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Dynamics of selenium metabolisms and diversity of their molecular mechanisms in microbes

Research Project

Project/Area Number 20H02907
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 38020:Applied microbiology-related
Research InstitutionRitsumeikan University

Principal Investigator

三原 久明  立命館大学, 生命科学部, 教授 (30324693)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥17,810,000 (Direct Cost: ¥13,700,000、Indirect Cost: ¥4,110,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2021: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2020: ¥7,800,000 (Direct Cost: ¥6,000,000、Indirect Cost: ¥1,800,000)
Keywordsセレン / 代謝 / 多様性 / 細菌
Outline of Research at the Start

多様な環境下で細菌がどのようにセレンを代謝利用(同化、異化)し、解毒、排出、蓄積するのかを理解し、その生態系での役割や地球上の生物進化における意義を解明することは極めて重要である。本研究では、有用元素であると同時に毒性元素であるセレンを細菌がどのように代謝・解毒・排出・貯蔵するのか?生物進化とセレンの関係はどのようなものか?という問いに答えるための研究を行う。 細菌における多様なセレンの動態とその分子機構の解明を目的とする。細菌におけるセレン代謝に関わる因子を同定し、セレンの動態と生理的意義を総合的に理解する。

Outline of Annual Research Achievements

グラム陽性細菌であるCellulomonas sp. D3a は、嫌気条件下で高い亜セレン酸還元能を示すため、亜セレン酸呼吸系を有する可能性が考えられた。Cellulomonas sp. D3aとその近縁種である、C. fimi 、C. flavigenaの亜セレン酸還元活性について、液体培地に添加した亜セレン酸の還元に伴い生じる元素状セレンの生成(赤色呈色)を指標に比較した。嫌気条件下、富栄養培地での48時間培養において、Cellulomonas sp. D3aは亜セレン酸還元活性を示すが、C. fimi ATCC 484とC. flavigena DSM 20109は有意な亜セレン酸還元能を示さなかった。また、グルコースを炭素源とする亜セレン酸含有最少培地でCellulomonas sp. D3a、C. flavigenaの嫌気培養を行い、その生育を調べた。その結果、Cellulomonas sp. D3aでは亜セレン酸依存的な生育促進が認められたが、C. flavigenaではそのような生育促進が認められなかった。Cellulomonas sp. D3a、C. fimi ATCC 484、C. flavigena DSM 20109のゲノム配列情報を利用して比較を行った。その結果、Cellulomonas sp. D3aにのみ特異的に存在する遺伝子が61個存在することがわかった。Cellulomonas sp. D3aの亜セレン酸還元活性は細胞破砕後の不溶性画分に存在することがわかっている。そのため、61個の遺伝子のうち膜貫通領域をもつものをSOSUI、TMHMMを用いて予測したところ、20個の遺伝子が膜タンパク質である可能性が示唆された。これらの遺伝子のいずれかが亜セレン酸還元に関与している可能性が考えられた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

Cellulomonas sp. D3aにおける亜セレン酸依存的な生育促進を見出すなど,新たな発見を果たしており,比較ゲノム解析により,亜セレン酸還元に関わる遺伝子の絞り込みも遂行したことから,研究はおおむね順調に進展していると考える.

Strategy for Future Research Activity

申請書の計画に沿って研究を進める.セレンオキシアニオン還元酵素の反応機構について詳細に解析するとともに,細胞外セレンナノ粒子の生成機構について解析を進める.

Report

(1 results)
  • 2020 Annual Research Report

Research Products

(24 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (18 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results) Book (3 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Thapar Institute of Eng. Technol.(インド)

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    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 169 Pages: 477-484

    • DOI

      10.1093/jb/mvaa120

    • NAID

      40022586478

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      坂本暁紀, 牧村康平, 戸部隆太, T.N. Prakash, 三原久明
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      坂本暁紀, 牧村康平, 戸部隆太, T.N. Prakash, 三原久明
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  • [Remarks] 立命館大学 研究者学術情報 データベース

    • URL

      https://research-db.ritsumei.ac.jp/rithp/k03/resid/S000676

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Published: 2020-04-28   Modified: 2022-04-19  

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