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Elucidation of the diversity formation mechanism by annual/perennial differences within Lotus japonicus

Research Project

Project/Area Number 19K16213
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 45030:Biodiversity and systematics-related
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology (2021-2023)
Nara Women's University (2019-2020)

Principal Investigator

Wakabayashi Tomomi  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 助教 (20826755)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2022: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Keywords植物の生活型 / 種内多型 / 適応進化 / ミヤコグサ / 生活型 / 高温ストレス / 一年生・多年生 / 環境適応 / 種内分化 / 生活史戦略
Outline of Research at the Start

一年生・多年生の違いは、植物の繁殖成功度に関わる重要な要素の一つであり、環境適応に関連して種内の多様性や種分化に貢献する。国内に広く分布するミヤコグサは、これまで多年生植物として知られていたが、申請者は野外調査により種内に一年生・多年生の両方を維持することを発見した。本研究では、モデル植物である本種のゲノム情報・塩基多型情報を利用した解析により、一年生・多年生の違いに関わる遺伝的要因を検出する。さらに、生育地情報と環境値を統計的に解析し、一年生・多年生の違いに関連する環境要素を検出する。これらにより、本種における一年生・多年生による適応戦略の仕組みを包括的に明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we aim to clarify the genetic and environmental factors associated with the annual and perennial lifestyle polymorphisms within Lotus japonicus, and reveal the mechanisms of intraspecific diversity formation and adaptive evolutionary mechanisms based on lifestyle difference. In Okinawa, where the local wild population is annual, we cultivated recombinant inbred lines made using annual and perennial accessions, and performed QTL analysis on their phenotypes. As the result, a genomic region was detected. Furthermore, cultivation experiments conducted in artificial environments focused on high-temperature conditions revealed that the Okinawa accession exhibits an annual phenotype under high-temperature conditions of 30°C, and that annualization is strengthened due to epigenetic control. In addition, the experiment showed different phenotypes between annual and perennial accessions.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

一年生や多年生などの生活型の違いは、植物の適応戦略に関わるため、多様性や適応進化についての研究において重要な形質である。本研究ではミヤコグサ種内に存在する一年生と多年生のエコタイプを対象に、モデル植物としての研究資源を活用することで、関連する環境条件を明らかにし、関連する遺伝的要因が存在するゲノム上の領域を検出した。これらの成果は、ミヤコグサの例を通して、植物の生活型の違いを制御する機構や、分化プロセスの解明に大いに貢献し、多様性生物学における重要な命題の理解に繋がる。さらに、生活型の違いは農作物の収量にも関連する形質であり、将来的には農業品種改良にも貢献し得ると考えられる。

Report

(6 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2023 2022 2021 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (5 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] Aarhus University(デンマーク)

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] Aarhus University/Molecular Biology and Genetics(デンマーク)

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] Aarhus University/Molecular Biology and Genetics/Plant Molecular Biology(デンマーク)

    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] Aarhus University(デンマーク)

    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] Aarhus University(デンマーク)

    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Journal Article] Extreme genetic signatures of local adaptation during Lotus japonicus colonization of Japan2020

    • Author(s)
      Shah Niraj、Wakabayashi Tomomi、Kawamura Yasuko、et al.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 253-253

    • DOI

      10.1038/s41467-019-14213-y

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] ミヤコグサ国内野生系統が示す開花時期の違いとその遺伝基盤の解明 〜全ゲノム関連解析による責任遺伝子の検出〜2019

    • Author(s)
      若林智美, 瀬戸口浩彰
    • Journal Title

      BSJ-Review

      Volume: 10 Issue: C Pages: 190-195

    • DOI

      10.24480/bsj-review.10c10.00170

    • ISSN
      2432-9819
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Open Access
  • [Presentation] 日本におけるミヤコグサの開花時期多型と適応進化2023

    • Author(s)
      若林智美
    • Organizer
      日本進化学会第25回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ミヤコグサにおける一年生・多年生の種内多型と適応進化2023

    • Author(s)
      若林 智美、田中 幸子、Stig U. ANDERESEN、池田 啓、加藤 晃、川口 正代司、佐藤 修正、瀬戸口浩彰
    • Organizer
      日本植物分類学会第22回大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] ミヤコグサの一年生・多年生の違いと環境適応2022

    • Author(s)
      若林智美、田中 幸子、Stig U. ANDERESEN、池田 啓、加藤 晃、川口 正代司、佐藤 修正、瀬戸口浩彰
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] ミヤコグサGF14遺伝子の開花への寄与と進化2022

    • Author(s)
      若林智美,Cathrine K. Skovbjerg,壽崎拓哉,西田帆那,池田啓, 瀬戸口浩彰,川口正代司,Stig U. Andersen,佐藤修正
    • Organizer
      日本植物分類学会第21回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] ミヤコグサの開花時期を介した環境適応機構の解明2021

    • Author(s)
      若林智美,Cathrine K. Skovbjerg,壽崎拓哉,西田帆那,池田啓, 瀬戸口浩彰,川口正代司,Stig U. Andersen,佐藤修正
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] ミヤコグサの開花時期多型と環境適応2021

    • Author(s)
      若林智美
    • Organizer
      第61回植物バイテクシンポ
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 複数地点におけるミヤコグサの 開花時期多型の比較と全ゲノム 関連解析2019

    • Author(s)
      若林 智美,Stig U. Andersen,佐藤 修正,川口 正代司,瀬戸口 浩彰
    • Organizer
      日本植物学会第83回大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2025-11-20  

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