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がん細胞浸潤のモデリングと解析と数値シミュレーション

Research Project

Project/Area Number 19F19701
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section外国
Review Section Basic Section 12040:Applied mathematics and statistics-related
Research InstitutionKanazawa University

Principal Investigator

野津 裕史  金沢大学, 数物科学系, 教授 (00588783)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) KOLBE NIKLAS  金沢大学, 数物科学系, 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2019-07-24 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2020: ¥300,000 (Direct Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥500,000 (Direct Cost: ¥500,000)
Keywordsがん細胞浸潤モデル / がん細胞浸潤の数理モデル / Keller-Segel
Outline of Research at the Start

本研究の概要は、がん細胞が広がる現象について、モデリング・解析・数値シミュレーションの国際共同研究を進めることです。効率的かつ数学的信頼性のある数値シミュレーション手法の開発を行った後、がん細胞が広がるモデルの改良とその数値シミュレーションを行う研究です。

Outline of Annual Research Achievements

本研究において、がん細胞が広がる現象について、数値シミュレーションの研究を進めました。特に、効率的かつ数学的信頼性のある数値シミュレーション手法の開発を行いました。本研究で取り組むがん細胞浸潤モデルは、細胞が局所的に集中する効果を持つ、いわゆるケラー・シーゲル型の方程式系です。このモデルを安定かつ高精度に解くためには、細胞が集中する空間的な位置に適切な解像度の節点を配置する必要があります。[J.A. Carrillo, N. Kolbe, and M. Lukacova-Medvid’ova. J. Sci. Comput., 2019]で提案された数値計算スキームはWasserstein測度を用いた興味深いものですが、空間1次元であることを本質的に利用した方程式の変換が行われており、空間多次元への拡張は容易ではありませんでした。我々は、新たにラグランジアン・アダプティブ・ムービング・メッシュ法を開発し、方程式の変換を行わずに、十分な計算精度の結果を得ることに成功しました。空間1次元性を用いないため、2次元への拡張が比較的容易です。汎用的な数値計算スキーム構築のために、2次元では三角形分割を用い、比較的単純な移流を伴う問題に対して有効性を確認しました。有限体積法と組み合わせた、ラグランジアン・アダプティブ・ムービング・メッシュ有限体積スキームの基礎アイデアを構築しました。数値解析を行い、移流問題について、スキームが質量を保存することを示し、また、(メッシュを動かすが細分化・粗化しない場合の)誤差評価も得ました。比較のために、癌の進行と転移において重要な役割を果たすことで知られる uPA モデルについて、1次元での実装を行い、良好な結果を得ました。これらの結果をいくつかの学会において報告しました。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Modeling multiple taxis: Tumor invasion with phenotypic heterogeneity, haptotaxis, and unilateral interspecies repellence2021

    • Author(s)
      Kolbe Niklas、Sfakianakis Nikolaos、Stinner Christian、Surulescu Christina、Lenz Jonas
    • Journal Title

      Discrete & Continuous Dynamical Systems - B

      Volume: 26 Issue: 1 Pages: 443-481

    • DOI

      10.3934/dcdsb.2020284

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] An adaptive Lagrangian Finite-Volume method for convection-diffusion equations2020

    • Author(s)
      Niklas Kolbe and Hirofumi Notsu
    • Organizer
      Czech-Japanese Seminar in Applied Mathematics
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A Lagrangian moving mesh scheme for advection-diffusion equations2020

    • Author(s)
      Niklas Kolbe and Hirofumi Notsu
    • Organizer
      2020年度応用数学合同研究集会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Stochastic modelling of TGF-β signalling in single cells2020

    • Author(s)
      Niklas Kolbe
    • Organizer
      Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A mass transport finite element scheme for chemotaxis models2019

    • Author(s)
      N. Kolbe, M. Lukacova-Medvidova, J.A. Carrillo
    • Organizer
      2019年度 応用数学合同研究集会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Modeling solid tumor growth in tissue2019

    • Author(s)
      N. Kolbe
    • Organizer
      CoMFoS19: Mathematical Aspects of Continuum Mechanics
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2019-07-30   Modified: 2024-03-26  

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