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Establishment of the consumer-oriented breeding system in blueberry based on genomic and cognitive sciences

Research Project

Project/Area Number 19KK0156
Research Category

Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 39:Agricultural and environmental biology and related fields
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

田尾 龍太郎  京都大学, 農学研究科, 教授 (10211997)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 澤田 玲子  京都大学, 農学研究科, 研究員 (20713043)
西山 総一郎  京都大学, 農学研究科, 助教 (50827566)
山根 久代  京都大学, 農学研究科, 准教授 (80335306)
Project Period (FY) 2019-10-07 – 2024-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥18,200,000 (Direct Cost: ¥14,000,000、Indirect Cost: ¥4,200,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2020: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywords果樹 / 園芸 / 嗜好性 / 栽培化 / 倍数体
Outline of Research at the Start

本研究では,USDAの保有する多様なサザンハイブッシュブルーベリーの遺伝資源を活用し,高品質品種の開発を加速化するための基盤整備を行う.認知科学の手法を取り入れ,嗜好・分析型の官能評価試験を実施し,高品質果実生産のための品種育成に活用する.また,ゲノムワイドな解析によりサザンハイブッシュブルーベリーの育種成立過程を解明する.さらに果実の生化学的特性に基づいてゲノム多型と嗜好性要因を紐付けする.ゲノムワイドな解析は,開花期など暖地栽培に関連する農業形質の解明にも適用する.以上より,日本独自の高品質ブルーベリー育成のための育種体系を確立し,消費者を指向する暖地適応型ブルーベリー育種に応用する.

Outline of Annual Research Achievements

本研究は,アメリカ農務省のSouthern Horticultural Research Unit(SHRU)のBabiker研究員と行う5年間の共同研究である.研究2年目に当たる本年度は,昨年度に引き続いてサザンハイブッシュブルーベリー(南部HB)のゲノム進化過程の解明を進め,さらにゲノムワイド多型情報を用いた関連解析を行った.またブルーベリー遺伝資源の果実代謝物プロファイリングとブルーベリー果実に対する嗜好・分析型官能評価調査研究については,昨年度にBabiker研究員と立案した研究を実施した.得られた具体的な研究成果は以下の通りである.
南部HB,ノーザンハイブッシュブルベリー(北部HB),ラビットアイブルーベリー(RE)を含む,総計137品種系統からなるブルーベリーの遺伝資源を用いて, ddRAD-seqによりゲノムシークエンシングを行った.得られたゲノム情報を解析して,ゲノム全体にわたるSNPs情報を整備した.ゲノムシークエンス情報に加えて,過去の交配記録も参考にして,解析を行ったところ,南部HBと北部HBの差異に関わる少数の遺伝子座が検出された.これらの遺伝子座における集団中のアレル頻度と遺伝子型のパターンから,南部HBにみられる適応形質は,ポリジーン支配である可能性が示唆された.
ブルーベリー23品種について,京都大学農学部に属する20~30代の男女32名を対象にgLMS法による嗜好・分析型官能評価を実施した.各品種において,果実硬度,果実弾力,糖酸度,糖酸組成,総アントシアニン含量,総ポリフェノール含量を測定し,代謝物データとした.PLS回帰法を用いた嗜好性の要因分析結果から,糖度・糖酸比・果実弾力・果実サイズは嗜好性に対して正の影響を,酸度・ポリフェノール含量は負の影響を及ぼすことを明らかにした.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

COVID19の影響で,海外出張が出来ない状況下にあって,本研究の最終目標である日本独自の高品質ブルーベリー育成のための最適経路をもたらす育種方針とマーカー育種体系を確立のために必要なサザンハイブッシュブルーベリーの成立過程に関して,一定の成果が得られた.また昨年度までにBabiker博士と立案した消費者嗜好型育種に向けた嗜好・分析型の官能評価試験に関する実験計画を遂行することが出来たため,おおむね順調に研究は進んでいると判断した.

Strategy for Future Research Activity

まだしばらくの間,本国際共同研究に及ぼすCOVID19の影響は避けられないものと考えられる.そこで日本側研究者が現地に赴くことなく,米国側研究者であるBabiker博士が実験を遂行して得た結果と情報を共有することで進めることが可能な研究を中心に行っていくことにする.この際にはリモート会議などを通じて,研究の詳細について打ち合わせをしていく.これまでに得られている結果については,早期にとりまとめて論文投稿する.本研究のもう一つの柱である,ブルーベリー果実に対する嗜好・分析型官能評価調査:分析型評価については,大きさや色彩,甘味や酸味の度合い,触感,香りの強さといった項目について,評価者の五感により評価させる実験の反復を行い,昨年度に得た結果の検証を行う予定である.

Report

(2 results)
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report

Research Products

(11 results)

All 2021 2020

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Journal Article] Preharvest long-term exposure to UV-B radiation promotes fruit ripening and modifies stage-specific anthocyanin metabolism in highbush blueberry2021

    • Author(s)
      Li, T., H. Yamane and R. Tao
    • Journal Title

      Hort. Res.

      Volume: 8 Pages: 67-67

    • DOI

      10.1038/s41438-021-00503-4

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genomic insight into the developmental history of southern highbush blueberry populations2020

    • Author(s)
      Nishiyama, S., M. Fujikawa, H. Yamane, K. Shirasawa, E. Babiker and R. Tao
    • Journal Title

      Heredity

      Volume: 126 Pages: 194-205

    • DOI

      10.1038/s41437-020-00362-0

    • NAID

      120006958094

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Expressional analysis of FT and CEN genes in a continuously flowering highbush blueberry 'Blue Muffin'2020

    • Author(s)
      Omori, M., H. Yamane, K-T. Li, R. Matsuzaki, S. Ebihara, T-S. Li and R. Tao.
    • Journal Title

      Acta Hort.

      Volume: 1280 Pages: 197-201

    • DOI

      10.17660/actahortic.2020.1280.27

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Trageted mutagenesis of CENTRORADIALIS using CRISPR/Cas9 system through the improvement of genetic transformation efficiency of tetraploid highbush blueberry2020

    • Author(s)
      Omori, M., H. Yamane, K. Osakabe, Y. Osakabe, and R. Tao
    • Journal Title

      J. Hortic. Sci. Biotec.

      Volume: 96 Pages: 153-161

    • DOI

      10.1080/14620316.2020.1822760

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 倍数体モデルに基づくサザンハイブッシュブルーベリーのゲノムワイドアソシエーション解析2021

    • Author(s)
      長坂京香,西山総一郎,藤川真央,山根久代,白澤健太,E. Babiker,田尾龍太郎
    • Organizer
      園芸学会令和3年度春季大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] CRISPR/Cas9によるハイブッシュブルーベリーのゲノム編集2021

    • Author(s)
      大森真史,山根久代,刑部祐里子,刑部敬史,田尾龍太郎
    • Organizer
      園芸学会令和3年度春季大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Effects of pre-harvest UV-B irradiation on anthocyanin biosynthesis in blueberry2020

    • Author(s)
      Li, T., H. Yamane and R. Tao
    • Organizer
      3rd Asian Horticulture Congress
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Evaluation of the effects of pollination on fruit size and quality of highbush blueberry2020

    • Author(s)
      Yamane, H., K. Nagasaka, S. Ebihara, T. Li, R. Matsuzaki, M. Shoji and R. Tao
    • Organizer
      3rd Asian Horticulture Congress
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] サザンハイブッシュブルーベリーにおける重要形質のゲノムワイドアソシエーション解析2020

    • Author(s)
      西山総一郎,藤川真央,山根久代,白澤健太,E. Babiker,田尾龍太郎
    • Organizer
      園芸学会令和2年度春季大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] サザンハイブッシュブルーベリーにおける重要形質のゲノムワイドアソシエーション解析2020

    • Author(s)
      西山総一郎*・藤川真央・山根久代・白澤健太・E. Babiker・田尾龍太郎
    • Organizer
      園芸学会令和2年度春季大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Towards understanding of genome evolution of southern highbush blueberry by ddRAD-Seq2020

    • Author(s)
      Nishiyama*, S., M. Fujikawa, E. Babiker, H. Yamane, K. Shirasawa and R. Tao
    • Organizer
      Plant and Animal Genome Conference XXVII
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2019-10-10   Modified: 2021-12-27  

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