| Project/Area Number |
20H03245
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 43060:System genome science-related
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| Research Institution | Toyama University of International Studies |
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Principal Investigator |
河野 信 富山国際大学, 現代社会学部, 准教授 (40470075)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
岩崎 未央 京都大学, iPS細胞研究所, 特定助教 (10722811)
小林 大樹 新潟大学, 医歯学系, 助教 (20448517)
吉沢 明康 京都大学, 薬学研究科, 特定助教 (70551159)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2020)
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| Budget Amount *help |
¥17,680,000 (Direct Cost: ¥13,600,000、Indirect Cost: ¥4,080,000)
Fiscal Year 2021: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2020: ¥7,540,000 (Direct Cost: ¥5,800,000、Indirect Cost: ¥1,740,000)
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| Keywords | プロテオーム / アミノ酸配列決定 / de novo sequencing / 質量分析 / アミノ酸組成分析 |
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| Outline of Research at the Start |
アミノ酸配列を質量分析によって決定する新規de novo sequencing (de novo決定) 法を開発する。de novo決定法は一般的なデータベース検索法と異なりゲノム情報が不要で、アミノ酸を一残基ずつ確定するため精度が高いが、探索空間が膨大なため最適解が得にくい。本申請課題ではペプチドのマススペクトルに加えて、アミノ酸組成などの物性情報も実験的に取得し併用することで大幅に探索空間を限定し、現実的な計算時間でde novo決定を行う手法を開発する。この手法によって、ゲノム情報を用いないタンパク質同定のほか、ゲノムにコードされない抗体可変領域の配列決定などへの応用が期待される。
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