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Genome-wide analysis of DNA methylation in pseudomyxoma peritonei originated from appendiceal cancer

Research Project

Project/Area Number 20K17641
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 55020:Digestive surgery-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Takane Kiyoko  東京大学, 医科学研究所, 助教 (60756112)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords腹膜偽粘液腫 / DNAメチル化 / KRAS / GNAS / オルガノイド / 腹膜偽粘液種 / 大腸癌
Outline of Research at the Start

腹膜偽粘液腫は、腫瘍細胞から分泌されるゼラチン様物質が腹腔内に貯留し、腹部膨満や腹痛などの様々な症状を呈する。100万人に1-2人の稀な疾患であり、5年生存率が30%~50%と報告されているが、患者の大多数は再発を繰り返し、複数回の手術の実施など、患者のQOLは必ずしも高くない。そこで本申請課題では、腹膜偽粘液腫の発生・進展に関わる遺伝子変化を明らかにし、その治療標的遺伝候補を同定する。

Outline of Final Research Achievements

Pseudomyxoma peritonei (PMP) is a disease characterized by progressive accumulation of intraperitoneal mucinous ascites caused by neoplasms in the abdominal cavity. Although the advancement in surgical treatment with intraoperative chemotherapy has improved the survival of patients with PMP, most of the patients need repeated treatment, which is lowering their quality of life. Therefore, the development of effective therapeutic drug(s) is a matter of pressing concern. Genetic analyses and expression profile analyses of PMP have clarified the frequent activation of GNAS and/or KRAS. However, the involvement of global epigenetic alterations in PMPs has not been reported. In this study, we performed genome-wide DNA methylation analysis using 15 appendiceal PMP samples. As a result, we clarified that the 15 PMPs are classified into at least two epigenotypes, unique methylation epigenotype (UME) and normal-like methylation epigenotype (NLME).

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

PMPは稀な腫瘍であるが、比較的早期に腫瘍が進展し、広範な腹膜転移をきたす。膵臓の乳管内乳頭粘液性腫瘍(IPMN)も、高頻度にKRASおよびGNASの変異が認められ、PMPと共通した機序で腫瘍が発生または進展している可能性が高い。このことは、PMPの発がんメカニズム解明と、新たなバイオマーカー、治療標的分子の探索により、がんの転移の抑制や、IPMNや腹膜播種などの治療に役立つ可能性があることを意味している。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (10 results)

  • [Journal Article] Motile sperm domain containing 1 is upregulated by the Wnt/β-catenin signaling pathway in colorectal cancer2022

    • Author(s)
      Horie Chiaki、Zhu Chi、Yamaguchi Kiyoshi、Nakagawa Saya、Isobe Yumiko、Takane Kiyoko、Ikenoue Tsuneo、Ohta Yasunori、Tanaka Yukihisa、Aikou Susumu、Tsurita Giichiro、Ahiko Yuka、Shida Dai、Furukawa Yoichi
    • Journal Title

      Oncology Letters

      Volume: 24 Issue: 2 Pages: 282-282

    • DOI

      10.3892/ol.2022.13402

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification of odontogenic ameloblast associated as a novel target gene of the Wnt/β‐catenin signaling pathway2022

    • Author(s)
      Yamaguchi Kiyoshi、Horie Chiaki、Takane Kiyoko、Ikenoue Tsuneo、Nakagawa Saya、Isobe Yumiko、Ota Yasunori、Ushiku Tetsuo、Tanaka Mariko、Fujishiro Jun、Hoshino Noriko、Arisue Atsuhiro、Nishizuka Satoshi、Aikou Susumu、Shida Dai、Furukawa Yoichi
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 114 Issue: 3 Pages: 948-960

    • DOI

      10.1111/cas.15657

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Application of targeted nanopore sequencing for the screening and determination of structural variants in patients with Lynch syndrome2021

    • Author(s)
      Yamaguchi Kiyoshiら著者24名. Kazuo Tamura 16番目の著者
    • Journal Title

      Journal of Human Genetics

      Volume: 66 Issue: 11 Pages: 1053-1060

    • DOI

      10.1038/s10038-021-00927-9

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Cancer-associated IDH mutations induce Glut1 expression and glucose metabolic disorders through a PI3K/Akt/mTORC1-Hif1α axis.2021

    • Author(s)
      Liu Xun、Yamaguchi Kiyoshi、Takane Kiyoko、Zhu Chi、Hirata Makoto、Hikiba Yoko、Maeda Shin、Furukawa Yoichi、Ikenoue Tsuneo.
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 16 Issue: 9 Pages: 0257090-0257090

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0257090

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] ロングリードシーケンスによるリンチ症候群患者のミスマッチ修復遺伝子の構造異常の解析2022

    • Author(s)
      池上恒雄, 山口貴世志, 笠島理加, 清水英悟, 高根希世子, 山口類, 井元清哉, 宮野悟, 古川洋一
    • Organizer
      日本人類遺伝学会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ポリオウイルス受容体PVRL4はFOSによって転写制御される2022

    • Author(s)
      七宮知之 , 高根希世子, 山口貴世志 , 池上恒雄 , 藤幸知子 , 米田美佐子 , 甲斐知惠子 , 古川洋一
    • Organizer
      分子生物学会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 虫垂原発腹膜偽粘液腫の網羅的DNAメチル化解析2022

    • Author(s)
      蔡庭偉, 高根希世子, 山口貴世志, 池上恒雄, 太田泰徳, 合田良政, 清松知充, 矢野秀朗, 古川洋一
    • Organizer
      日本癌学会学術総会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ポリオウイルス受容体PVRL4はFOSによって転写制御される2022

    • Author(s)
      七宮知之 , 高根希世子, 山口貴世志 , 池上恒雄 , 藤幸知子 , 米田美佐子 , 甲斐知惠子 , 古川洋一
    • Organizer
      日本癌学会学術総会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Genetic analysis of pediatric malignant peritoneal mesothelioma2021

    • Author(s)
      Kiyoko Takane, Tingwei Cai, Kiyoshi Yamaguchi, Tsuneo Ikenoue, Yasunori Ohta, Yoshimasa Gohda, Tomomichi Kiyomatsu, Hideaki Yano, Yoichi Furukawa
    • Organizer
      第80回日本癌学会学術総会
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  • [Presentation] Analysis of genome-wide DNA methylation in pseudomyxoma peritonei originated from appendiceal and ovarian cancer2021

    • Author(s)
      Kiyoko Takane, Kiyoshi Yamaguchi, Tsuneo Ikenoue, Yoshimasa Gohda, Tomomichi Kiyomatsu, Hideaki Yano, Masaki Fukuyo, Motoaki Seki, Atsushi Kaneda, Yoichi Furukawa
    • Organizer
      第80回日本癌学会学術総会
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      2021 Research-status Report
  • [Presentation] PVRL4, a receptor for measles virus, is transcriptionally regulated by FOS2021

    • Author(s)
      Tomoyuki Nanamiya, Kiyoko Takane, Kiyoshi Yamaguchi, Tsuneo Ikenoue, Tomoko Fujiyuki, Misako Yoneda, Chieko Kai, Yoichi Furukawa
    • Organizer
      第80回日本癌学会学術総会
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      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 進行卵巣癌における腹水細胞診の意義2021

    • Author(s)
      松浦 基樹、西村 庸子、玉手 雅人、磯山 響子、寺田 倫子、岩崎 雅宏、磯部 友見子、畠山 晴良、高根 希世子、山口 貴世志、池上 恒雄、古川 洋一
    • Organizer
      第62回 日本婦人科腫瘍学会学術講演会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 子宮体がんスクリーニングにおける子宮内膜液状化細胞診検体を用いた遺伝子解析の有用性2020

    • Author(s)
      松浦 基樹、玉手 雅人、西村 庸子、磯山 響子、寺田 倫子、岩崎 雅宏、磯部 友見子、畠山 晴良、高根 希世子、山口 貴世志、池上 恒雄、古川 洋一、斎藤 豪
    • Organizer
      第52回 日本臨床分子形態学会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 麻疹ウイルス受容体PVRL4はBACH1により転写調節される2020

    • Author(s)
      高根 希世子, 山口 貴世志, 池上 恒雄, 藤幸 知子, 米田 美佐子, 甲斐 知恵子, 古川 洋一
    • Organizer
      第79回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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