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Structural biology of GC-A receptor - Mechanism underlying peptide recognition and intramolecular signal transduction

Research Project

Project/Area Number 21K06044
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 43020:Structural biochemistry-related
Research InstitutionUniversity of Shizuoka (2023)
Juntendo University (2021-2022)

Principal Investigator

Kodama Masami  静岡県立大学, 薬学部, 助教 (30512248)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小川 治夫  京都大学, 薬学研究科, 准教授 (40292726)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
KeywordsGC受容体 / ナトリウム利尿ペプチド / グアニル酸シクラーゼ受容体 / GCase受容体
Outline of Research at the Start

グアニル酸シクラーゼ(GCase)受容体とリガンドであるナトリウム利尿ペプチド(NP)によって構成されるNP系は、血圧・体液バランスの維持に不可欠である。申請者らは二量体GCase受容体の細胞外リガンド結合(LB)ドメインにNPが結合すると、LBドメインが旋回することを明らかにし、この旋回運動こそが細胞内GCaseドメインの活性化を惹起するカギであると考えている。本研究では、旋回運動に主眼を置いてGCase受容体の構造解析を行い、GCase受容体が①リガンドを認識する機構と②結合シグナルを膜内に伝達し、GCaseドメインを活性化する機構を明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

This study investigated the mechanism underlying guanylyl cyclase-A (GC-A)-dependent peptide recognition through the determination of the crystal structures of the GC-A extracellular ligand-binding (LB) domain complexed with full-length atrial natriuretic peptide (ANP), truncated mutants of ANP, and dendroaspis natriuretic peptide (DNP). The bound peptides possessed pseudo-two-fold symmetry, despite the lack of two-fold symmetry in the primary sequences, which enabled the tight coupling of the peptide to the receptor, and evidently contributes to guanylyl cyclase activity. The binding of DNP to the GC-A was essentially identical to that of ANP; however, the affinity of DNP for GC-A was higher than that of ANP owing to the additional interactions between distinctive sequences in the DNP and GC-A. Consequently, our findings provide valuable insights that can be applied to the development of novel agonists for the treatment of various human diseases.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

GCase・ANP系は血圧・体液バランスの維持に不可欠で、急性心不全治療薬として広く臨床で利用されているにも関わらず、構造学的基盤の解析が遅れてきた。これは点対称の二量体GCaseの中心にANPが疑似対称性を獲得して結合するという構造が、構造決定を阻んできたためだが、この難問を我々は独自の技術を用いて克服した。GCase受容体の活性化はLBドメインの旋回に因るが、このような様式で活性化する受容体は他に報告例がなく、学術的に意義深い。ANPには血中半減期が短いという致命的な問題があり、DNPをはじめ、これに代わる医薬品の開発は急務である。本研究で得た知見は、医学的重要性も極めて高い。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] Structural insight into hormone recognition by the natriuretic peptide receptor-A2024

    • Author(s)
      Haruo Ogawa, Masami Kodama
    • Journal Title

      The FEBS Journal

      Volume: 04 March 2024 Issue: 10 Pages: 114-114

    • DOI

      10.1111/febs.17104

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] ナトリウム利尿ペプチド受容体の基質認識とその活性化機構2021

    • Author(s)
      小川 治夫、児玉 昌美
    • Journal Title

      循環器内科

      Volume: 89 Pages: 454-462

    • NAID

      40022569004

    • Related Report
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  • [Presentation] クライオ電顕による一回膜貫通型受容体NPR-Bの機能構造解析2023

    • Author(s)
      近藤瞳、児玉昌美、加藤博章、小川治夫
    • Organizer
      第44回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Cryo-EMによる立体構造から明らかになったGCase受容体の基質識別機構2023

    • Author(s)
      近藤瞳、児玉昌美、加藤博章、小川治夫
    • Organizer
      第96回日本生化学会大会
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      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Cryo-EMを用いた単粒子解析法によるhuman GC-B受容体細胞外ドメインの構造解析2022

    • Author(s)
      近藤 瞳、美濃 拓実、児玉 昌美、加藤 博章、小川 治夫
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
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  • [Presentation] Gunanylate Cyclase受容体の基質識別機構の解析2022

    • Author(s)
      美濃 拓実、近藤 瞳、児玉 昌美、加藤 博章、小川 治夫
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
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  • [Presentation] クライオ電子顕微鏡によるANP受容体細胞外ドメインの構造解析2021

    • Author(s)
      小川 治夫、美濃 拓実、近藤 瞳、児玉 昌美
    • Organizer
      第25回日本心血管内分泌代謝学会学術総会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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