Development of a simultaneous analysis system for multispecies breeding regimes with environmental DNA analysis

• Project/Area Number: 20H03326
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 45040:Ecology and environment-related
• Research Institution: Kobe University
• Principal Investigator: 源 利文 神戸大学, 人間発達環境学研究科, 准教授 (50450656)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 山中 裕樹 龍谷大学, 先端理工学部, 講師 (60455227)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2020)
• Budget Amount: ¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000); Fiscal Year 2021: ¥8,450,000 (Direct Cost: ¥6,500,000、Indirect Cost: ¥1,950,000); Fiscal Year 2020: ¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
• Keywords: 環境DNA / 環境RNA / 繁殖レジーム / メタバーコーディング

Outline of Research at the Start

近年急速に発展する環境DNA分析は、主に種の在不在を検知するツールとして用いられている。本研究ではさらなる発展系として、環境DNA中の核DNA／ミトコンドリアDNAの比（核／Mt比）を利用して水中生物の繁殖レジームを多種同時に把握する手法を確立する。本研究では、（１）種特異的な環境DNAの定量によって核／Mt比から繁殖レジームを推定する手法の開発と野外適用、（２）定量的メタバーコーディングによって、多種の繁殖レジームをまとめて推定する手法の開発と野外適用を行う。また、繁殖期に特異的なRNAマーカーの探索を通じて、（３）環境RNAによって繁殖レジームを推定するさらに新たな手法の基礎的研究を行う。