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Theoretical understanding of the population dynamics and evolution of chemotrophs under the limitation of metabolic energy acquisition per redox reaction.

Research Project

Project/Area Number 19K06853
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 45040:Ecology and environment-related
Research InstitutionNara Women's University

Principal Investigator

Seto Mayumi  奈良女子大学, 自然科学系, 助教 (10512717)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2021: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Fiscal Year 2020: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywords微生物生態 / 非平衡熱力学 / 数理モデリング / 生物エネルギー論 / 酸化還元反応 / 化学合成微生物 / 個体群動態 / ギブスエネルギー / 化学合成細菌 / 群集生態学 / 地球微生物学 / 個体群動態モデル / 生体エネルギー論 / 化学合成無機独立栄養 / 数理モデル / 微生物生態学 / 熱力学 / 種間相互作用 / 進化
Outline of Research at the Start

地球上の生物は光か化学反応のいずれかをエネルギー源として用いる。細菌や古細菌には鉄や水素や硫黄を利用した反応からエネルギーを得るものが存在し、彼らの存在は炭素や窒素の挙動に影響するだけで無く重金属の動態や毒性にも影響をもたらす。彼らの特徴は有機物を酸素で酸化する化学反応(好気呼吸)からエネルギーを得る動物と異なり、反応から獲得することができるエネルギー量が非常に低い点である。本研究では低エネルギー反応を利用する微生物の増殖動態をモデル化し、それらの微生物の増殖過程を理解し、個体群の相互作用と進化動態について理論的な理解を試みる。

Outline of Final Research Achievements

The fundamental ecological theories have been developed based on observations of the Earth's surface ecosystems (e.g., terrestrial and coastal ecosystems). meanwhile, the deep subsurface environments also harbor enormous biomass, in which bacteria and archaea support primary production. The amount of energy available in the deep sea is far less than that available in surface ecosystems. In this study, we conducted a theoretical study using a population dynamics model to understand microbial communities and ecosystems that are independent of light as an energy source. The results revealed that microorganisms increase not only the reaction rate but also the energy conversion efficiency by passing metabolites to other microorganisms.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

地下生態系に存在する細菌や古細菌の多くは電子移動を伴う化学反応を利用して自らのエネルギーに転換し、生物生産を支える。こうしたエネルギー利用形態の生物は地球の最古の生命に近い形態であることが示唆されている。よって、光に依存しない微生物生態系を理解することは、初期生命が生態系を築くに至るプロセスを知るために役に立つ。また、生態学のこれまでの基盤理論に地下生態系の理論を追加し、比較することで、より普遍的な生態系理論の確立を目指すことができる。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2022 2021 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 5 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] Ecohydrology Research Group(カナダ)

    • Related Report
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  • [Journal Article] Microbial material cycling, energetic constraints and ecosystem expansion in subsurface ecosystems2020

    • Author(s)
      Seto Mayumi、Iwasa Yoh
    • Journal Title

      Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences

      Volume: 287 Issue: 1931 Pages: 20200610-20200610

    • DOI

      10.1098/rspb.2020.0610

    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] How Thermodynamics Illuminates Population Interactions in Microbial Communities2020

    • Author(s)
      Seto Mayumi、Iwasa Yoh
    • Journal Title

      Frontiers in Ecology and Evolution

      Volume: 8 Pages: 602809-602809

    • DOI

      10.3389/fevo.2020.602809

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The fitness of chemotrophs increases when their catabolic by‐products are consumed by other species2019

    • Author(s)
      Seto Mayumi、Iwasa Yoh
    • Journal Title

      Ecology Letters

      Volume: 22 Issue: 12 Pages: 1994-2005

    • DOI

      10.1111/ele.13397

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Potential for Aerobic Methanotrophic Metabolism on Mars2019

    • Author(s)
      Seto Mayumi、Noguchi Katsuyuki、Cappellen Philippe Van
    • Journal Title

      Astrobiology

      Volume: 19 Issue: 10 Pages: 1187-1195

    • DOI

      10.1089/ast.2018.1943

    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 化学合成微生物群集と酸化還元ネットワークの共発展2022

    • Author(s)
      瀬戸繭美
    • Organizer
      第69回日本生態学会 2022年3月15日
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  • [Presentation] 硝化反応における微生物代謝の競争と協力2021

    • Author(s)
      瀬戸繭美
    • Organizer
      第31回日本数理生物学会大会(2021年度年会)
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  • [Presentation] 代謝エネルギーを介して見る微生物群集2021

    • Author(s)
      瀬戸繭美
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      京都大学生態学研究センター共同利用ワークショップ 微生物を軸とした群集構造研究の統合とさらなる展開
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      瀬戸繭美
    • Organizer
      日本生態学会
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  • [Presentation] 光非依存生産者の種間相互作用と生物地球化学サイクルの数理モデル2020

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      瀬戸繭美
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      日本数理生物学会
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  • [Presentation] 微生物代謝ネットワークと生態系の共進化: 化学エネルギー観点からの進化的制約とは?2020

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      瀬戸繭美
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      瀬戸繭美
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      Mayumi Seto
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      24th International Symposium on Environmental Biogeochemistry
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] エネルギー獲得を巡る微生物相互作用:ニッチ構築と物質フローの拡大2019

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      瀬戸繭美
    • Organizer
      2019年度(第29回)日本数理生物学会大会
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  • [Presentation] 酸化還元反応と生命 - 微生物代謝の進化と生態系の発展 -2019

    • Author(s)
      瀬戸繭美
    • Organizer
      ソフトマターの未来材料シンポジウム
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    • Invited
  • [Presentation] Application of bioenergetics in astrobiology and ecology2019

    • Author(s)
      Mayumi Seto
    • Organizer
      Ecohydrology Research Symposium
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      2019 Research-status Report
    • Invited
  • [Remarks] 瀬戸研究室

    • URL

      https://www.e.ics.nara-wu.ac.jp/~seto/index_ja.html

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Remarks] 研究者自身が管理しているホームページにおける発表論文のWebページ

    • URL

      https://www.e.ics.nara-wu.ac.jp/~seto/publications_ja.html

    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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