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Transcriptional network regulating gametogenesis in basal land plants and its evolution

Research Project

Project/Area Number 19H03244
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 44030:Plant molecular biology and physiology-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Araki Takashi  京都大学, 生命科学研究科, 教授 (00273433)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2020: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2019: ¥7,410,000 (Direct Cost: ¥5,700,000、Indirect Cost: ¥1,710,000)
Keywords生殖系列 / 生殖細胞 / 配偶子形成 / 精細胞 / 転写制御ネットワーク / 転写制御因子 / 有性生殖 / ゼニゴケ
Outline of Research at the Start

基部陸上植物の苔類ゼニゴケを用いて、生殖細胞形成過程における転写制御ネットワークを明らかにすることを目的とする。他のコケ植物や陸上植物の姉妹群であるシャジクモ植物も用いることで、上で明らかにした転写制御ネットワークの起源や進化についても考察する。研究課題1. DUO1を中心とする精細胞形成過程の転写制御ネットワークの解明では、DAZ1やRWP1といった下流転写因子の候補やそれらにより制御される素過程の研究を進める。研究課題2. 雌雄生殖系列決定因子の探索では、配偶子器分化因子BNBとその制御因子の候補であるmiR529cとSPL2、生殖細胞始祖分化に関わる候補因子MS1を中心に研究を進める。

Outline of Final Research Achievements

In male germ cell development in Marchantia polymorpha, we found that the relative contribution of DUO1-DAZ1 regulatory module, which is conserved among land plants, is relatively small. By contrast DUO1-RWP1 regulatory module, which has been lost during evolution leading to angiosperm, has a greater contribution. It plays an important role in stability, integrity, and stable transmission of the paternal genome through sperm nuclear condensation and other processes. We also investigated germline specification in Marchantia polymorpha and found upstream pathways of BNB, a master regulator of germline specification. After germline specification, a cell lineage which eventually generates gametes and a cell lineage for surrounding protective cells are separated. We found that another factor MS1 plays an important role in this process.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

仮入力
陸上植物の生殖細胞形成は、生殖系列の体細胞系列からの分離が生活環の後期におこる点で動物のそれとは大きく異なる。そのため、生殖細胞形成の理解には、陸上植物の過程を研究し、動物との共通点と相違点を理解することが不可欠である。これまで陸上植物の生殖細胞形成過程の研究は、シロイヌナズナ、イネなどの被子植物のモデル植物を用いて進められ、多くの細胞生物学・分子生物学上の知見が蓄積している。しかし、被子植物における生殖細胞形成は、基部陸上植物のコケ植物(苔類、蘚類、ツノゴケ類)のそれとは2つの点で大きく異なる。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (29 results)

All 2022 2021 2020 2019 Other

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 3 results) Presentation (18 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results) Book (1 results) Remarks (4 results)

  • [Journal Article] Regulation of gametangia and gametangiophore initiation in the liverwort Marchantia polymorpha2021

    • Author(s)
      Yamaoka Shohei、Inoue Keisuke、Araki Takashi
    • Journal Title

      Plant Reproduction

      Volume: 34 Issue: 4 Pages: 297-306

    • DOI

      10.1007/s00497-021-00419-y

    • Related Report
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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Time-Series Single-Cell RNA-Seq Data Reveal Auxin Fluctuation during Endocycle2020

    • Author(s)
      Kotaro Torii
    • Journal Title

      Plant cell & physiology

      Volume: 61 Issue: 2 Pages: 243254-243254

    • DOI

      10.1093/pcp/pcz228

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Molecular mechanism and evolution of gametogenesis in land plants2019

    • Author(s)
      山岡 尚平、河内 孝之、荒木 崇
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 91 Issue: 4 Pages: 534-539

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2019.910534

    • NAID

      40022022830

    • ISSN
      0037-1017
    • Year and Date
      2019-08-25
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  • [Journal Article] An Early Arising Role of the MicroRNA156/529-SPL Module in Reproductive Development Revealed by the Liverwort Marchantia polymorpha2019

    • Author(s)
      Tsuzuki Masayuki、Futagami Kazutaka、Shimamura Masaki、Inoue Chikako、Kunimoto Kan、Oogami Takashi、Tomita Yuki、Inoue Keisuke、Kohchi Takayuki、Yamaoka Shohei、Araki Takashi、Hamada Takahiro、Watanabe Yuichiro
    • Journal Title

      Current Biology

      Volume: 29 Issue: 19 Pages: 3307-3314

    • DOI

      10.1016/j.cub.2019.07.084

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  • [Journal Article] Building new insights in plant gametogenesis from an evolutionary perspective2019

    • Author(s)
      Hisanaga Tetsuya、Yamaoka Shohei、Kawashima Tomokazu、Higo Asuka、Nakajima Keiji、Araki Takashi、Kohchi Takayuki、Berger Fr?d?ric
    • Journal Title

      Nature Plants

      Volume: 5 Issue: 7 Pages: 663-669

    • DOI

      10.1038/s41477-019-0466-0

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    • Author(s)
      Inoue K, Nishihama R, Araki T, Kohchi T
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: pcz029 Issue: 5 Pages: 1136-1145

    • DOI

      10.1093/pcp/pcz029

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      古谷朋之,山岡尚平,石崎公庸,西浜竜一,荒木 崇,河内孝之,福田裕穂,近藤侑貴
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      第62回日本植物生理学会年会(オンライン開催)
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      金坂侑紀,井上佳祐,山岡尚平,荒木 崇
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  • [Presentation] 栄養素の輸送を介した器官間でのカップリングが概日時計の安定性を高める2021

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      上本恭平,国本有美,森 史,伊藤浩史,久保田茜,江頭春樹,木下俊則,荒木 崇,遠藤 求
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会(オンライン開催)
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  • [Presentation] Understanding plant sperm cell differentiation using basal land plants and Charophyte algae2020

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      荒木 崇
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  • [Presentation] ゼニゴケの新規DNAメチルか制御機構:植物と動物の狭間で2020

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      池田陽子,十川大輔,西浜竜一,荒木 崇,河内孝之,平山隆志,大和勝幸
    • Organizer
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      上本恭平,国本有美,荒木 崇,遠藤 求]
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      小谷莞太, 西田瑠理, 肥後あすか, 井上佳祐, 山岡尚平, 荒木 崇
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  • [Presentation] 基部陸上植物ゼニゴケの日調認識メカニズムの解析2020

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      井上佳祐, 金坂侑紀, 山岡尚平, 西浜竜一, 河内孝之, 荒木 崇
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      第61回日本植物生理学会年会(開催中止. 要旨公表のみ)
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    • Organizer
      International Marchantia Workshop 2019
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      金坂侑紀, 井上佳祐, 山岡尚平, 西浜竜一, 河内孝之, 荒木 崇
    • Organizer
      日本植物学会 第83回大会
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      井上佳祐, 金坂侑紀, 山岡尚平, 西浜竜一, 河内孝之, 荒木 崇
    • Organizer
      日本植物学会 第83回大会
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  • [Book] 三訂版『植物の科学』2021

    • Author(s)
      塚谷 裕一, 荒木 崇(編著)
    • Total Pages
      297
    • Publisher
      放送大学教育振興会
    • ISBN
      9784595322846
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      https://www.plantdevbio.lif.kyoto-u.ac.jp/index.html

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  • [Remarks] 京都大学HP 研究成果

    • URL

      http://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research/research_results/2019/190920_2.html

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  • [Remarks] 京都大学生命科学研究科HP 研究成果

    • URL

      http://www.lif.kyoto-u.ac.jp/j/?post_type=research&p=12138

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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