血清中cell free DNAを用いた悪性リンパ腫の中枢神経再発リスクの研究
Project/Area Number |
20K16365
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Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Basic Section 50010:Tumor biology-related
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Research Institution | Nagoya City University |
Principal Investigator |
鈴木 智貴 名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(医学), 助教 (80834001)
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Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000)
Fiscal Year 2022: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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Keywords | びまん性大細胞型B細胞リンパ腫 / 中枢神経再発 / 次世代シーケンサー / cell free DNA / NGS |
Outline of Research at the Start |
びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL) 患者の中枢神経(CNS)再発のリスク因子は十分確立されていない。 DLBCLは遺伝子異常のタイプによりサブグループ化可能なことから、特定の遺伝子変異がCNS再発のリスクとなる可能性を推測した。 CNS再発を呈したDLBCL患者の初発時の血清由来のcell free DNA(cfDNA)および腫瘍由来DNAを用いてターゲットシーケンス等により遺伝子変異を検出し、非CNS再発患者のcfDNA由来の遺伝子変異タイプと統計学的に比較する。 これらの解析により、cfDNAを用いた、革新的かつより侵襲の少ないCNS再発リスクの評価方法確立を目指す。
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Outline of Annual Research Achievements |
本研究はびまん性大細胞型B細胞リンパ腫 (DLBCL) 患者の重要な予後不良イベントである中枢神経 (CNS) 再発を予測するための精度の高い因子を討するものである。CNS再発リスク因子として特定の遺伝子異常の関与および、「骨髄中に腫瘍由来の遺伝子異常が検出されること(病理学的に骨髄への腫瘍浸潤を認めない症例においても)」を考慮している。 多施設よりCNS再発したDLBCL患者が合計で47人登録され、国内では最大級のCNS再発DLBCL患者のコホートであると考えられる。47人の臨床病理学的な特徴についての評価を行い、CNS再発後の全生存期間の中央値は16カ月であった。また、予後に影響を与えた臨床的な因子 (performance status不良、70歳以上、リツキシマブの不使用)を見出し、2022年の日本血液学会総会で発表した。 一方で、登録患者 (47人中26人) から収集した腫瘍組織のホルマリン固定検体(FFPE) よりgenomic DNA (gDNA) を抽出し、全エクソンシーケンスによる遺伝子異解析を実施した。その結果、MCDあるいはC5と呼ばれるgenetic subgroupの特徴を有する腫瘍の頻度が、一般的なDLBCL患者集団におけるMCD (C5) の頻度よりも高いことが判明した。さらに、細胞膜の接着に影響を与える可能背がある遺伝子の変異を複数認めており、その意義について検討をさらに行う予定である。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
FFPEから抽出したgDNAを用いて遺伝子変異解析を行ったため、gDNAの質が低いサンプルが存在した。これらにおいても信頼性の高い結果を得るために追加のシーケンスを行ったため時間を要した。腫瘍由来のgDNAを用いて行った全エクソンシーケンスの結果を参考として、各患者の骨髄由来 (腫瘍浸潤の有無に依らず) のgenetic DNAを用いたシーケンスを行う予定である。十分な読み込み深度を確保するためにターゲットシーケンスを行うことを検討しているが、ターゲットとする遺伝子の選定に時間を要している。
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Strategy for Future Research Activity |
細胞接着に関連する遺伝子変異の意義について、既報告との対比を行い、考察を進める。骨髄由来のgDNAを用いた遺伝子変異解析 (ターゲットシーケンス) を着実に進める。
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Report
(3 results)
Research Products
(1 results)