Mechanism of transcription coupled to RNA processing and its defect
| Project/Area Number |
19K24692
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| Research Category |
Fund for the Promotion of Joint International Research (Home-Returning Researcher Development Research)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Biological Sciences
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
野島 孝之 九州大学, 生体防御医学研究所, 准教授 (80431956)
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| Project Period (FY) |
2021-03-12 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥55,770,000 (Direct Cost: ¥42,900,000、Indirect Cost: ¥12,870,000)
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| Keywords | 新生RNA / 転写終結 / クロマチン / RNA polymerase II / RNA プロセシング / RNAプロセシング / ゲノム転写 / エピジェネティクス / 非コードRNA / RNAポリメラーゼII |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、細胞核内で起こるRNA polymerase II転写装置とRNAプロセシング装置のクロストークや非コードゲノム転写制御機構の解明を目標としている。大腸がんや腎臓がん細胞を用いて、その異常ゲノム転写-RNAプロセシング制御を解析することにより、基礎的なゲノム転写制御機構とがん細胞増殖や細胞分化の解明に貢献する。以下に具体的に取り組んだ研究内容を記す。(1)がんではTranscriptional addictionと呼ばれる現象が見られ、特定の転写因子が優位となった転写プログラムが確立されることが知られている。本研究では、公共RNA-seq データを再解析し、大腸がんにおける転写関連因子のRNA 発現を調べた結果、転写伸長因子として知られているNegative elongation factor (NELF)の転写産物が大腸がんで有意に高発現していることを明らかにした。さらに、初年度に開発した新生RNA解析法POINTを用いて、NELF 発現抑制時に転写終結破綻が起きていること、その破綻がDNA 複製開始反応の抑制、それに伴う細胞周期の停止が引き起こされることを明らかにした。(2)クロマチン環境と転写産物の相関性はよく調べられているが、クロマチン環境変化がどのように”転写”へ影響するのか、はほとんどわかっていない。本研究では、複数のがんで機能を失っているヒストンメチル基転移酵素遺伝子の（KO）細胞やメチル基転移活性を失った腎臓がん患者由来細胞を用いて、新生RNA解析を行った。その結果、転写終結の破綻が起きていることが明らかになり、その破綻ががんでのDNA損傷オリジンになっていることが示唆された。現在、クロマチン環境をシークエンスや生化学的手法で解析しており、詳細な転写終結機構を分子レベルで明らかにしようとしている。
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Report
(3 results)
Research Products
(32 results)
