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Protein semi-synthesis-based construction of protein library with diversity in post-translational modification

Research Project

Project/Area Number 20K21483
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 47:Pharmaceutical sciences and related fields
Research InstitutionFukuyama University

Principal Investigator

Shigenaga Akira  福山大学, 薬学部, 教授 (10423394)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大高 章  徳島大学, 大学院医歯薬学研究部(薬学域), 教授 (20201973)
伊藤 孝司  徳島大学, 大学院医歯薬学研究部(薬学域), 教授 (00184656)
Project Period (FY) 2020-07-30 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
Fiscal Year 2020: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Keywordsタンパク質半合成 / ネイティブケミカルライゲーション / ペプチドチオエステル / タンパク質化学 / ペプチド化学 / 翻訳後修飾 / タンパク質化学合成 / タンパク質ライブラリ / Native Chemical Ligation
Outline of Research at the Start

近年、タンパク質医薬品が注目を集めています。高活性なタンパク質を探す際、元のタンパク質の構造を少し変えたものをたくさん集めた”ライブラリ”が用いられます。ライブラリの構築では、いかに色々なタンパク質を集めるか、つまり多様性を持たせるかがカギとなります。現在、タンパク質のアミノ酸配列に多様性を持たせることは、遺伝子工学的手法により容易に達成できます。これに対し、翻訳後修飾についての情報は遺伝子に直接記載されていないため、ここに多様性を持たせることは困難を極めます。そこで私たちは、翻訳後修飾部分に多様性を有するタンパク質ライブラリ構築のための方法論の確立に、有機化学者の視点から挑戦します。

Outline of Final Research Achievements

Protein drugs have received widespread attention in recent years. The use of protein libraries facilitates the search for a more active protein drug. The key to building a protein library is how to efficiently create diversity. Diversity in the amino acid sequences of proteins can be easily achieved; however, it is difficult to introduce diversity into the post-translational modification. For this reason, we decided to challenge the establishment of a new protein semi-synthesis method that contributes to the construction of a protein library with diversity in post-translational modifications. As a result, we succeeded in establishing a new protein semi-synthesis method. Furthermore, the mechanism of the key reaction was rationalized by quantum chemical calculations.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

近年、タンパク質医薬品が注目されています。同医薬品の探索では、タンパク質ライブラリが利用可能です。タンパク質ライブラリとは多くのタンパク質を集めたもので、図書館で本を探すようにタンパク質ライブラリから高活性タンパク質を探します。本ライブラリ構築では、いかに多くのタンパク質を用意するか、つまり多様性を持たせるかがカギとなります。タンパク質の多くは、本体と翻訳後修飾に分けられます。多様性を前者に持たせる技術は確立されていますが、後者に持たせるのは困難でした。そこで私たちは、翻訳後修飾部分に多様性を持つタンパク質ライブラリ構築の基盤となる、新たなタンパク質半合成法の確立に挑戦し、成功しました。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2021 2020 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 5 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Sequence-Independent Traceless Method for Preparation of Peptide/Protein Thioesters Using CPaseY-Mediated Hydrazinolysis2020

    • Author(s)
      Ueda Masahiro、Komiya Chiaki、Arii Sayuki、Kusumoto Kohshi、Denda Masaya、Okuhira Keiichiro、Shigenaga Akira、Otaka Akira
    • Journal Title

      Chemical and Pharmaceutical Bulletin

      Volume: 68 Issue: 12 Pages: 1226-1232

    • DOI

      10.1248/cpb.c20-00674

    • NAID

      130007948412

    • ISSN
      0009-2363, 1347-5223
    • Year and Date
      2020-12-01
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Theoretical study on reaction mechanism of phosphate-catalysed N?S acyl transfer of N-sulfanylethylanilide (SEAlide)2020

    • Author(s)
      Shigenaga Akira
    • Journal Title

      Organic & Biomolecular Chemistry

      Volume: 18 Issue: 47 Pages: 9706-9711

    • DOI

      10.1039/d0ob01968b

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Deprotection of S-acetamidomethyl cysteine with copper(ii) and 1,2-aminothiols under aerobic conditions2020

    • Author(s)
      Kobayashi Daishiro、Naruse Naoto、Denda Masaya、Shigenaga Akira、Otaka Akira
    • Journal Title

      Organic & Biomolecular Chemistry

      Volume: 18 Issue: 42 Pages: 8638-8645

    • DOI

      10.1039/d0ob01475c

    • NAID

      120007132278

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] アミド結合の切断にこだわった生命科学研究支援分子の開発2021

    • Author(s)
      重永 章
    • Organizer
      第53回若手ペプチド夏の勉強会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 実務経験を積んだうえで有機化学を学び直す2021

    • Author(s)
      重永 章
    • Organizer
      福山市薬剤師会シリーズ研修会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Development of acyl transfer-based chemical and chemical biology tools for protein science2021

    • Author(s)
      Akira Shigenaga, Masaya Denda, Akira Otaka
    • Organizer
      Pacifichem 2021 (The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2021, Symposium “Design of Functional Proteins, Peptides, and Peptidomimetics”)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] アミド結合切断反応に着目した生命科学研究支援分子の開発2020

    • Author(s)
      重永 章
    • Organizer
      徳島大学大学院医歯薬学研究部・BRIGHT合同公開シンポジウム
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] アミド結合切断反応に着目した生命科学志向型ツールの開発2020

    • Author(s)
      重永 章
    • Organizer
      第2回 生命科学Webセミナー
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Invited
  • [Remarks] 福山大学薬学部 生体有機化学研究室

    • URL

      https://www.fukuyama-u.ac.jp/pharm/pharmacy/labo-list/org_bioorg_chem/

    • Related Report
      2021 Annual Research Report 2020 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-08-03   Modified: 2023-01-30  

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