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Screening of useful duckweed strains and development of dormant state regulation techniques for improving starch productivity in duckweed plants

Research Project

Project/Area Number 20K06342
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 41050:Environmental agriculture-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Ito Shogo  京都大学, 理学研究科, 助教 (60632586)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2022: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Keywords光周性 / 環境応答 / 概日時計 / 休眠 / ウキクサ / バイオマス
Outline of Research at the Start

休眠時にデンプンを高濃度に蓄積するキタグニコウキクサの、休眠誘導を制御するkey因子と休眠制御機構について知見を得ることを目的としている。世界中から採取されたL.t.株の集団を用いて、日長感受性とストレス感受性、デンプン生産能を指標にバイオマス生産性の高い有用株を選抜する。この有用株を用いて、NGSを用いた網羅的な遺伝子発現解析から、休眠を制御する短日性誘導経路とストレス誘導経路の各経路のマスター遺伝子を同定する。分子機能解析には一過的な遺伝子共導入法と生物発光モニタリング系を用いる。さらに安定形質転換技術により、休眠制御遺伝子の分子機能解析を行い、増殖vs休眠の人為的な制御を試みる。

Outline of Final Research Achievements

We have recently found that growing L. turionifera 6619 in short-day conditions induced growth cessation and turion formation. Turions have relatively high starch content and lack the aerenchyma (air space). These features allow turions to overwinter on the bottom in the aquatic habitat. In L. turionifera, it was also found that a plant hormone salicylic acid as well as abscisic acid could induce a dormant state.
Based on the transcriptome analysis during the dormancy induction in L. turionifera, we show several differentially expressed genes (DEGs) that would be involved in its regulation. We focused on one of the DE gene encoding Dof DNA binding domain containing transcription factor (LtDOF) and produced L. turionifera and L. japonica transgenic plants expressing LtDOF by chemical inducible system (XVE system). Transgenic L.t. plants showed the phenotypes of growth cessation, premature senescence with estradiol treatment however L.j. plants did not show such phenotypes.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ウキクサ植物は増殖速度が非常に速く、非食料のバイオマス植物として注目されています。1年あたり最大で100トン/乾燥重量・ヘクタールという驚異的な生産能力を備えている事がわかっています。通常生育時の植物内にはタンパク質が豊富(乾燥重量あたりタンパク質含量約30%)ですが、休眠誘導時にはタンパク質をデンプン系化合物へと変化させます。この変化が特に顕著なのが休眠芽を発達させるキタグニコウキクサです。本研究はウキクサが日長情報を感知し、休眠を誘導する分子機構を解明することを目的としますが、この知見は、バイオマス生産技術へと繋がり、植物を用いた再生エネルギー資源利用による循環型社会の形成に貢献します。

Report

(5 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (36 results)

All 2023 2022 2021 2020 Other

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (26 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 5 results) Remarks (4 results)

  • [Journal Article] A non-cell-autonomous circadian rhythm of bioluminescence reporter activities in individual duckweed cells2023

    • Author(s)
      Watanabe Emiri、Muranaka Tomoaki、Nakamura Shunji、Isoda Minako、Horikawa Yu、Aiso Tsuyoshi、Ito Shogo、Oyama Tokitaka
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: kiad218 Issue: 1 Pages: 677-688

    • DOI

      10.1093/plphys/kiad218

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Interspecific divergence of circadian properties in duckweed plants2022

    • Author(s)
      Isoda Minako、Ito Shogo、Oyama Tokitaka
    • Journal Title

      Plant, Cell & Environment

      Volume: - Issue: 6 Pages: 1942-1953

    • DOI

      10.1111/pce.14297

    • Related Report
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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Circadian-period variation underlies the local adaptation of photoperiodism in the short-day plant <i>Lemna aequinoctialis</i>2022

    • Author(s)
      Muranaka Tomoaki、Ito Shogo、Kudoh Hiroshi、Oyama Tokitaka
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2022.03.09.483716

    • Related Report
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  • [Journal Article] Detection of uncoupled circadian rhythms in individual cells of Lemna minor using a dual-color bioluminescence monitoring system2021

    • Author(s)
      Watanabe Emiri、Isoda Minako、Muranaka Tomoaki、Ito Shogo、Oyama Tokitaka
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: - Issue: 5 Pages: 815-826

    • DOI

      10.1093/pcp/pcab037

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Low nitrogen conditions accelerate flowering by modulating the phosphorylation state of FLOWERING BHLH 4 in <i>Arabidopsis</i>2021

    • Author(s)
      Sanagi Miho、Aoyama Shoki、Kubo Akio、Lu Yu、Sato Yasutake、Ito Shogo、Abe Mitsutomo、Mitsuda Nobutaka、Ohme-Takagi Masaru、Kiba Takatoshi、Nakagami Hirofumi、Rolland Filip、Yamaguchi Junji、Imaizumi Takato、Sato Takeo
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 118 Issue: 19 Pages: 1-12

    • DOI

      10.1073/pnas.2022942118

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] An endogenous basis for synchronisation characteristics of the circadian rhythm in proliferating <i>Lemna minor</i> plants2021

    • Author(s)
      Ueno Kenya、Ito Shogo、Oyama Tokitaka
    • Journal Title

      New Phytologist

      Volume: 233 Issue: 5 Pages: 2203-2215

    • DOI

      10.1111/nph.17925

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  • [Presentation] キタグニコウキクサの光周期依存性の休眠誘導と休眠芽形成時に機能する遺伝子群の解析2023

    • Author(s)
      伊藤 照悟, 小山 時隆
    • Organizer
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    • Author(s)
      Tokitaka Oyama, Shogo Ito
    • Organizer
      Taiwan-Japan Plant Biology
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  • [Presentation] Long term monitoring of growth and turion development of Lemna turionifera colonies revealed the signal perception region for the photoperiodic dormancy establishment2023

    • Author(s)
      伊藤 照悟, 小山 時隆
    • Organizer
      第19回植物縦横無尽の会ワークショップ
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  • [Presentation] Analysis of Genes Expressed during the Flowering and the Dormancy Induction in Duckweeds2023

    • Author(s)
      Shogo Ito, Tokitaka Oyama
    • Organizer
      Plant and animal genome conference PAG30
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  • [Presentation] キタグニコウキクサにおける光周期依存性休眠の誘導に関与する遺伝子群の解析2023

    • Author(s)
      伊藤 照悟、小山 時隆
    • Organizer
      第64回植物生理学会年会
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  • [Presentation] Development of a cryopreservation protocol for a variety of duckweed meristems by the vitrification-cryo-plate method2022

    • Author(s)
      Shogo Ito, Tokitaka Oyama
    • Organizer
      The 6th International Conference on Duckweed Research and Applications
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  • [Presentation] 短日性アオウキクサの花成限界日長が日本で多様化する理由とその分子機構2022

    • Author(s)
      村中 智明、伊藤 照悟、工藤 洋、小山 時隆
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
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  • [Presentation] 植物個体におけるCRISPR/Cas9誘発性の1細胞生物発光レポーター系の構築2022

    • Author(s)
      上野 稜平、上野 稜平、伊藤 照悟、小山 時隆
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
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      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Long-term preservation of duckweed holobiont2022

    • Author(s)
      Shogo Ito
    • Organizer
      1st Joint Symposium on Development of the Duckweed Holobiont Resource Values towards Thailand BCG Economy (Be-HoBiD)
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] キタグニコウキクサの光周期依存性の休眠誘導と休眠芽形成時に機能する遺伝子群の解析2022

    • Author(s)
      伊藤 照悟、小山 時隆
    • Organizer
      第29回時間生物学会学術大会
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    • Invited
  • [Presentation] 植物における同一細胞内の時計と異なる挙動を示す概日リズムの細胞非自律性2022

    • Author(s)
      渡邊 絵美理、村中 智明、中村 駿志、磯田 珠奈子、伊藤 照悟、小山時隆
    • Organizer
      第29回時間生物学会学術大会
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    • Invited
  • [Presentation] アオウキクサ属における長日植物と短日植物の比較トランスクリプトーム2022

    • Author(s)
      村中 智明、伊藤 照悟、 工藤 洋、小山 時隆
    • Organizer
      第29回時間生物学会学術大会
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  • [Presentation] 植物個体におけるCRISPR/Cas9誘発性の1細胞生物発光レポーター系の構築2022

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      上野稜平、伊藤 照悟、小山 時隆
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      第29回時間生物学会学術大会
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  • [Presentation] Photoperiod dependent growth cessation and turion formation in the duckweed Lemna turionifera2021

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      Shogo Ito、Tokitaka Oyama
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      85th Cold Spring Harbor Laboratory Symposium on Quantitative Biology Biological Time Keeping
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  • [Presentation] 局所適応におけるクロノタイプ効果:アオウキクサの開花期多様化からの検証2021

    • Author(s)
      村中 智明, 伊藤 照悟, 工藤 洋, 小山 時隆
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  • [Presentation] ウキクサ植物 Wolffiella hyalina の低分子化合物による花成制御機構の解析2021

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  • [Presentation] 局所適応におけるクロノタイプ効果:短日性アオウキクサの限界日長多様化からの検証2021

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      村中 智明、伊藤 照悟、 工藤 洋、小山 時隆
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  • [Presentation] キタグニコウキクサにおける光周期依存性休眠の誘導と休眠芽形成メカニズム2021

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      伊藤 照悟、小山 時隆
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      第28回時間生物学会学術大会
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      村中 智明、 工藤 洋、 伊藤 照悟、小山 時隆
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      伊藤 照悟、田中 大介、 小山 時隆
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  • [Presentation] 植物個体におけるCRISPR/Cas9 誘発性の1 細胞生物発光レポーター系の構築2021

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      上野 稜平、伊藤 照悟、 小山 時隆
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      磯田 珠奈子、北山七海、伊藤 照悟、小山 時隆
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  • [Presentation] Analysis on the behavior of uncoupled circadian rhythms detected by a dual-color bioluminescence monitoring system in duckweed plant2021

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      渡邊 絵美理、伊藤 照悟、小山 時隆
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  • [Presentation] RNA-seq transcriptome analysis identifies key regulatory genes in growth cessation and dormancy induced by short-day photoperiod in Lemna turionifera2021

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      伊藤 照悟、小山 時隆
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      渡邊 絵美理、伊藤 照悟、小山 時隆
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  • [Remarks] 京都大学大学院理学研究科生物科学専攻植物学系形態統御学分科

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      http://www.biol.sci.kyoto-u.ac.jp/laboratory/292/

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      http://cosmos.bot.kyoto-u.ac.jp/clock/member/shogoito.html

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  • [Remarks] 形態統御学分科・年報(2022年度

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      http://www.biol.sci.kyoto-u.ac.jp/botany/annual/b2_keitai_2022/

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Published: 2020-04-28   Modified: 2025-01-30  

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