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Elucidation of source and environmental behavior of antibiotic-resistant bacteria and resistance genes by microbial source tracking

Research Project

Project/Area Number 20H04357
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 64010:Environmental load and risk assessment-related
Research InstitutionKitasato University

Principal Investigator

清 和成  北里大学, 医療衛生学部, 教授 (80324177)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) Amarasiri Mohan  北里大学, 医療衛生学部, 講師 (50815537)
亀井 樹  山梨大学, 大学院総合研究部, 助教 (80792168)
古川 隼士  北里大学, 医療衛生学部, 講師 (90632729)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥18,070,000 (Direct Cost: ¥13,900,000、Indirect Cost: ¥4,170,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2020: ¥10,140,000 (Direct Cost: ¥7,800,000、Indirect Cost: ¥2,340,000)
Keywordsソーストラッキング / 薬剤耐性菌 / 薬剤耐性遺伝子
Outline of Research at the Start

下水処理場へ流入する各種排水、下水処理場流入水、下水処理場放流水、放流先河川の最上流部および放流地点直下、最下流部の水からARBを分離し、一般細菌数との比較からARB存在割合を求めるとともに、ARB分離株の保持するARGsをPCR法によって定性検出する。次いで、PFGE法を用いてARB分離株を遺伝子型に基づいて分類し、発生源を解明するとともに、分離されたARBが自然由来か下水処理水由来であるか評価する。さらに、培養法によってARBを計数、デジタルPCR法によってARGsを定量し、排水ごとの下水処理場へのARBおよびARGsの流入寄与率を推定する。また、下水処理水放流後の河川水中挙動を解明する。

Outline of Annual Research Achievements

近年世界中で問題となっている薬剤耐性菌(ARB)および薬剤耐性遺伝子(ARGs)は、下水処理場がその主要な水環境への排出源の1つとされているが、下水処理場流入水にも、無視できない割合でARBが存在していることが明らかとなっている。また、実際に下水処理場から流出するARBやARGsの環境中での挙動については、ほとんど明らかになっていない。
本研究では、都市下水、畜産排水、農業排水や病院排水を受け入れている下水処理場とその放流先河川を対象に、下水処理場に流入してくるARBやARGsの発生源および下水処理場から流出するARBやARGsの水環境中挙動を明らかにすることで、都市水環境を対象としたARBやARGsの発生源対策ならびにARBやARGsによる公衆衛生上の問題解決に資する基盤データを得ることを目的としている。
初年度は山梨・神奈川両県を流れる相模川流域の6地点から、夏季、秋季、冬季の3回サンプリングを実施する予定であったが、COVID-19の緊急事態宣言により、秋季のみの実施となった。その代わりに神奈川県下の病院排水のサンプリングを毎月実施し、各サンプルから従属栄養細菌を約100株ずつランダムに釣菌し、17種類の薬剤に対する感受性試験を実施した。
相模川では、従属栄養細菌数は下流に向かって増加していくのに対して、薬剤耐性菌数は下流に向かって減少する傾向を示し、その95%以上が2種類以上の抗菌薬に耐性を示す多剤耐性菌であることを明らかにした。また、病院排水では、すべての抗菌薬に対して感受性を示した細菌株はなく、すべての細菌株が2種類以上の抗菌薬に対して耐性を示したこと、11種類の薬剤に対する耐性を示す株も3株検出され、病院排水がARBの重要な排出源の1 つであることを明らかにした。
今後も同様の調査を実施し、現象の普遍性や季節性を明らかにしていく予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

COVID-19の影響により、当初予定していた相模川流域河川水のサンプリングは1回のみとなったが、薬剤耐性菌の主要な排出源の1つと想定される病院排水を当初予定以上にサンプリングでき、詳細な解析を実施することができているため。

Strategy for Future Research Activity

河川水のサンプリングは、緊急事態宣言や学内の移動制限が解除されている期間を最大限活用し、可能な限り当初の予定にあるような季節ごとのサンプリングができるよう準備をしておく。また、病院排水が当初の予定以上に頻回でサンプリングできていることから、フィールドに出られない期間はその詳細解析を行う。また、流域全体としての薬剤耐性菌や薬剤耐性遺伝子の挙動解明が主眼であることから、病院以外の施設(下水処理場や畜産場など)の試料の入手方法についても検討・交渉していくことで、当初目的の達成を図る。

Report

(1 results)
  • 2020 Annual Research Report

Research Products

(2 results)

All 2021

All Presentation (2 results)

  • [Presentation] 病院排水中の薬剤耐性菌の存在実態と耐性プロファイルの調査2021

    • Author(s)
      米本譲、荻野瑞葵、小林由紀子、新井田凪、江田諒太郎、前花祥太郎、Amarasiri Mohan、古川隼士、北里英郎、清和成
    • Organizer
      第55回日本水環境学会年会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 相模川における薬剤耐性菌の存在実態と耐性プロファイルの調査2021

    • Author(s)
      荻野瑞葵、米本譲、小林由紀子、亀井樹、Amarasiri Mohan、古川隼士、清和成
    • Organizer
      第55回日本水環境学会年会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2022-04-19  

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