Analysis of gene regulation for neuronal cell identity

• Project/Area Number: 19710163
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: 基礎ゲノム科学
• Research Institution: Osaka University
• Principal Investigator: HIRAYAMA Teruyoshi Osaka University, 大学院・生命機能研究科, 特任研究員 (40437398)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥3,660,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2008: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2007: ¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
• Keywords: クラスター型遺伝子 / 選択的プロモーター / クラスター型プロトカドヘリン / 中枢神経 / 発現制御機構 / カドヘリン / 神経細胞 / 多様性 / 発現制御 / 遺伝子クラスター / エンハンサー / プロモーター / マウス

Research Abstract

クラスター型プロトカドヘリン(cPcdh)ファミリーは、個々の神経細胞で異なる種類のアイソフォームを発現することから、複雑な神経回路形成に関与することが想定されている。本研究ではcPcdhの遺伝子発現制御機構を明らかにする目的で、特に各cPcdhの第一エキソン上流領域にある保存性の高いエレメント(CSE)に焦点を当て解析をおこなった。その結果、各CSEが異なる転写活性を示し、異なる因子が結合することを示す結果を得た。本結果は、cPcdhの個々の神経細胞における差次的遺伝子発現にCSEの多様化が関与している可能性を強く示唆する。

Research Products

• [Journal Article] Relationship between DNA methylation states and transcription of individual isoforms encoded by the protocadherin-alpha gene cluster. (2008)
  • Author(s): Kawaguchi M, Toyama T, Kaneko R, Hirayama T, Kawamura Y, Yagi T
  • Journal Title: J Biol Chem. 283(18) Pages: 12064-75
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] クラスター型プロトカドヘリンファミリー;多様性創出機構とその機能解明に向けて (2008)
  • Author(s): 平山晃斉、長谷川園子、八木健
  • Journal Title: 蛋白質核酸酵素 53 Pages: 358-364
• [Journal Article] Relationship between DNA methylaation states and transcription of individual isoforms encoded by the protocadherin-alpha gene cluster. (2008)
  • Author(s): Kawaguchi M
  • Journal Title: J Biol Chem. in press
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] クラスター型プロトカドヘリンファミリー 多様性創出機構とその機能解明に向けて (2008)
  • Author(s): 平山晃斉
  • Journal Title: 蛋白質 核酸 酵素 53 Pages: 358-364
• [Presentation] 個々の神経細胞で差次的発現を示すクラスター型プロトカドヘリン遺伝子の発現制御機構の解析 (2008)
  • Author(s): 平山晃斉
  • Organizer: 第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2008-12-11
• [Presentation] 個々の神経細胞で差次的発現を示すクラスター型プロトカドヘリン遺伝子の発現制御機構の解析 (2008)
  • Author(s): 平山晃斉、正木利栄、横田慎一、佐々木綾子、八木健
  • Organizer: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] Identification of an enhancer element for diverse protocadherin-gamma genes which make a gene cluster in genome and whose isoforms are expressed in individual neurons. (2008)
  • Author(s): Yokota S, Hirayama T, Hirabayashi T, Kawamura Y, Yagi T
  • Organizer: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸9999
• [Presentation] プロトカドヘリン-αクラスターにおける差次的発現パターンを制御するメカニズムの解析 (2007)
  • Author(s): 川口将史
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-13
• [Presentation] 脳神経系で発現する多様化膜分子CNR/PcdhαのエンハンサーHS5-1の解析 (2007)
  • Author(s): 村上貴洋
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-13
• [Presentation] プロトカドヘリンα遺伝子クラスターのゲノム構造改変による発現パターン解析 (2007)
  • Author(s): 野口由紀子
  • Organizer: 第30回日本脳神経科学大会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-13
• [Presentation] 脳神経系で発現する多様化膜分子群CNR/PcdhαのエンハンサーHS5-1の解析 (2007)
  • Author(s): 村上貴洋、横田慎一、金子涼輔、平山晃斉、八木健
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] プロトカドヘリン-αクラスターにおけるαC2の発現機構と分子機能の解析 (2007)
  • Author(s): 河村佳見、南ひかる、金子涼輔、平山晃斉、八木健
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] プロトカドヘリン-αクラスターにおける差次的発現パターンを制御するメカニズムの解析 (2007)
  • Author(s): 川口将史、遠山知子、金子涼輔、平山晃斉、河村佳見、八木健
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第8 0回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] クラスター型プロトカドヘリン遺伝子の発現制御機構の解析 (2007)
  • Author(s): 平山晃斉、正木利栄、横田慎一、佐々木綾子、八木健
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] プロトカドヘリンγクラスターにおけるエンハンサー領域の同定 (2007)
  • Author(s): 横田慎一、平山晃斉、八木健
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] プロトカドヘリンα遺伝子クラスターのゲノム構造改変による発現パターン解析 (2007)
  • Author(s): 野口由紀子、河村佳見、平林敬浩、内村有邦、川口将史、香取将太、平山晃斉、八木健
  • Organizer: Neuro 2007第30回日本神経科学大会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] Identification of an enhancer element for diverse protocadherin-gamma genes which make a gene cluster in genome and whose isoforms are expressed in individual neurons.
  • Author(s): Yokota S, Hirayama T, Hirabayashi T, Kawamura Y, Yagi T
  • Organizer: Gordon Reseatch Conference 2008
  • Place of Presentation: Neural Development