| Project/Area Number |
21K07997
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 53010:Gastroenterology-related
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| Research Institution | Tokyo Medical and Dental University (2023)
National Center for Global Health and Medicine (2021-2022) |
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Principal Investigator |
Nishida Nao 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 准教授 (50456109)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
大橋 順 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (80301141)
吉住 朋晴 九州大学, 医学研究院, 教授 (80363373)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2023: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
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| Keywords | ターゲットキャプチャーシークエンシング / B型肝炎 / 体細胞変異 / ターゲットキャプチャーシークエンス / hepatocellular carcinoma / hepatitis B virus / 次世代シークエンサー / NGS / HCC / HBV / 肝がん / ドライバー変異 / PRS |
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| Outline of Research at the Start |
肝がん患者由来の肝細胞がん組織試料を対象としたがんゲノム解析を実施し、（1）肝がんドライバー変異の同定、（2）肝がんドライバー変異の高感度検出系の開発、（3）肝発がんリスクを推定するPRS（Polygenic Risk Score）モデルの構築、を行う。リキッドバイオプシーや肝生検試料の中に微量に存在する肝がんドライバー変異を高感度かつ高精度に検出することが可能となれば、B型慢性肝炎患者の中で肝がんを発症するリスクの高い患者を囲い込むことで、適切な治療や投薬を行うことが可能になると期待される。
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| Outline of Final Research Achievements |
The cancer genome analysis pipeline for detecting the mutation which existed in the liver cancer tissue at the low frequency was constructed. Targeted capture sequencing was performed on DNA extracted from 182 liver cancer tissue samples collected during the study period, and low-frequency mutations are currently being analyzed.
Liver tissue samples of all 672 hepatitis B patients were newly collected from collaborating institutes, and a model was constructed to predict the number of days until liver cancer developed. ROC analysis using cumulative probability of developing liver cancer (One year, three years from now.) showed that the model including 4 items (Blood test Age, sex, presence/absence of Log10AFP, HLA-A*33:03) had AUC=0.862 and 0.863, respectively.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本研究において、ディープシークエンスにより肝がんドライバー変異を高感度に検出する測定系を開発した。リキッドバイオプシーや肝生検試料の中に微量に存在する肝がんドライバー変異を高感度かつ高精度に検出することが可能となれば、B型慢性肝炎患者の中で肝がんを発症するリスクの高い患者を囲い込むことが可能となる。治療が必要な患者を選択することで適切な治療や投薬を行うことが可能になると期待される。
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