• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Microbial Nitrogen Pump: Bacterial semi-labile dissolved organic nitrogen as a nutrient transport pathway in aquatic systems

Research Project

Project/Area Number 21H03584
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 63010:Environmental dynamic analysis-related
Research InstitutionLake Biwa Environmental Research Institute

Principal Investigator

山口 保彦  滋賀県琵琶湖環境科学研究センター, 総合解析部門, 主任研究員 (50726221)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岡崎 友輔  京都大学, 化学研究所, 助教 (40823745)
中野 伸一  京都大学, 生態学研究センター, 教授 (50270723)
早川 和秀  滋賀県琵琶湖環境科学研究センター, 総合解析部門, 部門長 (80291178)
布施 泰朗  京都工芸繊維大学, 分子化学系, 准教授 (90303932)
木庭 啓介  京都大学, 生態学研究センター, 教授 (90311745)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥17,290,000 (Direct Cost: ¥13,300,000、Indirect Cost: ¥3,990,000)
Fiscal Year 2023: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000)
Fiscal Year 2022: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2021: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000)
Keywords溶存有機物 / 窒素循環 / アミノ酸 / 細菌 / 窒素同位体
Outline of Research at the Start

貧栄養水域の表層では、生物生産による栄養塩除去量に比べて、既知の経路の栄養塩供給量が過小である現象が観測され、「不均衡な栄養塩収支」問題として長年の謎が残る。我々は最近、「従属栄養細菌が生産した溶存有機窒素(DON)が、貧栄養水域の表層に大量に存在し、ゆっくりと分解され、窒素栄養塩の重要な供給源として機能する」という、従来未知だった栄養塩供給経路「微生物窒素ポンプ」の可能性を独自に見出した。本研究は、琵琶湖をフィールドとして、貧栄養水域における細菌由来DONの時空間分布、生成・分解プロセスを解明することで、新概念である微生物窒素ポンプの実証を目指す。

Outline of Annual Research Achievements

2022年度は、以下の3項目について、下記の通り、研究を進めた。
(1) 細菌由来DONの時空間分布:琵琶湖の天然湖水中の溶存有機物(DOM)について、調査船「びわかぜ」を用いて、月1回程度の定点深度別試料(北湖17B地点の水深5m,60m)を採取した。DOC・DON濃度、DOM三次元蛍光、DOM分子サイズ分布(SEC-TOC)等の分析を進めた。LC-FLDを用いたD-アミノ酸バイオマーカーの分析法について、加水分解時のブランク低減、LC分析条件等の改良を検討した。限外濾過、固相抽出等を用いたDOM分子量分画・濃縮を実施した。熱分解GC-MS等で濃縮DOM試料の分析を進めた。
(2) 細菌由来DONの生成プロセス:D-アミノ酸およびアミノ糖バイオマーカーをGC-MSで分析するため、試料前処理、誘導体化、GC分析等の条件を検討した。琵琶湖湖水細菌にグルコースを基質として添加してDOMを生成させるマイクロコスム実験の試料採取を継続し、DOC・DON濃度、DOM三次元蛍光、DOM分子サイズ分布(SEC-TOC)等の分析を進めた。栄養環境が異なる植物プランクトンによるDOM生産の変化を検討するため、緑藻1種、シアノバクテリア2種について、室内培養系を確立した。このことにより、窒素制限、リン制限などの栄養環境を変化させた環境条件において、各植物プランクトン種の増殖総量、増殖速度、DOM生産がどのように変化するのか検討する体制が整った。
(3) 細菌由来DONの分解プロセス:琵琶湖の表層湖水有機物の長期分解実験について、濾過試料を採取し、DOC・DON濃度、DOM三次元蛍光、SEC-TOC、細菌群集組成(16Sメタバーコーディング)等の分析を進めた。発現遺伝子解析に向けては、重要なDON分解関連遺伝子の絞り込みを進めた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

天然湖水および各種実験の試料採取、分析法・解析法の開発・検討も、それぞれ一定進展があったが、研究代表者の育児休業の取得等により、研究の進捗に遅れが生じた。また、湖水DOMのD-アミノ酸バイオマーカーの分析において、試料加水分解時のブランクが想定以上に高く、ブランク低減のための条件検討に時間を要した。

Strategy for Future Research Activity

2023年度は、以下の3項目について研究を進める。
(1) 細菌由来DONの時空間分布:琵琶湖の天然湖水中の溶存有機物(DOM)について、調査船「びわかぜ」を用いた採取を継続する。LC-FLDを用いたD-アミノ酸バイオマーカーの分析法について、気相加水分解等を用いたブランク低減を実施する。採取した湖水DOM試料の分析を進める。DOMの分子量分画や各種化学組成分析を進める。
(2) 細菌由来DONの生成プロセス:D-アミノ酸、アミノ糖のトレーサーレベル15N/14N比迅速分析法の開発を進める。湖水細菌によるDOM生成マイクロコスム実験の試料採取を継続し、各種化学分析とともに、細菌数、細菌群集組成、細菌生産速度等の解析を進める。より自然生態系に近い実験系の実現ため、植物プランクトンの単離株培養において連続培養系を確立する可能性を探る。
(3) 細菌由来DONの分解プロセス:有機物長期分解実験の試料について、D-アミノ酸バイオマーカー分析を進めるとともに、細菌群集組成等の解析も継続する。琵琶湖湖水の天然細菌メタトランスクリプトームの月別変動データを解析し、DON分解関連遺伝子の発現の変動を明らかにする。

Report

(2 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (26 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (23 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] チェコ科学アカデミー・水生生物研究所(チェコ)

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Journal Article] Long-Read-Resolved, Ecosystem-Wide Exploration of Nucleotide and Structural Microdiversity of Lake Bacterioplankton Genomes2022

    • Author(s)
      Okazaki Yusuke、Nakano Shin-ichi、Toyoda Atsushi、Tamaki Hideyuki
    • Journal Title

      mSystems

      Volume: 7 Issue: 4 Pages: 1-16

    • DOI

      10.1128/msystems.00433-22

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The crucial influence of trophic status on the relative requirement of nitrogen to phosphorus for phytoplankton growth2022

    • Author(s)
      Jiang Mengqi、Nakano Shin-ichi
    • Journal Title

      Water Research

      Volume: 222 Pages: 118868-118868

    • DOI

      10.1016/j.watres.2022.118868

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 波長分散型蛍光X分析法による琵琶湖北湖における懸濁態物質の特性解析2023

    • Author(s)
      藤原茉那, 布施泰朗, 早川和秀, 山口保彦
    • Organizer
      日本陸水学会近畿支部会第34回研究発表会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 琵琶湖北湖底質及び湖水中化学特性が及ぼす底泥酸素消費速度への影響2023

    • Author(s)
      山口美結, 布施泰朗, 山口保彦, 早川和秀
    • Organizer
      日本陸水学会近畿支部会第34回研究発表会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 分子サイズを鍵にして水圏溶存有機物の動態と物質循環的役割を再考する2022

    • Author(s)
      山口保彦
    • Organizer
      第336回京都大学生態研セミナー
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 湖深水層における高分子溶存有機物の隠れた循環の可能性2022

    • Author(s)
      山口保彦, 岡﨑友輔, 霜鳥孝一, 今井章雄, 早川和秀
    • Organizer
      日本陸水学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 膜ろ過法による湖沼における溶存有機物の分画の新たな展開2022

    • Author(s)
      早川和秀, 山口保彦, 中野伸一, 霜鳥孝一, 今井章雄, 武井直子, Renhui Li, Fuhong Sun,, Fengchang Wu
    • Organizer
      日本陸水学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 発生ガスMS法及び熱分解GCMS法による湖内有機成分解析2022

    • Author(s)
      百合藤桃加,鵜野心歌, 早川和秀, 山口保彦, 布施泰朗
    • Organizer
      日本陸水学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 波長分散型蛍光X 分析法による琵琶湖北湖深層域における懸濁態物質中化学成分の動態解析2022

    • Author(s)
      藤原茉那, 布施泰朗, 早川和秀, 山口保彦
    • Organizer
      日本陸水学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 琵琶湖湖底環境中における難分解及び準難分解性物質の特性解析2022

    • Author(s)
      百合藤桃加, 布施泰朗, 山口保彦, 早川和秀
    • Organizer
      日本腐植物質学会第38回講演会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] “湖の微生物生態系”を対象としたゲノム・多型・遺伝子発現の網羅的比較解析2022

    • Author(s)
      岡崎友輔, 中野伸一, 豊田敦, 玉木秀幸
    • Organizer
      日本微生物生態学会第35回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 湖沼深水層の細菌の生態学2022

    • Author(s)
      岡崎友輔, 中野伸一
    • Organizer
      日本陸水学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Long-read-resolved, ecosystem-wide exploration of nucleotide and structural microdiversity of lake bacterioplankton genomes2022

    • Author(s)
      Okazaki Y, Nakano S, Toyoda A, Tamaki H.
    • Organizer
      International 18th International Symposium on Microbial Ecology (ISME18)
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 蛍光X線分析法による琵琶湖におけるリン含有粒子状物質の迅速動態解析2022

    • Author(s)
      藤原茉那, 布施泰朗, 山口保彦, 早川和秀
    • Organizer
      日本陸水学会近畿支部会第33回研究発表会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 琵琶湖底質の化学特性が及ぼす底泥酸素消費速度への影響2022

    • Author(s)
      山口美結, 布施泰朗, 山口保彦, 早川和秀
    • Organizer
      日本陸水学会近畿支部会第33回研究発表会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 湖と河川における溶存有機物の分子サイズ別の生分解速度2021

    • Author(s)
      山口保彦, 霜鳥孝一, 今井章雄, 岡崎友輔, 尾原禎幸, 中村光穂, 七里将一, 岡本高弘, 早川和秀
    • Organizer
      日本地球惑星科学連合2021年大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Biodegradation kinetics and molecular-size distribution of freshwater dissolved organic matter during long-term incubations2021

    • Author(s)
      Yamaguchi, Y. T., Shimotori, K., Imai, A., Okazaki, Y., Ohara, T., Nakamura, M., Hichiri, S., Okamoto, T., and Hayakawa K.
    • Organizer
      ASLO 2021 Aquatic Sciences Meeting
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Biodegradation kinetics of different molecular-size classes of freshwater dissolved organic matter during long-term incubations2021

    • Author(s)
      Yamaguchi, Y. T., Shimotori, K., Imai, A., Okazaki, Y., Ohara, T., Nakamura, M., Hichiri, S., Okamoto, T., and Hayakawa K.
    • Organizer
      SIL 2021: 35th Congress of the International Society of Limnology
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] D-アミノ酸濃度への非生物的ラセミ化効果を補正して環境有機物中の細菌由来有機物寄与度を推定する手法2021

    • Author(s)
      山口保彦
    • Organizer
      2021年度日本地球化学会第68回年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 琵琶湖の水質と生態系の保全にかかる有機物循環の解析:溶存有機物の分子サイズ別分解速度と湖内物質循環への寄与2021

    • Author(s)
      山口保彦, 霜鳥孝一, 今井章雄, 岡崎友輔, 尾原禎幸, 中村光穂, 七里将一, 岡本高弘, 早川和秀
    • Organizer
      2021年度日本腐植物質学会第37回講演会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 水圏溶存有機物のサイズ反応性連続体モデルを再考する2021

    • Author(s)
      山口保彦
    • Organizer
      第38回有機地球化学シンポジウム
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Ecogenomics of bacteria and viruses in the water column of Lake Biwa2021

    • Author(s)
      Okazaki, Y.
    • Organizer
      SIL 2021: 35th Congress of the International Society of Limnology
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ロングリード解析で拓くメタゲノムビニングの限界と環境細菌ゲノムの微小多様性2021

    • Author(s)
      岡崎友輔, 中野伸一, 豊田敦, 玉木秀幸
    • Organizer
      日本微生物生態学会第34回大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Multi Shot-Pyrolizer GC/MSを用いた琵琶湖由来フルボ酸の化学特性解析2021

    • Author(s)
      百合藤桃加, 早川和秀, 山口保彦, 木田森丸, 藤嶽暢英, 布施泰朗
    • Organizer
      日本陸水学会第85回大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Multi Shot-Pyrolizer GC/MSを用いた琵琶湖底質中有機成分の特性解析2021

    • Author(s)
      井上和樹, 早川和秀, 山口保彦, 布施泰朗
    • Organizer
      日本陸水学会第85回大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi