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Using terpenes as a key to unlock "Black box" of microbial interactions in subseafloor

Research Project

Project/Area Number 21K06336
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 45040:Ecology and environment-related
Research InstitutionKochi University

Principal Investigator

Ulanova Dana  高知大学, 教育研究部総合科学系複合領域科学部門, 講師 (70610129)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 諸野 祐樹  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 超先鋭研究開発部門(高知コア研究所), 上席研究員 (30421845)
若松 泰介  高知大学, 教育研究部総合科学系生命環境医学部門, 准教授 (60597938)
尾仲 宏康  学習院大学, 理学部, 教授 (80315829)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywordsテルペン / 微生物 / 相互作用
Outline of Research at the Start

微生物は陸上及び水圏などの様々な環境に豊富に存在しているが、彼らは必ずしも単独で生活をしているわけでなく、様々な微生物や動植物と相互作用を取りながら生息している。しかし、海底下の微生物間相互作用については、不明な点が多い。本研究では、陸上・海洋微生物間の相互作用に重要な役割を持つテルペン系天然物を基軸に、海底下微生物に生産されたテルペンの同定とその作用の解明を行い、海底下微生物間相互作用に関しての知見を得ることを目的とする。

Outline of Annual Research Achievements

微生物は陸上及び水圏などの様々な環境に豊富に存在しているが、彼らは必ずしも単独で生活をしているわけでなく、様々な微生物や動植物と相互作用を取りながら生息している。しかし、海底下の微生物間相互作用については、不明な点が多い。本研究では、陸上・海洋微生物間の相互作用に重要な役割を持つテルペン系天然物(微生物の産物)を基軸に、海底下微生物に生産されたテルペンの同定とその作用の調査を行い、海底下微生物間相互作用に関しての知見を得ることを目的とする。
昨年度には、本研究に確立した分析手法の効率(揮発性化合物の回収・分析の効率)を調べた。本年度には、実験データを解析し、回収・分析法による揮発性化合物の測定結果が異なると示唆した。現在、データまとめを行っている。
更に、海底下堆積物由来DNAライブラリーを用い、テルペン系天然物により海底下細菌の遺伝子発現誘導を解析したが、発現誘導が検出できなかった。検出できなかった理由は①本サンプルにテルペンにより誘導される遺伝子が存在していない、または②DNAライブラリーには今回使用した実験条件が合わない、であると考えている。現在、新たな実験条件が検討中である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

誘導発現スクリーニング法を用い、テルペン系天然物による海底下微生物における遺伝子の発現誘導をできなかった。

Strategy for Future Research Activity

誘導発現スクリーニング法の条件を検討し、テルペン系天然物による海底下微生物における遺伝子の発現誘導実験を続ける。確立した培養・産物採取・分析手法による海底下微生物の揮発性有機化合物の調査を続ける。
また、揮発性有機化合物の回収・分析法に関するデータをまとめ、学術論文原稿を執筆する。

Report

(3 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] オランド生態学研究所(オランダ)

    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] オランド生態学研究所(オランダ)

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  • [Int'l Joint Research] オランド生態学研究所(オランダ)

    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Journal Article] Volatile sensation: The chemical ecology of the earthy odorant geosmin2023

    • Author(s)
      Garbeva Paolina、Avalos Mariana、Ulanova Dana、van Wezel Gilles P.、Dickschat Jeroen S.
    • Journal Title

      Environmental Microbiology

      Volume: - Issue: 9 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1111/1462-2920.16381

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Terpene Synthase Gene Amplicons from Subseafloor Sediment2023

    • Author(s)
      Schmidt Ruth L.、Hoshino Tatsuhiko、Morono Yuki、Tremblay Julien、Ulanova Dana
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 12 Issue: 2

    • DOI

      10.1128/mra.01037-22

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Draft Genome Sequence of <i>Streptomyces</i> sp. Strain G-5, Isolated from Marine Sponge, Kochi Prefecture, Japan2023

    • Author(s)
      Matsubara Yuta、Sakurai Tetsuya、Ulanova Dana
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 12 Issue: 1

    • DOI

      10.1128/mra.01054-22

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Biosynthesis, evolution and ecology of microbial terpenoids2022

    • Author(s)
      Avalos Mariana、Garbeva Paolina、Vader Lisa、van Wezel Gilles P.、Dickschat Jeroen S.、Ulanova Dana
    • Journal Title

      Natural Product Reports

      Volume: 39 Issue: 2 Pages: 249-272

    • DOI

      10.1039/d1np00047k

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Frequency and diversity of chemical interactions in marine invertebrate-derived bacteria2023

    • Author(s)
      Ulanova D., Matsubara Y. Sakurai T.
    • Organizer
      The 36th JSME & The 13th ASME conference
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The suppression of antibacterial activity in co-cultures of marine bacteria2023

    • Author(s)
      Hirano A, Ulanova D
    • Organizer
      JSBBA KANSAI 10th Student Forum
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Marine actinomycetes from near-shore to subseafloor2022

    • Author(s)
      Ulanova Dana
    • Organizer
      NWO-JSPS Joint Seminar
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Book] Biology, application and isolation of terrestrial and marine actinobacteria、4次元統合黒潮圏資源学2022

    • Author(s)
      Ulanova Dana
    • Total Pages
      225
    • Publisher
      中島出版
    • ISBN
      9784904191170
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.cc.kochi-u.ac.jp/~ulanova/

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Remarks] http://www.cc.kochi-u.ac.jp/~ulanova/

    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

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