胆汁を用いたリキッドバイオプシー研究;エクソソーム解析による胆道疾患の新規解明
Project/Area Number |
20K08291
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 53010:Gastroenterology-related
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Research Institution | Nagoya City University |
Principal Investigator |
吉田 道弘 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 講師 (20636328)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
志村 貴也 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 講師 (90405192)
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Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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Keywords | 胆道癌 / リキッドバイオプシー / miRNA / エクソソーム / 胆汁 / 胆道疾患 |
Outline of Research at the Start |
胆汁リキッドバイオプシー解析は、新規バイオマーカーの解明から将来的には新規治療薬の開発まで期待される。その立ち上げとして、今回はエクソソームに内包され、特異的かつ高濃度に存在しているmiRNAと糖鎖に注目した網羅的解析研究を考案した。多孔質ガラス構造を有しエクソソーム自体を確実かつ簡便に単離捕捉可能な特殊フィルター法を用い、胆汁中エクソソーム内因子のmiRNAと糖鎖に注目した発現解析を行う。血清および組織標本中の発現レベルと比較解析も行い、胆汁解析の特異性を明らかにしたい。癌については細胞・動物を用いた基礎実験での検証も加え、胆道系疾患の新規バイオマーカーの探索を目的とする。
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Outline of Annual Research Achievements |
胆汁中エクソソームをガラスフィルター法で抽出し、エクソソーム内miRNAの解析を行っている。癌と非癌患者の症例を10例ずつ集め、東レの高感度DNAチップ(3D Gene)を用いて網羅的解析を実施。非癌症例と比較し癌症例で有意に発現の高いmiRNAを複数確認し得た。一方、同一患者群での血清サンプルを用いた同じエクソソーム解析では、両群に有意な発現差を認める因子は一つも抽出されなかった。そこで癌および非癌症例をそれぞれ34例ずつ追加して胆汁を用いたValidation解析を3D Geneで行った。最終的に2種類のmiRNA(miR-451a・miR-3619-3p)で再現性のある発現変化を認める事を突き止めた。臨床背景との解析を行うと、miR-451aでは発現と相関のある臨床背景因子は認められなかったが、miR-3619-3p高発現は予後不良因子であることも解明した。 二つのmiRNAについて基礎実験(細胞実験)で発現解析を行った。まず細胞培養液の上澄からフィルター法を用いてエクソソームを捕捉抽出してエクソソーム内miRNAに対してqRT-PCRで解析を行ったところ、正常胆管上皮細胞株と比較し、これらの候補miRNAは胆管癌細胞株の培養液中のエクソソーム内発現量が高い事が確認できた。 ここまでの結果をまとめ論文化しCancer Scienceに採択された。またその内容について、消化器病学会総会・癌学会・JDDW2022で学会報告した。 細胞実験については、miR-3619-3pをターゲットしてmimic, inhibitorを用いて発現制御を行い、機能解析を継続中である。臨床検体を用いた解析については、胆道疾患には癌以外のIgG4関連硬化性胆管炎・原発性硬化性胆管炎といった良性疾患について現在同じ解析方法でmiRNAの発現解析を行っている。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
A.miRNA解析:1)胆汁中miRNA解析:疾患間比較では、胆道癌と総胆管結石を中心とした良性疾患の比較を行い結果を報告してきたが、IgG4SC・PSCについては症例蓄積期間も必要なため解析に時間を要している。胆道癌で得られた知見についてqRT-PCRでの発現定量解析を行っているが、指標となる内因子の条件設定に時間を要している。2)手術標本との比較(癌症例):手術切除された胆道癌症例の腫瘍組織と非腫瘍組織、および良性症例の標本組織からのmiRNA・ターゲット遺伝子・タンパク解析は、貴重な臨床サンプルのため細胞実験でのmiR-3619-3pおよびmiR-451aの機能解析の結果を確認のうえ行うこととしているが、その細胞実験に時間を有しており、今回の期間中に組織検体の発現解析は行えていない。 B.糖鎖解析:ガラスデバイスを用いた胆汁中エクソソームからの抽出の段階で、エクソソーム外の糖鎖の混入が生じてしまうことが判明。いろいろな条件で検証したがこれが結果に大きく影響してしまうため、今回の期間内での解析ではmiRNA解析を優先することとした。
上記とは別に、実臨床におけるコロナ感染症診療の影響で、実験に費やす時間が減っている。研究代表者・研究分担者自体もそれぞれ異なる時期に濃厚接触者さらにはコロナ感染者となり、研究時間が取れない期間が複数回に渡り生じた。
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Strategy for Future Research Activity |
1)胆汁中miRNA解析:IgG4SC・PSCについての解析遂行。胆道癌においてはすでに得られ論文化した網羅的解析の結果を基にしたqRT-PCRでの発現検証の実行。2)細胞実験での機能解析:miRNAのmimic/inhibitorによる機能解析遂行。3)上記で得られた結果を基にした手術標本での発現確認の実行。
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Report
(3 results)
Research Products
(24 results)
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[Journal Article] Use of Endoscopic Scraper and Cell Block Technique as a Replacement for Conventional Brush for Diagnosing Malignant Biliary Strictures2022
Author(s)
Kato A, Kato H, Naitoh I, Hayashi K, Yoshida M, Hori Y, Kachi K, Asano G, Sahashi H, Toyohara T, Kuno K, Kito Y, Takahashi S, Kataoka H.
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Journal Title
Cancers
Volume: 14
Issue: 17
Pages: 4147-4147
DOI
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[Journal Article] Class III β-Tubulin Expression Is of Value in Selecting nab -Paclitaxel and Gemcitabine as First-Line Therapy in Unresectable Pancreatic Cancer2022
Author(s)
Kato A, Naitoh I, Naiki-Ito A, Hayashi K, Okumura F, Fujita Y, Sano H, Nishi Y, Miyabe K, Inoue T, Hirano A, Takada H, Yoshida M, Hori Y, Natsume M, Kato H, Takahashi S, Kataoka H.
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Journal Title
Pancreas
Volume: 51
Issue: 4
Pages: 372-379
DOI
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[Journal Article] Four-Step Classification of Endoscopic Transpapillary Gallbladder Drainage and the Practical Efficacy of Cholangioscopic Assistance.2021
Author(s)
Yoshida M, Naitoh I, Hayashi K, Jinno N, Hori Y, Natsume M, Kato A, Kachi K, Asano G, Atsuta N, Sahashi H, Kataoka H.
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Journal Title
Gut Liver
Volume: -
Issue: 3
Pages: 476-485
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[Journal Article] Autotaxin in ascites promotes peritoneal dissemination in pancreatic cancer.2021
Author(s)
Jinno N, Yoshida M, Hayashi K, Naitoh I, Hori Y, Natsume M, Kato A, Kachi K, Asano G, Atsuta N, Sahashi H, Kataoka H
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Journal Title
Cancer Sci
Volume: 112
Issue: 2
Pages: 668-678
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[Journal Article] One-step versus two-step distal self-expandable metal stent placement: A multicenter prospective randomized trial2020
Author(s)
Shimizu S, Naitoh I, Okumura F, Hirano A, Miyabe K, Nishi Y, Takada H, Haneda K, Anbe K, Yoshida M, Kondo H, Sano H, Hayashi K, Kataoka H.
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Journal Title
J Gastroenterol Hepatol.
Volume: in press
Issue: 7
Pages: 2015-2021
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