Establishment of the consumer-oriented breeding system in blueberry based on genomic and cognitive sciences
| Project/Area Number |
19KK0156
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| Research Category |
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Medium-sized Section 39:Agricultural and environmental biology and related fields
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
田尾 龍太郎 京都大学, 農学研究科, 教授 (10211997)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
澤田 玲子 京都大学, 農学研究科, 研究員 (20713043)
西山 総一郎 京都大学, 農学研究科, 助教 (50827566)
山根 久代 京都大学, 農学研究科, 准教授 (80335306)
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| Project Period (FY) |
2019-10-07 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2019)
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| Budget Amount *help |
¥18,200,000 (Direct Cost: ¥14,000,000、Indirect Cost: ¥4,200,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2020: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
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| Keywords | 果樹 / 園芸 / 嗜好性 / 栽培化 / 倍数体 |
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| Outline of Research at the Start |
本研究では，USDAの保有する多様なサザンハイブッシュブルーベリーの遺伝資源を活用し，高品質品種の開発を加速化するための基盤整備を行う．認知科学の手法を取り入れ，嗜好・分析型の官能評価試験を実施し，高品質果実生産のための品種育成に活用する．また，ゲノムワイドな解析によりサザンハイブッシュブルーベリーの育種成立過程を解明する．さらに果実の生化学的特性に基づいてゲノム多型と嗜好性要因を紐付けする．ゲノムワイドな解析は，開花期など暖地栽培に関連する農業形質の解明にも適用する．以上より，日本独自の高品質ブルーベリー育成のための育種体系を確立し，消費者を指向する暖地適応型ブルーベリー育種に応用する．
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は，本研究の海外研究拠点であるアメリカ農務省のSouthern Horticultural Research Unit（SHRU）のBabiker研究員と行う5年間の共同研究である．研究初年度に当たる本年度は，主として，サザンハイブッシュブルーベリー（南部HB）のゲノム進化過程を解明し，さらにゲノムワイド多型情報を用いた関連解析を行うための基礎情報を得ることに終始した．また，ブルーベリー遺伝資源の果実代謝物プロファイリングとブルーベリー果実に対する嗜好・分析型官能評価調査研究の具体的な計画をBabiker研究員と立案した．得られた具体的な研究成果は以下の通りである．
南部HB，ノーザンハイブッシュブルベリー（北部HB），ラビットアイブルーベリー（RB）そしていくつかの野生種を含む，総計137品種系統からなるブルーベリーの遺伝資源を用いて， ddRAD-seqによりゲノムシークエンシングを行った．得られたゲノム情報を解析して，ゲノム全体にわたるSNPs情報を整備した．ゲノムシークエンス情報に加えて，過去の交配記録も参考にして，解析を行ったところ，南部HBの育種過程において，ある特定のゲノム領域が野生種から取り込まれた形跡はなかった．このことから，南部HBにみられる形質は，ポリジーン支配である可能性が示唆された．今後，さらに解析を続けて，結果をとりまとめて論文投稿する予定である．
ブルーベリー遺伝資源の果実代謝物プロファイリングに関して，USDA-SHRUに植栽の遺伝資源と京都大学に植栽の系統について果実形質を調査するための研究内容をBabiker博士と打ち合わせ，具体的な実験計画を立案した．またあわせて，ブルーベリー果実に対する嗜好・分析型官能評価調査：分析型評価を行うための実験計画を立案した．
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本年度は，本研究の最終目標である日本独自の高品質ブルーベリー育成のための最適経路をもたらす育種方針とマーカー育種体系を確立のための第一歩として，サザンハイブッシュブルーベリーおよびその近縁種のゲノムのリシークエンスを行い，基礎データの整備を行うことができた．また消費者嗜好型育種に向けた嗜好・分析型の官能評価試験に関する具体的な実験計画をアメリカ農務省のBabiker研究員と立案できたことから，おおむね順調に研究が進んでいると判断した．
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| Strategy for Future Research Activity |
ゲノムシークエンシングによって得られた結果をさらに解析し，サザンハイブッシュブルーベリーのゲノムの特徴を明らかにしていくとともに，得られた結果をとりまとめて論文投稿する．また得られたSNPs情報を活用して，重要形質のゲノム関連解析を進めていく．ブルーベリー果実に対する嗜好・分析型官能評価調査：分析型評価については，大きさや色彩，甘味や酸味の度合い，触感，香りの強さといった項目について，評価者の五感により評価させる実験を進めていき，得られたデータの解析を進めて行く．
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Report
(1 results)
Research Products
(2 results)
