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Identification of novel susceptibility genes and establishment of VUS risk assessment approach in Japanese familial breast cancer

Research Project

Project/Area Number 21K07125
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 50010:Tumor biology-related
Research InstitutionNational Institutes of Biomedical Innovation, Health and Nutrition (2023)
The University of Tokushima (2021-2022)

Principal Investigator

Matsushita Yosuke  国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 創薬デザイン研究センター, 研究員 (70634450)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords乳がん / 家族性乳がん / VUS / 次世代シーケンサー
Outline of Research at the Start

家族性乳がんは全乳がん患者の約15%と推定されており, 原因遺伝子として, DNA損傷の相同組み替え修復に重要なBRCA1/2が同定されている. しかしながら原因遺伝子が不明な症例も存在することから, それらの解明と新たな治療戦略が課題である. 本研究では, WES解析を通じて絞り込みに成功した遺伝子の分子機構を解明することで, 新規感受性遺伝子の同定へ繋げる. また, 既知リスク遺伝子であるBRCA1/2やその他DNA修復に関連する遺伝子のVUSを評価することで, 遺伝性乳がんのリスク予測や新たな診断法開発へ寄与することを目的とする.

Outline of Final Research Achievements

In this study, we analyzed the risk prediction and the function of each gene in cancer through whole exome analysis of the germline of 84 individuals from 24 families with familial breast cancer, and succeeded in narrowing down the candidate genes to six. Among these, functional analysis was conducted on a gene (GeneA) that has been reported to be associated with carcinogenesis in other cancers, and its potential as a novel susceptibility gene was evaluated.
In addition, with the recent increase in NGS analysis, the interpretation of genetic variants of unknown significance (VUS) has become an issue. In this study, we evaluated VUS in BRCA1 and BARD1 by establishing an analytical approach appropriate for the function of the gene as well as its homologous recombination repair ability.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

家族性乳がんの原因遺伝子として、DNA損傷時の相同組換え修復に重要なBRCA1/2が同定されているが、不明な症例も存在することから、さらなる解明と新たな治療戦略が必要である。一方、近年の急速な次世代シーケンサー解析の普及のため、リスク不明な遺伝子変異 (VUS) の医学的意義が問題となっている。
本研究では新たな易罹患性遺伝子の同定が期待されるだけでなく、VUSの機能評価によるリスク予測も行うことで、新たな診断法確立にも寄与すると考えられることから、その社会的意義と貢献度は大きいと考えられる.

Report

(3 results)
  • 2023 Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2022 2021

All Presentation (3 results)

  • [Presentation] Whole-exome sequencing for the identification of Japanese familial breast cancer susceptibility genes2022

    • Author(s)
      Abdullah S. Ili, Yosuke Matsushita, Yasuko Takahashi, Masato Komatsu, Kazuma Kiyotani, Yasuo Miyoshi, Junko Honda, Shozo Ohsumi, Mitsunori Sasa and Toyomasa Katagiri
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Identification and characterization of novel susceptibility genes in hereditary Japanese familial breast cancer2021

    • Author(s)
      Ili Syazwana Abdullah, Yosuke Matsushita, Yasuko Takahashi, Masato Komatsu, Kazuma Kiyotani, Yasuo Miyoshi, Junko Honda, Shozo Ohsumi, Mitsunori Sasa, Toyomasa Katagiri
    • Organizer
      第80回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 日本人家族性乳癌家系の新規感受性遺伝子の解析2021

    • Author(s)
      松下洋輔・Ili Syazwana Abdullah・高橋定子・小松正人・清谷一馬・吉丸哲郎・三好康雄・本田純子・紺谷桂一・大住省三・笹三徳・片桐豊雅
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第66回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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