Development of a method for high-throughput analysisof HiCEP data
Project/Area Number |
19700273
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Research Category |
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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Allocation Type | Single-year Grants |
Research Field |
Bioinformatics/Life informatics
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
KADOTA Koji The University of Tokyo, 大学院・農学生命科学研究科, 特任助教 (60392221)
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Project Period (FY) |
2007 – 2008
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2008)
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Budget Amount *help |
¥1,150,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2008: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2007: ¥500,000 (Direct Cost: ¥500,000)
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Keywords | バイオインフォマティクス / AFLP / HiCEP / マイクロアレイ |
Research Abstract |
HiCEP法は、マイクロアレイなど他の技術では不可能であった未知遺伝子を含む転写物の網羅的単離およびプロファイリングが全ての生物で可能な唯一の実験技術であるが、一次元電気泳動(1-DE)パターン比較に基づく発現プロファイル解析法であるため、データ解析に多くの手間と時間がかかっていた。本研究課題によって開発された手法の適用により、データ解析の大部分において自動化が達成できた。
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Report
(3 results)
Research Products
(38 results)
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[Journal Article] Biochemical and Genomic Analysis of Neoculin Compared to Monocot Mannose-Binding Lectins2008
Author(s)
Shimizu-Ibuka A, Nakai Y, Nakamori K, Morita Y, Nakajima KI, Kadota K, Watanabe H, Okubo S, Terada T, Asakura T, Misaka T, Abe K.
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Journal Title
Journal of Agricultural and Food Chemistry 56(13)
Pages: 5338-5344
Related Report
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[Journal Article] Circadian variations in coagulation and fibrinolytic factors among four different strains of mice2007
Author(s)
Ohkura N, Oishi K, Sakata T, Kadota K, Kasamatsu M, Fukushima N, Kurata A, Tamai Y, Shirai H, Atsumi G Ishida N, Matsuda J, Horie S.
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Journal Title
Chronobiology International 24(4)
Pages: 651-669
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