-182
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] ERK-dependent and-independent pathways contributes to hepatocyte growth factor-induced inhibition of HepG2 hepatoma cell proliferation (2008)
  • Author(s): Shirako, E., et.al.
  • Journal Title: J. Cell. Biochem 104 Pages: 176-188
  • Peer Reviewed
• [Presentation] JHDM1によるヒストンの脱メチル化とユビキチン化の制御 (2007)
  • Author(s): 束田裕一
  • Organizer: 日本分子生物学会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 20071200
• [Presentation] JHDM1によるピストンの脱メチル化とユビキチン化の制御 (2007)
  • Author(s): 束田 裕一
  • Organizer: 日本分子生物学会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-13
• [Book] ヒストンのメチル化と脱メチル化-脱メチル化を中心に-.生化学 (2007)
  • Author(s): 束田裕一
  • Total Pages: 691-697
  • Publisher: 日本生化学会
• [Book] クロマチン免疫沈降法(ChIP).分子間相互作用解析ハンドブック (2007)
  • Author(s): 束田裕一
  • Total Pages: 183-188
  • Publisher: 羊土社,東京
• [Remarks]
  • URL: http://www.bioreg.kyushu-u.ac.jp/saibou/index.html