貝殻のミューゼオミクス：博物館の収蔵標本を活かすための実験的研究
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19K21646
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Medium-sized Section 3:History, archaeology, museology, and related fields
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
佐々木 猛智 東京大学, 総合研究博物館, 准教授 (70313195)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
スティアマルガ デフィン 和歌山工業高等専門学校, 生物応用化学科, 准教授 (50625259)
川島 武士 国立遺伝学研究所, 情報研究系, 助教 (10378531)
藤田 敏彦 独立行政法人国立科学博物館, 動物研究部, グループ長 (70222263)
西秋 良宏 東京大学, 総合研究博物館, 教授 (70256197)
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| Project Period (FY) |
2019-06-28 – 2022-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2020)
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| Budget Amount *help |
¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
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| Keywords | ミューゼオミクス / 博物館学 / 分類学 / 博物館 |
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| Outline of Research at the Start |
本研究の目的は、実験的研究を通じて、博物館に収蔵された標本の新しい活用法を模索するものである。具体的には、(1)貝殻からDNAを抽出する実験、(2)次世代シーケンサを用いて博物館の標本からDNA抽出を効率的に行うための実験、(3)様々な年代、保存状態の標本を対象としたDNAの適正な保存条件の検討を行う。本研究では、微細構造、殻層ごとに実験を行う点が特に重要である。そして、以上の結果をもとに、標本を大規模に破壊することなく博物館の古い標本からDNA情報を取得するための技術を高める。
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| Outline of Annual Research Achievements |
2020年度は現生の貝殻を用いてDNA（COI遺伝子）の抽出実験の続きを行った。漂白剤で貝殻表面の有機物を除去した後、破砕してEDTAで脱灰し、DNAを抽出した。漂白処理は時間が短すぎる場合は良い結果が得られなかった。また、無処理の場合は殻の表面の付着生物等のコンタミネーションが疑われた。データの信頼度を確認するために、貝殻から得られた塩基配列情報は、軟体部から抽出したDNAのデータと比較した。その結果、サンプルによっては同一の結果が得られなかったものがあり、さらなる検討が必要であることが分かった。貝殻からのDNAデータの抽出は、複数個体を用いて実験し結果が一致するか、あるいは繰り返し実験し同一の結果が得られるか、軟体部と貝殻でデータが一致するかなど、慎重な確認作業が必要である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
コロナウイルスの蔓延、緊急事態宣言の発令により実験が制限され、当初の計画よりやや遅れている。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後の研究の方向性は２つある。
1つ目は、新鮮な標本を用いて行う実験であり、対象とする種数を増加させる。様々な貝殻微細構造を広く網羅できるよう標本を追加し、貝層ごとに準備した サンプルを用いて前年度と同様に抽出実験を進める。
2つ目は、確実にDNA抽出ができることが確認された種を対象として、博物館に収蔵されている古い標本からのDNA抽出を試みる。この実験はまだ始められていなかったため、今年度の重要な課題になる。DNA抽出にはサンプルが生きた状態で採集されていることが重要な意味を持つため、液浸標本が利用できる場合は優先して実験を行う。乾燥標本を用いる場合は、古い死殻を除外するなど、標 本の状態を精査した上で実験用のサンプルを選択する。
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Report
(2 results)
Research Products
(5 results)
