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部位特異的in vivo光架橋実験によるSecトランスロコンの網羅的相互作用解析

Research Project

Project/Area Number 21657049
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Cell biology
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

森 博幸  京都大学, ウイルス研究所, 准教授 (10243271)

Project Period (FY) 2009 – 2010
Project Status Completed (Fiscal Year 2010)
Budget Amount *help
¥3,100,000 (Direct Cost: ¥3,100,000)
Fiscal Year 2010: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2009: ¥1,600,000 (Direct Cost: ¥1,600,000)
KeywordsSecYEG / SecA ATPase / SecDF / in vivo光架橋 / YfgM / translocon / in vivo光架橋実験 / SecG / トランスロコン / タンパク質膜透過 / SecA ATPse / pベンゾフェニルアラニン / アンバーサプレッション / アジ化ナトリウム
Research Abstract

バクテリアのタンパク質膜透過に関与するSec translocon成因子間の相互作用を網羅的に解析する事を目的として、これら構成因子をターゲットとしたin vivo光架橋実験を進めた。この手法は、生きた細胞内でのタンパク質間の一時的かつ機能的な相互作用をモニター出来る画期的な系として最近多くの成果が報告されつつある。我々はこれまでに、本手法を用いて、モータ因子SecAと膜透過チャネルSecY間の詳細な相互作用を明らかにすると共に、SecGを対象とした解析から、新規膜タンパク質YfgMの存在を見いだしている。本年は、タンパク質膜透過能の昂進に関与するSecDFに着目し、最近等研究室により明らかとなった立体構造情報に基づいて、SecDFの分子表面に位置するアミノ酸残基を光反応性のアミノ酸アナログパラベンゾイルフェニルアラニン(pBPA)に改変した変異型SecDFタンパク質を作製して網羅的な解析を進めている。これまでの所、SecDの6番目の膜貫通領域内にpBPAを導入した際に特異的な架橋複合体が形成できる事を確認している。現在、架橋相手の同定を進めている。

Report

(2 results)
  • 2010 Annual Research Report
  • 2009 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2011 2010 2009

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] Structure and function of a membrane component SecDF that enhances protein export2011

    • Author(s)
      Tsukazaki, Mori, et al.(計12名)
    • Journal Title

      Nature

      Volume: (in press)

    • NAID

      10031146872

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 細菌型Secトランスロコンの構造から明らかとなった蛋白質膜透過装置の構造変化2009

    • Author(s)
      塚崎智也, 森博幸
    • Journal Title

      生物物理 49

      Pages: 288-289

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Journal Article] 立体構造解析からみえてきたSecAによる蛋白質膜透過の分子メカニズム2009

    • Author(s)
      森博幸, 塚崎智也
    • Journal Title

      蛋白質核酸酵素 54

      Pages: 685-695

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Journal Article]2009

    • Author(s)
      Ito K., Mori H.
    • Journal Title

      Bacterial Secreted Proteins in The Sec protein secretion system(Caister Academic Press, Norfolk, UK)

      Pages: 3-22

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Structure, function and evolution of bacterial protein translocation machinery.2010

    • Author(s)
      Mori H., Tsukazaki, T., Akiyama Y., Nureki O., Ito K.
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会ワークショップ「進化からみたタンパク質社会」
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-10
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] 細菌のタンパク質膜透過装置の構造と機能2010

    • Author(s)
      森博幸
    • Organizer
      第4回細菌学若手コロッセウム
    • Place of Presentation
      修善寺
    • Year and Date
      2010-08-26
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] 部位特異的 in vivo 光架橋実験法を用いたSecG近接因子YfgMの同定2010

    • Author(s)
      田中夏子, 小林元, 堂前直, 鈴木健裕, 伊藤維昭, 秋山芳展, 森博幸
    • Organizer
      日本化学会第90春期年会
    • Place of Presentation
      近畿大学 (大阪)
    • Year and Date
      2010-03-29
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Structure and function of bacterial protein translocation machinery2010

    • Author(s)
      森博幸, 塚崎智也, 越前友香, 濡木理, 伊藤維昭
    • Organizer
      第83回日本細菌学会総会W5「細菌のタンパク質分泌系」
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2010-03-27
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Involvement of hydrophobic amino acids in motif IV and anti-parallel beta sheet in translocase activation.2010

    • Author(s)
      Mori.H., Tsukazaki, T., Nureki, O., Ito, K., Akiyama, Y.
    • Organizer
      The 3^<rd> International Symposium on Protein Community
    • Place of Presentation
      Nara
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] バクテリアのタンパク質膜透過装置の構造と機能2009

    • Author(s)
      森博幸, 塚崎智也, 越前友香, 濡木理, 伊藤維昭
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会 シンポジウム「タンパク質膜透過装置の構造とダイナミックな機能」
    • Place of Presentation
      神戸ポートピアホテル
    • Year and Date
      2009-10-21
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Functional dissection of bacterial Sec translocation machinery2009

    • Author(s)
      Mori H., Tsukazaki T., Echizen, Y., Ishitani, R., Nureki, O., Ito, K.
    • Organizer
      International Symposium 'Innovative Nano science of Supermolecular Motor Proteins Working in Biomembranes'
    • Place of Presentation
      芝蘭会館 (京都)
    • Year and Date
      2009-09-08
    • Related Report
      2009 Annual Research Report

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Published: 2009-04-01   Modified: 2016-04-21  

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