• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Establishment of low-mosaic genome editing technology using plant DNA repair selection systems

Research Project

Project/Area Number 19H02932
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 39010:Science in plant genetics and breeding-related
Research InstitutionThe University of Tokushima

Principal Investigator

OSAKABE Keishi  徳島大学, 大学院社会産業理工学研究部(生物資源産業学域), 教授 (70450335)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2020: ¥6,110,000 (Direct Cost: ¥4,700,000、Indirect Cost: ¥1,410,000)
Fiscal Year 2019: ¥6,760,000 (Direct Cost: ¥5,200,000、Indirect Cost: ¥1,560,000)
Keywordsゲノム編集 / DNA二重鎖切断修復 / CRISPR-Cas9 / ジェミニウィルスベクター / NHEJ / ジェミニウィルス / 半数体 / トマト / CRISPR/Cas9
Outline of Research at the Start

本研究は、正確なNHEJがどのような経路によって制御されているのか?、またどのような因子が関わっているのか? などの疑問点を解明し植物ゲノム編集技術に応用することで、正確なモザイク性が低い変異導入システムを構築することを目的とする。さらに、安定な変異系統の固定技術として、一世代で固定する技術の基盤となるセントロメアヒストンの制御機構を利用した簡便で汎用性のある半数体作出法および誘導型ウィルスベクターを用いたゲノムに外来遺伝子を組み込まないゲノム編集法を開発・確立し、3つの技術を組み合わせることにより、従来のゲノム編集技術を用いた育種法の問題を克服した作物分子育種基盤を構築する。

Outline of Final Research Achievements

We examined the effects of loss or over-expression of DNA double-strand break repair factors coupled with a mutagenesis technique using multiplex gRNAs to reduce the introduction of mosaic mutations by CRISPR-Cas9 in plants. We also performed the mutagenesis of the CENH3 gene to establish haploid inducer-mediated genome editing combined with the geminivirus vector method. We confirmed the mutation in the CENH3 gene, although the CENH3 knock-out lines were not established yet. In addition, we succeeded in mutagenesis without incorporating the transgene into the genome by the multiplex gRNA method using the geminivirus vector System.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

モザイク性変異は、体細胞の標的ゲノム配列上に様々な変異配列タイプが不均一に混在する変異であり、目的とする変異のみを持つ個体を得るためには数世代の交配と選抜を行なう必要があるため、モザイク性変異を回避した一世代での変異固定を行う方法の確立は、迅速な分子育種技術を確立する上で重要である。また、植物細胞に導入したゲノム編集ツールをゲノムに組み込まずに作用させる手法は社会受容性の高い系統作出に必要である。ジェミニウイルスベクターを用いることで、導入遺伝子をゲノムに組み込まずに変異導入することが可能となり、社会受容性の高いゲノム編集ツールの導入基盤を示す事ができた。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 3 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Effects of the sliaa9 Mutation on Shoot Elongation Growth of Tomato Cultivars.2021

    • Author(s)
      Abe-Hara C, Yamada K, Wada N, Ueta R, Hashimoto, R, Osakabe K, Osakabe Y
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 20(627832) Pages: 1-10

    • DOI

      10.3389/fpls.2021.627832

    • NAID

      120007180365

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Precision genome editing in plants: state-of-the-art in CRISPR/Cas9-based genome engineering.2020

    • Author(s)
      Wada N, Ueta R, Osakabe Y, Osakabe K
    • Journal Title

      BMC Plant Biology

      Volume: 20-234 Issue: 1 Pages: 1-12

    • DOI

      10.1186/s12870-020-02385-5

    • NAID

      120006953548

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Double knockout of OsWRKY36 and OsWRKY102 boosts lignification with altering culm morphology of rice.2020

    • Author(s)
      Takuji Miyamoto, Rie Takada, Yuki Tobimatsu, Shiro Suzuki, Masaomi Yamamura, Keishi Osakabe, Yuriko Osakabe, Masahiro Sakamoto, Toshiaki Umezawa
    • Journal Title

      Plant Science

      Volume: in press Pages: 110466-110466

    • DOI

      10.1016/j.plantsci.2020.110466

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 新規ゲノム編集技術が貢献するバイオエコノミーの未来2021

    • Author(s)
      刑部敬史
    • Organizer
      第38回 日本植物バイオテクノロジー学会(つくば)大会 シンポジウム2-1
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] in planta-regeneration法におけるdCas9-転写活性化ベクターを用いた遺伝子発現制御システムの開発2020

    • Author(s)
      上田梨紗、吉良望、原千尋、宮地朋子、和田直樹、刑部敬史、刑部祐里子
    • Organizer
      第61回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] トマト栽培品種におけるジェミニウイルスベクターを利用したゲノム編集システムの構築2020

    • Author(s)
      山田勝久、原千尋、刑部祐里子、刑部敬史
    • Organizer
      第61回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 新しいゲノム編集酵素を用いた植物のゲノム編集技術2020

    • Author(s)
      刑部敬史
    • Organizer
      プロジェクト横断型公開シンポジウム「植物のゲノム編集基盤技術開発の現状と展望」
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] トマトゲノム編集のためのin planta-regeneration法の開発2019

    • Author(s)
      吉良望, 高柳栄子, 渡邊崇人, 坂本秀樹, 原(阿部)千尋, 橋本諒典, 上田梨紗, 刑部祐里子, 刑部敬史
    • Organizer
      第37回日本植物細胞分子生物学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 高等植物におけるゲノム編集技術の活用と展望2019

    • Author(s)
      刑部敬史
    • Organizer
      日本遺伝学会第91回大会ワークショップ「CRISPR をはじめとしたゲノム編集技術の現状と課題、将来性」
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] CRISPR/Cas9による栽培品種トマトにおける変異体作製およびヌルセグリガント単離法の構築2019

    • Author(s)
      原千尋,山田勝久,上田梨紗,橋本諒典,刑部祐里子,刑部敬史
    • Organizer
      第37回日本植物細胞分子生物学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] CRISPR/dCas9を利用した植物遺伝子発現制御システムの開発2019

    • Author(s)
      上田梨紗,吉良望,吉岡里香,宮地朋子,和田直樹,刑部祐里子,刑部敬史
    • Organizer
      第37回日本植物細胞分子生物学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Book] 「ゲノム編集食品 ~農林水産分野への応用と持続的社会の実現~」第2章DNA編集技術、1. CRISPR-Casによるゲノム編集技術-総論2021

    • Author(s)
      刑部敬史、和田直樹(分担執筆)、田部井豊編
    • Total Pages
      10
    • Publisher
      エヌ・ティー・エス
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Book] 完全版 ゲノム編集実験スタンダード「第2章17 植物でのゲノム編集」2019

    • Author(s)
      刑部祐里子、原千尋、橋本諒典、宮地朋子、刑部敬史
    • Total Pages
      386
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      9784758122443
    • Related Report
      2019 Annual Research Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi